RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604036.1

FOCAD-211, Transcript of focadhesin, humanhuman

TSL 4

Gene FOCAD, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCAD-211ENST00000604036 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.4■■■■□ 3.42
FOCAD-211ENST00000604036 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
FOCAD-211ENST00000604036 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.39■■■■□ 3.42
FOCAD-211ENST00000604036 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
FOCAD-211ENST00000604036 ERBINQ96RT1 1412 aa36.34■■■■□ 3.41
FOCAD-211ENST00000604036 C3P01024 1663 aa36.34■■■■□ 3.41
FOCAD-211ENST00000604036 MROH2AA6NES4 1674 aa36.32■■■■□ 3.41
FOCAD-211ENST00000604036 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
FOCAD-211ENST00000604036 ZMYM3Q14202 1370 aa36.29■■■■□ 3.4
FOCAD-211ENST00000604036 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.28■■■■□ 3.4
FOCAD-211ENST00000604036 ROCK1Q13464 1354 aa36.27■■■■□ 3.4
FOCAD-211ENST00000604036 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.25■■■■□ 3.39
FOCAD-211ENST00000604036 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.24■■■■□ 3.39
FOCAD-211ENST00000604036 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.23■■■■□ 3.39
FOCAD-211ENST00000604036 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.23■■■■□ 3.39
FOCAD-211ENST00000604036 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.21■■■■□ 3.39
FOCAD-211ENST00000604036 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
FOCAD-211ENST00000604036 DEPDC5O75140 1603 aa36.17■■■■□ 3.38
FOCAD-211ENST00000604036 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
FOCAD-211ENST00000604036 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
FOCAD-211ENST00000604036 CEP152O94986 1710 aa36.15■■■■□ 3.38
FOCAD-211ENST00000604036 ABCC3O15438 1527 aa36.14■■■■□ 3.38
FOCAD-211ENST00000604036 KANK1Q14678 1352 aa36.13■■■■□ 3.37
FOCAD-211ENST00000604036 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.12■■■■□ 3.37
FOCAD-211ENST00000604036 NPATQ14207 1427 aa36.1■■■■□ 3.37
FOCAD-211ENST00000604036 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.09■■■■□ 3.37
FOCAD-211ENST00000604036 PZPP20742 1482 aa36.06■■■■□ 3.36
FOCAD-211ENST00000604036 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.05■■■■□ 3.36
FOCAD-211ENST00000604036 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.05■■■■□ 3.36
FOCAD-211ENST00000604036 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
FOCAD-211ENST00000604036 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.01■■■■□ 3.35
FOCAD-211ENST00000604036 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
FOCAD-211ENST00000604036 NAIPQ13075 1403 aa36■■■■□ 3.35
FOCAD-211ENST00000604036 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.99■■■■□ 3.35
FOCAD-211ENST00000604036 UNC13BO14795 1591 aa35.98■■■■□ 3.35
FOCAD-211ENST00000604036 HSPA2P54652 639 aa35.98■■■■□ 3.35
FOCAD-211ENST00000604036 FBXO41Q8TF61 875 aa35.96■■■■□ 3.35
FOCAD-211ENST00000604036 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.96■■■■□ 3.35
FOCAD-211ENST00000604036 HFM1A2PYH4 1435 aa35.94■■■■□ 3.34
FOCAD-211ENST00000604036 TNRQ92752 1358 aa35.94■■■■□ 3.34
FOCAD-211ENST00000604036 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.93■■■■□ 3.34
FOCAD-211ENST00000604036 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.92■■■■□ 3.34
FOCAD-211ENST00000604036 NUP155O75694 1391 aa35.89■■■■□ 3.34
FOCAD-211ENST00000604036 ERVK-7P63135 1459 aa35.88■■■■□ 3.33
FOCAD-211ENST00000604036 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.87■■■■□ 3.33
FOCAD-211ENST00000604036 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.86■■■■□ 3.33
FOCAD-211ENST00000604036 TET3O43151 1660 aa35.85■■■■□ 3.33
FOCAD-211ENST00000604036 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.85■■■■□ 3.33
FOCAD-211ENST00000604036 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
FOCAD-211ENST00000604036 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
FOCAD-211ENST00000604036 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.8■■■■□ 3.32
FOCAD-211ENST00000604036 NLRP1Q9C000 1473 aa35.78■■■■□ 3.32
FOCAD-211ENST00000604036 TRIM52Q96A61 297 aa35.76■■■■□ 3.32
FOCAD-211ENST00000604036 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
FOCAD-211ENST00000604036 E9PCH4 1651 aa35.73■■■■□ 3.31
FOCAD-211ENST00000604036 NOS1P29475 1434 aa35.69■■■■□ 3.3
FOCAD-211ENST00000604036 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.69■■■■□ 3.3
FOCAD-211ENST00000604036 STRCQ7RTU9 1775 aa35.69■■■■□ 3.3
FOCAD-211ENST00000604036 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.68■■■■□ 3.3
FOCAD-211ENST00000604036 SYNMO15061 1565 aa35.67■■■■□ 3.3
FOCAD-211ENST00000604036 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
FOCAD-211ENST00000604036 IDI1Q13907 227 aa35.61■■■■□ 3.29
FOCAD-211ENST00000604036 PLA2R1Q13018 1463 aa35.6■■■■□ 3.29
FOCAD-211ENST00000604036 PIK3C2BO00750 1634 aa35.6■■■■□ 3.29
FOCAD-211ENST00000604036 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.59■■■■□ 3.29
FOCAD-211ENST00000604036 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.59■■■■□ 3.29
FOCAD-211ENST00000604036 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.58■■■■□ 3.29
FOCAD-211ENST00000604036 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
FOCAD-211ENST00000604036 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.57■■■■□ 3.28
FOCAD-211ENST00000604036 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.57■■■■□ 3.28
FOCAD-211ENST00000604036 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.56■■■■□ 3.28
FOCAD-211ENST00000604036 PKD2Q13563 968 aa35.54■■■■□ 3.28
FOCAD-211ENST00000604036 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
FOCAD-211ENST00000604036 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.52■■■■□ 3.28
FOCAD-211ENST00000604036 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.49■■■■□ 3.27
FOCAD-211ENST00000604036 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
FOCAD-211ENST00000604036 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
FOCAD-211ENST00000604036 CERKQ8TCT0 537 aa35.47■■■■□ 3.27
FOCAD-211ENST00000604036 PTPRTO14522 1441 aa35.47■■■■□ 3.27
FOCAD-211ENST00000604036 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.46■■■■□ 3.27
FOCAD-211ENST00000604036 ADGRB3O60242 1522 aa35.46■■■■□ 3.27
FOCAD-211ENST00000604036 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
FOCAD-211ENST00000604036 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.42■■■■□ 3.26
FOCAD-211ENST00000604036 FOXD1Q16676 465 aa35.4■■■■□ 3.26
FOCAD-211ENST00000604036 SLIT1O75093 1534 aa35.4■■■■□ 3.26
FOCAD-211ENST00000604036 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.39■■■■□ 3.26
FOCAD-211ENST00000604036 HRCP23327 699 aa35.39■■■■□ 3.26
FOCAD-211ENST00000604036 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.39■■■■□ 3.26
FOCAD-211ENST00000604036 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.39■■■■□ 3.26
FOCAD-211ENST00000604036 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.38■■■■□ 3.26
FOCAD-211ENST00000604036 TRPM2O94759 1503 aa35.37■■■■□ 3.25
FOCAD-211ENST00000604036 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.37■■■■□ 3.25
FOCAD-211ENST00000604036 EID1Q9Y6B2 187 aa35.37■■■■□ 3.25
FOCAD-211ENST00000604036 LTKP29376 864 aa35.34■■■■□ 3.25
FOCAD-211ENST00000604036 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
FOCAD-211ENST00000604036 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
FOCAD-211ENST00000604036 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.25
FOCAD-211ENST00000604036 CLTCL1P53675 1640 aa35.32■■■■□ 3.25
FOCAD-211ENST00000604036 MED14O60244 1454 aa35.32■■■■□ 3.24
FOCAD-211ENST00000604036 IQGAP1P46940 1657 aa35.28■■■■□ 3.24
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