RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.49
DNF2	YDR093W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	SEC20	P28791	383 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	RTG3	P38165	486 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	SAS4	Q04003	481 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	THI12	P42883	340 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	THI5	P43534	340 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	THI11	P47183	340 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	GYP7	P48365	746 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	THI13	Q07748	340 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	UGA3	P26370	528 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	ITC1	P53125	1264 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	SRC1	Q03707	834 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	KCC4	P25389	1037 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	MGA2	P40578	1113 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	XKS1	P42826	600 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	BUG1	Q12191	341 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	QCR6	P00127	147 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	RKM4	Q12504	494 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	MIC60	P36112	540 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	SMC3	P47037	1230 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	SSP2	Q08646	371 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	CTF4	Q01454	927 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	ENT1	Q12518	454 aa		5.68	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	TOP1	P04786	769 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	SSM4	P40318	1319 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	IOC4	Q04213	475 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	NUP133	P36161	1157 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	KRE5	P22023	1365 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	RTC1	Q08281	1341 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	PDR18	P53756	1333 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	ENT3	P47160	408 aa		5.65	□□□□□ -1.5
DNF2	YDR093W	DID4	P36108	232 aa		5.65	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	SAS3	P34218	831 aa		5.65	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	IES2	P40154	320 aa		5.65	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	SLD2	P34252	453 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	MNR2	P35724	969 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	YOR093C	Q12275	1648 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	PLP2	Q12017	286 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	MSB4	Q12317	492 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	OSW7	P43611	510 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	SIP3	P38717	1229 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	TLG2	Q08144	397 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	SPT8	P38915	602 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	SGM1	P47166	707 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	BTN2	P53286	410 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	BUD6	P41697	788 aa		5.62	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	ALG2	P43636	503 aa		5.62	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	IMP2'	P32351	346 aa		5.62	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	JJJ2	P46997	583 aa		5.62	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	JJJ1	P53863	590 aa		5.62	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	YAF9	P53930	226 aa		5.62	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	PSF3	Q12146	194 aa		5.62	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	SAP190	P36123	1033 aa		5.61	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	MDL2	P33311	773 aa		5.61	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	PIP2	P52960	996 aa		5.61	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	CAJ1	P39101	391 aa		5.61	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	DNM1	P54861	757 aa		5.61	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	MRP7	P12687	371 aa		5.6	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	TTI1	P36097	1038 aa		5.6	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	TPM2	P40414	161 aa		5.6	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	VPS9	P54787	451 aa		5.6	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	UBX2	Q04228	584 aa		5.6	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	PSH1	Q12161	406 aa		5.6	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	CSM3	Q04659	317 aa		5.6	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	BIK1	P11709	440 aa		5.59	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	TAP42	Q04372	366 aa		5.59	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	PSK1	P31374	1356 aa		5.59	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
DNF2	YDR093W	DPB3	P27344	201 aa		5.59	□□□□□ -1.51

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 61.6 ms