RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592624.1

ATP5D-208, Transcript of ATP synthase subunit delta, mitochondrial, human

Gene ATP5D, Length 1,587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP5D-208	ENST00000592624	ATP10A	O60312	1499 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ATP5D-208	ENST00000592624	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ATP5D-208	ENST00000592624	PZP	P20742	1482 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ATP5D-208	ENST00000592624	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
ATP5D-208	ENST00000592624	NUP155	O75694	1391 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ATP5D-208	ENST00000592624	KIF3B	O15066	747 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ATP5D-208	ENST00000592624	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ATP5D-208	ENST00000592624	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ATP5D-208	ENST00000592624	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ATP5D-208	ENST00000592624	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
ATP5D-208	ENST00000592624	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ATP5D-208	ENST00000592624	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ATP5D-208	ENST00000592624	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.87	■■■□□ 2.21	8e-7	■■□□□ 14.3
ATP5D-208	ENST00000592624	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
ATP5D-208	ENST00000592624	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ATP5D-208	ENST00000592624	AGL	P35573	1532 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ATP5D-208	ENST00000592624	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATP5D-208	ENST00000592624	KANK1	Q14678	1352 aa		28.81	■■■□□ 2.2
ATP5D-208	ENST00000592624	CEP152	O94986	1710 aa		28.77	■■■□□ 2.2
ATP5D-208	ENST00000592624	TET3	O43151	1660 aa		28.76	■■■□□ 2.2
ATP5D-208	ENST00000592624	GGT6	Q6P531	493 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ATP5D-208	ENST00000592624	PKD2	Q13563	968 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ATP5D-208	ENST00000592624	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
ATP5D-208	ENST00000592624	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.72	■■■□□ 2.19
ATP5D-208	ENST00000592624	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
ATP5D-208	ENST00000592624	FOXD1	Q16676	465 aa		28.71	■■■□□ 2.19
ATP5D-208	ENST00000592624		E9PCH4	1651 aa		28.7	■■■□□ 2.19
ATP5D-208	ENST00000592624	ABCC3	O15438	1527 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ATP5D-208	ENST00000592624	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
ATP5D-208	ENST00000592624	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ATP5D-208	ENST00000592624	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ATP5D-208	ENST00000592624	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.65	■■■□□ 2.18
ATP5D-208	ENST00000592624	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.64	■■■□□ 2.18
ATP5D-208	ENST00000592624	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ATP5D-208	ENST00000592624	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.62	■■■□□ 2.17
ATP5D-208	ENST00000592624	MLEC	Q14165	292 aa		28.62	■■■□□ 2.17
ATP5D-208	ENST00000592624	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ATP5D-208	ENST00000592624	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.6	■■■□□ 2.17
ATP5D-208	ENST00000592624	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
ATP5D-208	ENST00000592624	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
ATP5D-208	ENST00000592624	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.55	■■■□□ 2.16
ATP5D-208	ENST00000592624	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
ATP5D-208	ENST00000592624	NPAT	Q14207	1427 aa		28.53	■■■□□ 2.16
ATP5D-208	ENST00000592624	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.53	■■■□□ 2.16
ATP5D-208	ENST00000592624	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.53	■■■□□ 2.16
ATP5D-208	ENST00000592624	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		28.51	■■■□□ 2.15
ATP5D-208	ENST00000592624	PTPRT	O14522	1441 aa		28.51	■■■□□ 2.15
ATP5D-208	ENST00000592624	TRPM2	O94759	1503 aa		28.51	■■■□□ 2.15
ATP5D-208	ENST00000592624	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.49	■■■□□ 2.15
ATP5D-208	ENST00000592624	MADD	Q8WXG6	1647 aa		28.48	■■■□□ 2.15
ATP5D-208	ENST00000592624	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.47	■■■□□ 2.15
ATP5D-208	ENST00000592624	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		28.47	■■■□□ 2.15
ATP5D-208	ENST00000592624	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
ATP5D-208	ENST00000592624	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.46	■■■□□ 2.15
ATP5D-208	ENST00000592624	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		28.45	■■■□□ 2.14
ATP5D-208	ENST00000592624	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.44	■■■□□ 2.14
ATP5D-208	ENST00000592624	CLTCL1	P53675	1640 aa		28.43	■■■□□ 2.14
ATP5D-208	ENST00000592624	TONSL	Q96HA7	1378 aa		28.43	■■■□□ 2.14
ATP5D-208	ENST00000592624	NOS1	P29475	1434 aa		28.41	■■■□□ 2.14
ATP5D-208	ENST00000592624	SYNM	O15061	1565 aa		28.38	■■■□□ 2.13
ATP5D-208	ENST00000592624	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
ATP5D-208	ENST00000592624	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.37	■■■□□ 2.13
ATP5D-208	ENST00000592624	KIF1B	O60333	1816 aa		28.37	■■■□□ 2.13
ATP5D-208	ENST00000592624	PTPRM	P28827	1452 aa		28.36	■■■□□ 2.13
ATP5D-208	ENST00000592624	ERVK-7	P63135	1459 aa		28.36	■■■□□ 2.13
ATP5D-208	ENST00000592624	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		28.36	■■■□□ 2.13
ATP5D-208	ENST00000592624	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.35	■■■□□ 2.13
ATP5D-208	ENST00000592624	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.34	■■■□□ 2.13
ATP5D-208	ENST00000592624	C3	P01024	1663 aa		28.34	■■■□□ 2.13
ATP5D-208	ENST00000592624	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		28.33	■■■□□ 2.12
ATP5D-208	ENST00000592624	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
ATP5D-208	ENST00000592624	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
ATP5D-208	ENST00000592624	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		28.28	■■■□□ 2.12
ATP5D-208	ENST00000592624	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		28.28	■■■□□ 2.12
ATP5D-208	ENST00000592624	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		28.27	■■■□□ 2.12
ATP5D-208	ENST00000592624	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
ATP5D-208	ENST00000592624	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
ATP5D-208	ENST00000592624	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.24	■■■□□ 2.11
ATP5D-208	ENST00000592624	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.22	■■■□□ 2.11
ATP5D-208	ENST00000592624	RGL3	Q3MIN7	710 aa		28.2	■■■□□ 2.11
ATP5D-208	ENST00000592624	IDI1	Q13907	227 aa		28.2	■■■□□ 2.1
ATP5D-208	ENST00000592624	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.19	■■■□□ 2.1
ATP5D-208	ENST00000592624	TNR	Q92752	1358 aa		28.18	■■■□□ 2.1
ATP5D-208	ENST00000592624	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.17	■■■□□ 2.1
ATP5D-208	ENST00000592624	IFT172	Q9UG01	1749 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ATP5D-208	ENST00000592624	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
ATP5D-208	ENST00000592624	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		28.14	■■■□□ 2.1
ATP5D-208	ENST00000592624	PPL	O60437	1756 aa		28.12	■■■□□ 2.09
ATP5D-208	ENST00000592624	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
ATP5D-208	ENST00000592624	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		28.09	■■■□□ 2.09
ATP5D-208	ENST00000592624	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.09	■■■□□ 2.09
ATP5D-208	ENST00000592624	NLRP1	Q9C000	1473 aa		28.09	■■■□□ 2.09
ATP5D-208	ENST00000592624	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
ATP5D-208	ENST00000592624	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ATP5D-208	ENST00000592624	STAC3	Q96MF2	364 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ATP5D-208	ENST00000592624	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ATP5D-208	ENST00000592624	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ATP5D-208	ENST00000592624	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ATP5D-208	ENST00000592624	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ATP5D-208	ENST00000592624	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08

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