RNA–Protein interactions for RNA: YER167W

BCK2, Transcript of Serine/threonine-rich protein involved in PKC1 signaling pathway, yeast

Gene BCK2, Length 2,556 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCK2	YER167W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	VHR2	P40041	505 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	SIT4	P20604	311 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	TFC3	P34111	1160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	ITC1	P53125	1264 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
BCK2	YER167W	CEX1	Q12453	761 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	YJR142W	P47173	342 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	IRC3	Q06683	689 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	LEM3	P42838	414 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	CHD1	P32657	1468 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	NPL4	P33755	580 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	UBP12	P39538	1254 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	RSC2	Q06488	889 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	FOB1	O13329	566 aa		4.71	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	MPH3	P0CE00	602 aa		4.71	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	VAC8	P39968	578 aa		4.71	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	BUD6	P41697	788 aa		4.71	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	POL32	P47110	350 aa		4.71	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	ATG1	P53104	897 aa		4.71	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	PIM1	P36775	1133 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	YHR218W	P38899	603 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	YEN1	P40028	759 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	ATF2	P53296	535 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	ALD3	P54114	506 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	RPN4	Q03465	531 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	VTI1	Q04338	217 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	PSR1	Q07800	427 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	STB3	Q12427	513 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	CMP2	P14747	604 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	SEC8	P32855	1065 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	MNN1	P39106	762 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	VID27	P40157	782 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	TIM54	P47045	478 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	NST1	P53935	1240 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	GRC3	Q07845	632 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	MSM1	P22438	575 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	DPB3	P27344	201 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	RKM3	P38222	552 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	RSM7	P47150	247 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	PUP1	P25043	261 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	YGR021W	P53212	290 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	NPR3	P38742	1146 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	VPS29	P38759	282 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	FOL1	P53848	824 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	BNI4	P53858	892 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	VTC3	Q02725	835 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	INO80	P53115	1489 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	ANP1	P32629	500 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	YAP1801	P38856	637 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	FAP1	P53971	965 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	ATG16	Q03818	150 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	KAR5	Q04746	504 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	RAD27	P26793	382 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	SAS3	P34218	831 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
BCK2	YER167W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	DAK2	P43550	591 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	APC5	Q08683	685 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	ESL2	P36168	1195 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	AIM20	P40451	204 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	PEX8	P53248	589 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	HOM3	P10869	527 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	RXT2	P38255	430 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	HSE1	P38753	452 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	WHI5	Q12416	295 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	SAC3	P46674	1301 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	ERP5	P38819	212 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	IES5	P40060	125 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	VPS4	P52917	437 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	RRI2	Q12348	645 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCK2	YER167W	UGA3	P26370	528 aa		4.65	□□□□□ -1.66

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