RNA–Protein interactions for RNA: YJL050W

MTR4, Transcript of ATP-dependent 3'-5' RNA helicase of the DExD/H family, yeast

Gene MTR4, Length 3,222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR4	YJL050W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MTR4	YJL050W	MSH1	P25846	959 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTR4	YJL050W	ENV11	P53246	860 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTR4	YJL050W	MED8	P38304	223 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTR4	YJL050W	POL32	P47110	350 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MTR4	YJL050W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	LCD1	Q04377	747 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	LYS2	P07702	1392 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	YPP1	P46951	817 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	BNR1	P40450	1375 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	TCD1	P38756	429 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	SAP155	P43612	1002 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	STU2	P46675	888 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	OXP1	P28273	1286 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	ESL2	P36168	1195 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	PBY1	P38254	753 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	SCT1	P32784	759 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	ECM1	P39715	212 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	RAD26	P40352	1085 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	PLP2	Q12017	286 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	BCH2	P36122	765 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	CEP3	P40969	608 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	LTV1	P34078	463 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	MCM2	P29469	868 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	ITC1	P53125	1264 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	THI22	Q06490	572 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	RTG3	P38165	486 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	HST1	P53685	503 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	SRS2	P12954	1174 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	RPN12	P32496	274 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	RSC1	P53236	928 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	MRS2	Q01926	470 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	VPS60	Q03390	229 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	ELM1	P32801	640 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	YAP3	P38749	330 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	RAD50	P12753	1312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	SML1	Q04964	104 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	RAD2	P07276	1031 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MTR4	YJL050W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	STE11	P23561	717 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	SWI3	P32591	825 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	TPM2	P40414	161 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	KEX1	P09620	729 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	CDC16	P09798	840 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	PRD1	P25375	712 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	TAF5	P38129	798 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	NPA3	P47122	385 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	GCR2	Q01722	534 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	YNL050C	P53952	270 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	PET111	P08468	800 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	MET10	P39692	1035 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	MBR1	P23493	339 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	PXL1	P36166	706 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	SPE2	P21182	396 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	TAF13	P11747	167 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	SCY1	P53009	804 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	TAP42	Q04372	366 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	DLD1	P32891	587 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	YNL011C	P53980	444 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	SAP190	P36123	1033 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	RNT1	Q02555	471 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	BNI1	P41832	1953 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	CCC2	P38995	1004 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MTR4	YJL050W	MRC1	P25588	1096 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	MIF2	P35201	549 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	TGL3	P40308	642 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	CKB1	P43639	278 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	ORM2	Q06144	216 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	RTT109	Q07794	436 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	CYC8	P14922	966 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	RAD16	P31244	790 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	CWH41	P53008	833 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	RAD3	P06839	778 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	DAL5	P15365	543 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	COG8	Q04632	607 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	MSH3	P25336	1018 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MTR4	YJL050W	RAD51	P25454	400 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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