RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	PDIA6	Q15084	440 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	PHF14	O94880	888 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	TK2	O00142	265 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	FBXW7	Q969H0	707 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	WDR62	O43379	1518 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	EPAS1	Q99814	870 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		10.46	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	ARAP1	Q96P48	1450 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	KCNH8	Q96L42	1107 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	HMGXB3	Q12766	1538 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	PTPRE	P23469	700 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	P3H3	Q8IVL6	736 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	PSEN2	P49810	448 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	KCNK17	Q96T54	332 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MLH1-223	ENST00000616768	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MLH1-223	ENST00000616768	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MLH1-223	ENST00000616768	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MLH1-223	ENST00000616768	HR	O43593	1189 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MLH1-223	ENST00000616768	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MLH1-223	ENST00000616768	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MLH1-223	ENST00000616768	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MLH1-223	ENST00000616768	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MLH1-223	ENST00000616768	DDX12P	Q92771	950 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MLH1-223	ENST00000616768	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MLH1-223	ENST00000616768	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MLH1-223	ENST00000616768	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MLH1-223	ENST00000616768	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MLH1-223	ENST00000616768	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MLH1-223	ENST00000616768	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
MLH1-223	ENST00000616768	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MLH1-223	ENST00000616768	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MLH1-223	ENST00000616768	OSBP	P22059	807 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-223	ENST00000616768	NBR1	Q14596	966 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-223	ENST00000616768	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-223	ENST00000616768	COL9A1	P20849	921 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-223	ENST00000616768	CERK	Q8TCT0	537 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	SMARCA4	P51532	1647 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	MAP3K7	O43318	606 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	NBPF3	Q9H094	633 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	STAC3	Q96MF2	364 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	CHD1	O14646	1710 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
MLH1-223	ENST00000616768	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	PROX2	Q3B8N5	592 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	PRSS12	P56730	875 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	SEMA3E	O15041	775 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	HCST	Q9UBK5	93 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MLH1-223	ENST00000616768	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	TTC13	Q8NBP0	860 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	FBXO41	Q8TF61	875 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	TSKS	Q9UJT2	592 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	SOCS7	O14512	581 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	ILDR2	Q71H61	639 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	PTGDR	Q13258	359 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	WNT2B	Q93097	391 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MLH1-223	ENST00000616768	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms