RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeastyeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC3YJL059W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-JR1P47098 1755 aa8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-ER1Q03612 1755 aa8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-GR2Q12269 1755 aa8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-OLQ12273 1755 aa8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W NUP170P38181 1502 aa8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W KEX1P09620 729 aa8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W MPH3P0CE00 602 aa8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W KTR1P27810 393 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
YHC3YJL059W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
YHC3YJL059W SOL3P38858 249 aa8.8□□□□□ -1
YHC3YJL059W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data8.8□□□□□ -1not detected
YHC3YJL059W STM1P39015 273 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
YHC3YJL059W YGR273CP53329 174 aa8.8□□□□□ -1
YHC3YJL059W NTE1Q04958 1679 aa8.79□□□□□ -1
YHC3YJL059W SEC20P28791 383 aa8.79□□□□□ -1
YHC3YJL059W RTG2P32608 588 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
YHC3YJL059W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data8.79□□□□□ -1not detected
YHC3YJL059W CST6P40535 587 aa8.79□□□□□ -1
YHC3YJL059W MID1P41821 548 aa8.79□□□□□ -1
YHC3YJL059W SPT23P35210 1082 aa8.78□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY2B-BQ12491 1770 aa8.78□□□□□ -1
YHC3YJL059W SVF1Q05515 481 aa8.77□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W CLB5P30283 435 aa8.76□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W TOM20P35180 183 aa8.76□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W CSE4P36012 229 aa8.76□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W RRP14P36080 434 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W ORC6P38826 435 aa8.76□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W PEX29Q03370 554 aa8.76□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W IPL1P38991 367 aa8.75□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W MDG1P53885 366 aa8.75□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W UBX5Q06682 500 aa8.75□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W BIO2P32451 375 aa8.74□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W ALD2P47771 506 aa8.74□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W RNH70P53331 553 aa8.74□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W MNN4P36044 1178 aa8.73□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W TPO2P53283 614 aa8.72□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W HAP5Q02516 242 aa8.72□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W SSN2P38931 1420 aa8.71□□□□□ -1.01
YHC3YJL059W DPS1P04802 557 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W RGR1P19263 1082 aa8.71□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W FPR3P38911 411 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W HST2P53686 357 aa8.71□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W YML083CQ04526 418 aa8.71□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W PPG1P32838 368 aa8.7□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W ILV3P39522 585 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W BNI4P53858 892 aa8.7□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W YNL108CP53929 270 aa8.7□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W PDR1P12383 1068 aa8.69□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W PUP1P25043 261 aa8.69□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W SIS2P36024 562 aa8.69□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W YOL098CQ12496 1037 aa8.69□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W YMR196WQ04336 1088 aa8.68□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W RAD59Q12223 238 aa8.68□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W TY1B-DR3Q99231 1755 aa8.68□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W SUP45P12385 437 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W SPP41P38904 1435 aa8.67□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data8.67□□□□□ -1.02not detected
YHC3YJL059W FPK1P53739 893 aa8.67□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W MMP1Q12372 583 aa8.67□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W TSR4P25040 408 aa8.66□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W MVP1P40959 511 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W NIS1P53939 407 aa8.66□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W DOP1Q03921 1698 aa8.65□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W POL32P47110 350 aa8.65□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W YBL113CQ7M4S9 792 aa8.65□□□□□ -1.02
YHC3YJL059W SPO14P36126 1683 aa8.65□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W MPC54Q08550 464 aa8.64□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W PTC2P39966 464 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W TRM3Q07527 1436 aa8.62□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W ESS1P22696 170 aa8.61□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W TSC11P40061 1430 aa8.61□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W TY1B-ER2Q03619 1755 aa8.61□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W TY1B-MR1Q04214 1755 aa8.61□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W TY1B-NL1Q12112 1755 aa8.61□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W TY1B-GR1Q12141 1755 aa8.61□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W TY1B-BLQ12490 1755 aa8.61□□□□□ -1.03
YHC3YJL059W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.7 ms