RNA–Protein interactions for RNA: YGR274C

TAF1, Transcript of TFIID subunit, involved in RNA pol II transcription initiation, yeast

Gene TAF1, Length 3,201 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TAF1	YGR274C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
TAF1	YGR274C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
TAF1	YGR274C	RAD50	P12753	1312 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	BDP1	P46678	594 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	CSI1	Q04368	295 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	CPS1	P27614	576 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	SRT1	Q03175	343 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	LCD1	Q04377	747 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	EDE1	P34216	1381 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	DSD1	P53095	428 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	VPS20	Q04272	221 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	NUP145	P49687	1317 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	HXT13	P39924	564 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	ESC2	Q06340	456 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	AUS1	Q08409	1394 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	MIC60	P36112	540 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	RMD1	Q03441	430 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	YGR122W	P53272	402 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	HXT17	P53631	564 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	GCR2	Q01722	534 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	PSK1	P31374	1356 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	NPA3	P47122	385 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	SIR4	P11978	1358 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	BIK1	P11709	440 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	SWC3	P31376	625 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	DID4	P36108	232 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	YNL050C	P53952	270 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	MCM2	P29469	868 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	TPM2	P40414	161 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	RSM25	P40496	264 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	APC11	Q12157	165 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	RKM3	P38222	552 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	ENT3	P47160	408 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	MAM1	P40065	302 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	RPN12	P32496	274 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	NTH2	P35172	780 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	COQ4	O13525	335 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	QCR6	P00127	147 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	RAD24	P32641	659 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	HAP5	Q02516	242 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	AOS1	Q06624	347 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TAF1	YGR274C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	CIR1	P42940	261 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	HST1	P53685	503 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	RAD4	P14736	754 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	BDH2	P39713	417 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	CWH41	P53008	833 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	NSE3	Q05541	303 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	NUP133	P36161	1157 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	MRPL10	P36520	322 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	TIM50	Q02776	476 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	KEX1	P09620	729 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	CYC8	P14922	966 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	PEX14	P53112	341 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	ARP5	P53946	755 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	NCB2	Q92317	146 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	MRP7	P12687	371 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	PRY3	P47033	881 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	ZDS2	P54786	942 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	TRS33	Q99394	268 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	USO1	P25386	1790 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	PDR18	P53756	1333 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	RAD26	P40352	1085 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	MAK10	Q02197	733 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	DNF3	Q12674	1656 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	MNR2	P35724	969 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	SSL2	Q00578	843 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	SGD1	Q06132	899 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	SFI1	Q12369	946 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	PEX19	Q07418	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	CDC16	P09798	840 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	VPS64	Q03944	604 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	ISW2	Q08773	1120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	MIF2	P35201	549 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TAF1	YGR274C	BOI2	P39969	1040 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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