RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608842.1

DGCR6-208, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, human

TSL 2 BASIC

Gene DGCR6, Length 1,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DGCR6-208	ENST00000608842	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.6	■■■□□ 2.97
DGCR6-208	ENST00000608842	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.6	■■■□□ 2.97
DGCR6-208	ENST00000608842	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		33.56	■■■□□ 2.96
DGCR6-208	ENST00000608842	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.55	■■■□□ 2.96
DGCR6-208	ENST00000608842	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
DGCR6-208	ENST00000608842	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.54	■■■□□ 2.96
DGCR6-208	ENST00000608842	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.53	■■■□□ 2.96
DGCR6-208	ENST00000608842	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.53	■■■□□ 2.96
DGCR6-208	ENST00000608842	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.52	■■■□□ 2.96
DGCR6-208	ENST00000608842	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.52	■■■□□ 2.96
DGCR6-208	ENST00000608842	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.51	■■■□□ 2.96
DGCR6-208	ENST00000608842	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		33.49	■■■□□ 2.95
DGCR6-208	ENST00000608842		E9PCH4	1651 aa		33.48	■■■□□ 2.95
DGCR6-208	ENST00000608842	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
DGCR6-208	ENST00000608842	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.47	■■■□□ 2.95
DGCR6-208	ENST00000608842	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.46	■■■□□ 2.95
DGCR6-208	ENST00000608842	A2M	P01023	1474 aa		33.46	■■■□□ 2.95
DGCR6-208	ENST00000608842	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.46	■■■□□ 2.95
DGCR6-208	ENST00000608842	TET3	O43151	1660 aa		33.44	■■■□□ 2.94
DGCR6-208	ENST00000608842	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
DGCR6-208	ENST00000608842	RAPGEF3	O95398	923 aa		33.44	■■■□□ 2.94
DGCR6-208	ENST00000608842	ATP10A	O60312	1499 aa		33.43	■■■□□ 2.94
DGCR6-208	ENST00000608842	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.41	■■■□□ 2.94
DGCR6-208	ENST00000608842	KIF3B	O15066	747 aa		33.39	■■■□□ 2.94
DGCR6-208	ENST00000608842	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		33.35	■■■□□ 2.93
DGCR6-208	ENST00000608842	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.35	■■■□□ 2.93
DGCR6-208	ENST00000608842	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.34	■■■□□ 2.93
DGCR6-208	ENST00000608842	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		33.33	■■■□□ 2.93
DGCR6-208	ENST00000608842	CEP152	O94986	1710 aa		33.31	■■■□□ 2.92
DGCR6-208	ENST00000608842	KANK1	Q14678	1352 aa		33.31	■■■□□ 2.92
DGCR6-208	ENST00000608842	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.29	■■■□□ 2.92
DGCR6-208	ENST00000608842	TRPM2	O94759	1503 aa		33.27	■■■□□ 2.92
DGCR6-208	ENST00000608842	PTPRT	O14522	1441 aa		33.26	■■■□□ 2.92
DGCR6-208	ENST00000608842	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.26	■■■□□ 2.92
DGCR6-208	ENST00000608842	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.26	■■■□□ 2.92
DGCR6-208	ENST00000608842	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.25	■■■□□ 2.91
DGCR6-208	ENST00000608842	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
DGCR6-208	ENST00000608842	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		33.21	■■■□□ 2.91
DGCR6-208	ENST00000608842	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.19	■■■□□ 2.9
DGCR6-208	ENST00000608842	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
DGCR6-208	ENST00000608842	ABCC3	O15438	1527 aa		33.13	■■■□□ 2.89
DGCR6-208	ENST00000608842	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		33.13	■■■□□ 2.89
DGCR6-208	ENST00000608842	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
DGCR6-208	ENST00000608842	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		33.12	■■■□□ 2.89
DGCR6-208	ENST00000608842	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.11	■■■□□ 2.89
DGCR6-208	ENST00000608842	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.1	■■■□□ 2.89
DGCR6-208	ENST00000608842	MIER1	Q8N108	512 aa		33.1	■■■□□ 2.89
DGCR6-208	ENST00000608842	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		33.1	■■■□□ 2.89
DGCR6-208	ENST00000608842	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	33.09	■■■□□ 2.89
DGCR6-208	ENST00000608842	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
DGCR6-208	ENST00000608842	GGT6	Q6P531	493 aa		33.08	■■■□□ 2.89
DGCR6-208	ENST00000608842	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		33.08	■■■□□ 2.89
DGCR6-208	ENST00000608842	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.06	■■■□□ 2.88
DGCR6-208	ENST00000608842	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
DGCR6-208	ENST00000608842	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		33.05	■■■□□ 2.88
DGCR6-208	ENST00000608842	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
DGCR6-208	ENST00000608842	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		33.05	■■■□□ 2.88
DGCR6-208	ENST00000608842	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.04	■■■□□ 2.88
DGCR6-208	ENST00000608842	NPAT	Q14207	1427 aa		33.04	■■■□□ 2.88
DGCR6-208	ENST00000608842	RGL3	Q3MIN7	710 aa		33.04	■■■□□ 2.88
DGCR6-208	ENST00000608842	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
DGCR6-208	ENST00000608842	KIF1B	O60333	1816 aa		33.03	■■■□□ 2.88
DGCR6-208	ENST00000608842	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.02	■■■□□ 2.88
DGCR6-208	ENST00000608842	AGL	P35573	1532 aa		33	■■■□□ 2.87
DGCR6-208	ENST00000608842	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.99	■■■□□ 2.87
DGCR6-208	ENST00000608842	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.97	■■■□□ 2.87
DGCR6-208	ENST00000608842	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
DGCR6-208	ENST00000608842	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.96	■■■□□ 2.87
DGCR6-208	ENST00000608842	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.93	■■■□□ 2.86
DGCR6-208	ENST00000608842	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.93	■■■□□ 2.86
DGCR6-208	ENST00000608842	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.92	■■■□□ 2.86
DGCR6-208	ENST00000608842	USP47	Q96K76	1375 aa		32.92	■■■□□ 2.86
DGCR6-208	ENST00000608842	LAMC1	P11047	1609 aa		32.92	■■■□□ 2.86
DGCR6-208	ENST00000608842	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.91	■■■□□ 2.86
DGCR6-208	ENST00000608842	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.9	■■■□□ 2.86
DGCR6-208	ENST00000608842	NOS1	P29475	1434 aa		32.89	■■■□□ 2.86
DGCR6-208	ENST00000608842	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.89	■■■□□ 2.86
DGCR6-208	ENST00000608842	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
DGCR6-208	ENST00000608842	SYNM	O15061	1565 aa		32.87	■■■□□ 2.85
DGCR6-208	ENST00000608842	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.87	■■■□□ 2.85
DGCR6-208	ENST00000608842	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.86	■■■□□ 2.85
DGCR6-208	ENST00000608842	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.84	■■■□□ 2.85
DGCR6-208	ENST00000608842	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
DGCR6-208	ENST00000608842	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.83	■■■□□ 2.85
DGCR6-208	ENST00000608842	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.81	■■■□□ 2.84
DGCR6-208	ENST00000608842	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.81	■■■□□ 2.84
DGCR6-208	ENST00000608842	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.79	■■■□□ 2.84
DGCR6-208	ENST00000608842	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
DGCR6-208	ENST00000608842	PPL	O60437	1756 aa		32.78	■■■□□ 2.84
DGCR6-208	ENST00000608842	MYOM2	P54296	1465 aa		32.78	■■■□□ 2.84
DGCR6-208	ENST00000608842	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.78	■■■□□ 2.84
DGCR6-208	ENST00000608842	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.74	■■■□□ 2.83
DGCR6-208	ENST00000608842	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.73	■■■□□ 2.83
DGCR6-208	ENST00000608842	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.71	■■■□□ 2.83
DGCR6-208	ENST00000608842	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.71	■■■□□ 2.83
DGCR6-208	ENST00000608842	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.68	■■■□□ 2.82
DGCR6-208	ENST00000608842	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		32.67	■■■□□ 2.82
DGCR6-208	ENST00000608842	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.65	■■■□□ 2.82
DGCR6-208	ENST00000608842	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.62	■■■□□ 2.81
DGCR6-208	ENST00000608842	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms