RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604036.1

FOCAD-211, Transcript of focadhesin, humanhuman

TSL 4

Gene FOCAD, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCAD-211ENST00000604036 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.64■■■■■ 6.82
FOCAD-211ENST00000604036 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.18■■■■■ 5.78
FOCAD-211ENST00000604036 ABCC9O60706 1549 aa50.01■■■■■ 5.6
FOCAD-211ENST00000604036 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.24■■■■■ 5.31
FOCAD-211ENST00000604036 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.13■■■■■ 5.29
FOCAD-211ENST00000604036 NACADO15069 1562 aa48.08■■■■■ 5.29
FOCAD-211ENST00000604036 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
FOCAD-211ENST00000604036 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.79■■■■■ 5.24
FOCAD-211ENST00000604036 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.65■■■■■ 5.22
FOCAD-211ENST00000604036 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.08■■■■■ 5.13
FOCAD-211ENST00000604036 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.77■■■■■ 5.08
FOCAD-211ENST00000604036 SCRIBQ14160 1630 aa46.76■■■■■ 5.08
FOCAD-211ENST00000604036 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.65■■■■■ 5.06
FOCAD-211ENST00000604036 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.38■■■■■ 5.02
FOCAD-211ENST00000604036 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.11■■■■■ 4.97
FOCAD-211ENST00000604036 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
FOCAD-211ENST00000604036 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.22■■■■■ 4.83
FOCAD-211ENST00000604036 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.91■■■■■ 4.78
FOCAD-211ENST00000604036 SMARCA4P51532 1647 aa44.71■■■■■ 4.75
FOCAD-211ENST00000604036 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
FOCAD-211ENST00000604036 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.44■■■■■ 4.71
FOCAD-211ENST00000604036 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.41■■■■■ 4.7
FOCAD-211ENST00000604036 SMARCA2P51531 1590 aa44.38■■■■■ 4.69
FOCAD-211ENST00000604036 NCAPD3P42695 1498 aa44.35■■■■■ 4.69
FOCAD-211ENST00000604036 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.22■■■■■ 4.67
FOCAD-211ENST00000604036 HMGXB3Q12766 1538 aa44.14■■■■■ 4.66
FOCAD-211ENST00000604036 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
FOCAD-211ENST00000604036 WIZO95785 1651 aa44■■■■■ 4.63
FOCAD-211ENST00000604036 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
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FOCAD-211ENST00000604036 NESP48681 1621 aa43.3■■■■■ 4.52
FOCAD-211ENST00000604036 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.19■■■■■ 4.5
FOCAD-211ENST00000604036 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.1■■■■■ 4.49
FOCAD-211ENST00000604036 ERCC6Q03468 1493 aa43.09■■■■■ 4.49
FOCAD-211ENST00000604036 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
FOCAD-211ENST00000604036 CCDC88BA6NC98 1476 aa43■■■■■ 4.47
FOCAD-211ENST00000604036 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.9■■■■■ 4.46
FOCAD-211ENST00000604036 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.87■■■■■ 4.45
FOCAD-211ENST00000604036 CFTRP13569 1480 aa42.85■■■■■ 4.45
FOCAD-211ENST00000604036 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.82■■■■■ 4.44
FOCAD-211ENST00000604036 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.61■■■■■ 4.41
FOCAD-211ENST00000604036 PRDM2Q13029 1718 aa42.59■■■■■ 4.41
FOCAD-211ENST00000604036 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
FOCAD-211ENST00000604036 CUX2O14529 1486 aa42.55■■■■■ 4.4
FOCAD-211ENST00000604036 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.55■■■■■ 4.4
FOCAD-211ENST00000604036 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.44■■■■■ 4.38
FOCAD-211ENST00000604036 WDR62O43379 1518 aa42.28■■■■■ 4.36
FOCAD-211ENST00000604036 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
FOCAD-211ENST00000604036 TOPBP1Q92547 1522 aa41.95■■■■■ 4.31
FOCAD-211ENST00000604036 ABCC8Q09428 1581 aa41.94■■■■■ 4.3
FOCAD-211ENST00000604036 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.9■■■■■ 4.3
FOCAD-211ENST00000604036 CUX1P39880 1505 aa41.68■■■■■ 4.26
FOCAD-211ENST00000604036 IFT140Q96RY7 1462 aa41.64■■■■■ 4.26
FOCAD-211ENST00000604036 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
FOCAD-211ENST00000604036 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.53■■■■■ 4.24
FOCAD-211ENST00000604036 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
FOCAD-211ENST00000604036 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
FOCAD-211ENST00000604036 SOGA1O94964 1423 aa41.45■■■■■ 4.23
FOCAD-211ENST00000604036 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
FOCAD-211ENST00000604036 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.44■■■■■ 4.22
FOCAD-211ENST00000604036 SYNJ1O43426 1573 aa41.36■■■■■ 4.21
FOCAD-211ENST00000604036 TOP2BQ02880 1626 aa41.35■■■■■ 4.21
FOCAD-211ENST00000604036 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.35■■■■■ 4.21
FOCAD-211ENST00000604036 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
FOCAD-211ENST00000604036 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.26■■■■■ 4.2
FOCAD-211ENST00000604036 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
FOCAD-211ENST00000604036 WDR97A6NE52 1622 aa41.16■■■■■ 4.18
FOCAD-211ENST00000604036 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.11■■■■■ 4.17
FOCAD-211ENST00000604036 TRIM41Q8WV44 630 aa41.02■■■■■ 4.16
FOCAD-211ENST00000604036 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.96■■■■■ 4.15
FOCAD-211ENST00000604036 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.93■■■■■ 4.14
FOCAD-211ENST00000604036 GRIN2BQ13224 1484 aa40.93■■■■■ 4.14
FOCAD-211ENST00000604036 PBRM1Q86U86 1689 aa40.89■■■■■ 4.14
FOCAD-211ENST00000604036 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.86■■■■■ 4.13
FOCAD-211ENST00000604036 OSCARQ8IYS5 282 aa40.86■■■■■ 4.13
FOCAD-211ENST00000604036 FBLN2P98095 1184 aa40.8■■■■■ 4.12
FOCAD-211ENST00000604036 CHD1O14646 1710 aa40.79■■■■■ 4.12
FOCAD-211ENST00000604036 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
FOCAD-211ENST00000604036 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
FOCAD-211ENST00000604036 SYNJ2O15056 1496 aa40.64■■■■■ 4.1
FOCAD-211ENST00000604036 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.62■■■■■ 4.09
FOCAD-211ENST00000604036 KIF27Q86VH2 1401 aa40.59■■■■■ 4.09
FOCAD-211ENST00000604036 ADAMTS12P58397 1594 aa40.53■■■■■ 4.08
FOCAD-211ENST00000604036 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.49■■■■■ 4.07
FOCAD-211ENST00000604036 IGF1RP08069 1367 aa40.41■■■■■ 4.06
FOCAD-211ENST00000604036 GRIN2AQ12879 1464 aa40.4■■■■■ 4.06
FOCAD-211ENST00000604036 CUL7Q14999 1698 aa40.29■■■■■ 4.04
FOCAD-211ENST00000604036 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.29■■■■■ 4.04
FOCAD-211ENST00000604036 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.28■■■■■ 4.04
FOCAD-211ENST00000604036 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.22■■■■■ 4.03
FOCAD-211ENST00000604036 CEP170Q5SW79 1584 aa40.2■■■■■ 4.03
FOCAD-211ENST00000604036 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.2■■■■■ 4.03
FOCAD-211ENST00000604036 NUP160Q12769 1436 aa40.19■■■■■ 4.02
FOCAD-211ENST00000604036 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.17■■■■■ 4.02
FOCAD-211ENST00000604036 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.17■■■■■ 4.02
FOCAD-211ENST00000604036 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.17■■■■■ 4.02
FOCAD-211ENST00000604036 ARHGEF11O15085 1522 aa40.16■■■■■ 4.02
FOCAD-211ENST00000604036 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.95■■■■□ 3.99
FOCAD-211ENST00000604036 SHROOM2Q13796 1616 aa39.88■■■■□ 3.97
FOCAD-211ENST00000604036 EEA1Q15075 1411 aa39.88■■■■□ 3.97
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