RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.51■■□□□ 1.83
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ZNF548-204ENST00000594693 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.5■■□□□ 1.83
ZNF548-204ENST00000594693 MADDQ8WXG6 1647 aa26.5■■□□□ 1.83
ZNF548-204ENST00000594693 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.47■■□□□ 1.83
ZNF548-204ENST00000594693 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.47■■□□□ 1.83
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ZNF548-204ENST00000594693 PTPRMP28827 1452 aa26.46■■□□□ 1.83
ZNF548-204ENST00000594693 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.46■■□□□ 1.83
ZNF548-204ENST00000594693 KANK1Q14678 1352 aa26.45■■□□□ 1.82
ZNF548-204ENST00000594693 DEPDC5O75140 1603 aa26.44■■□□□ 1.82
ZNF548-204ENST00000594693 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.44■■□□□ 1.82
ZNF548-204ENST00000594693 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.44■■□□□ 1.82
ZNF548-204ENST00000594693 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
ZNF548-204ENST00000594693 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.44■■□□□ 1.82
ZNF548-204ENST00000594693 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
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ZNF548-204ENST00000594693 ABCC3O15438 1527 aa26.4■■□□□ 1.82
ZNF548-204ENST00000594693 NUP155O75694 1391 aa26.4■■□□□ 1.82
ZNF548-204ENST00000594693 HRCP23327 699 aa26.38■■□□□ 1.81
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ZNF548-204ENST00000594693 UNC13BO14795 1591 aa26.37■■□□□ 1.81
ZNF548-204ENST00000594693 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.36■■□□□ 1.81
ZNF548-204ENST00000594693 MROH2AA6NES4 1674 aa26.36■■□□□ 1.81
ZNF548-204ENST00000594693 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
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ZNF548-204ENST00000594693 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.35■■□□□ 1.81
ZNF548-204ENST00000594693 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.34■■□□□ 1.81
ZNF548-204ENST00000594693 TRIM52Q96A61 297 aa26.34■■□□□ 1.81
ZNF548-204ENST00000594693 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.32■■□□□ 1.8
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ZNF548-204ENST00000594693 PZPP20742 1482 aa26.3■■□□□ 1.8
ZNF548-204ENST00000594693 C3P01024 1663 aa26.28■■□□□ 1.8
ZNF548-204ENST00000594693 NPATQ14207 1427 aa26.28■■□□□ 1.8
ZNF548-204ENST00000594693 CEP152O94986 1710 aa26.27■■□□□ 1.8
ZNF548-204ENST00000594693 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.26■■□□□ 1.79
ZNF548-204ENST00000594693 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.25■■□□□ 1.79
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ZNF548-204ENST00000594693 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.22■■□□□ 1.79
ZNF548-204ENST00000594693 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.22■■□□□ 1.79
ZNF548-204ENST00000594693 TET3O43151 1660 aa26.21■■□□□ 1.79
ZNF548-204ENST00000594693 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
ZNF548-204ENST00000594693 PKD2Q13563 968 aa26.19■■□□□ 1.78
ZNF548-204ENST00000594693 TNRQ92752 1358 aa26.19■■□□□ 1.78
ZNF548-204ENST00000594693 ERVK-7P63135 1459 aa26.18■■□□□ 1.78
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ZNF548-204ENST00000594693 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
ZNF548-204ENST00000594693 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.16■■□□□ 1.78
ZNF548-204ENST00000594693 NOS1P29475 1434 aa26.16■■□□□ 1.78
ZNF548-204ENST00000594693 E9PCH4 1651 aa26.12■■□□□ 1.77
ZNF548-204ENST00000594693 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.1■■□□□ 1.77
ZNF548-204ENST00000594693 PTPRTO14522 1441 aa26.1■■□□□ 1.77
ZNF548-204ENST00000594693 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.1■■□□□ 1.77
ZNF548-204ENST00000594693 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.09■■□□□ 1.77
ZNF548-204ENST00000594693 IDI1Q13907 227 aa26.09■■□□□ 1.77
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ZNF548-204ENST00000594693 NLRP1Q9C000 1473 aa26.07■■□□□ 1.76
ZNF548-204ENST00000594693 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.06■■□□□ 1.76
ZNF548-204ENST00000594693 PLA2R1Q13018 1463 aa26.04■■□□□ 1.76
ZNF548-204ENST00000594693 SYNMO15061 1565 aa26.04■■□□□ 1.76
ZNF548-204ENST00000594693 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.04■■□□□ 1.76
ZNF548-204ENST00000594693 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26■■□□□ 1.75
ZNF548-204ENST00000594693 HSPA2P54652 639 aa26■■□□□ 1.75
ZNF548-204ENST00000594693 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
ZNF548-204ENST00000594693 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ZNF548-204ENST00000594693 TRPM2O94759 1503 aa25.95■■□□□ 1.74
ZNF548-204ENST00000594693 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.95■■□□□ 1.74
ZNF548-204ENST00000594693 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.94■■□□□ 1.74
ZNF548-204ENST00000594693 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.94■■□□□ 1.74
ZNF548-204ENST00000594693 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.94■■□□□ 1.74
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ZNF548-204ENST00000594693 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.85■■□□□ 1.73
ZNF548-204ENST00000594693 CLTCL1P53675 1640 aa25.85■■□□□ 1.73
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ZNF548-204ENST00000594693 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.84■■□□□ 1.73
ZNF548-204ENST00000594693 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.83■■□□□ 1.73
ZNF548-204ENST00000594693 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.82■■□□□ 1.72
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ZNF548-204ENST00000594693 SLIT1O75093 1534 aa25.81■■□□□ 1.72
ZNF548-204ENST00000594693 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.8■■□□□ 1.72
ZNF548-204ENST00000594693 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
ZNF548-204ENST00000594693 EID1Q9Y6B2 187 aa25.79■■□□□ 1.72
ZNF548-204ENST00000594693 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.78■■□□□ 1.72
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
ZNF548-204ENST00000594693 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.76■■□□□ 1.71
ZNF548-204ENST00000594693 ZFYVE9O95405 1425 aa25.76■■□□□ 1.71
ZNF548-204ENST00000594693 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.75■■□□□ 1.71
ZNF548-204ENST00000594693 RGL3Q3MIN7 710 aa25.75■■□□□ 1.71
ZNF548-204ENST00000594693 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.75■■□□□ 1.71
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