RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591651.5

SPHK1-208, Transcript of sphingosine kinase 1, human

TSL 4

Gene SPHK1, Length 541 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPHK1-208	ENST00000591651	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
SPHK1-208	ENST00000591651	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SPHK1-208	ENST00000591651	ROCK1	Q13464	1354 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SPHK1-208	ENST00000591651	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SPHK1-208	ENST00000591651	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
SPHK1-208	ENST00000591651	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SPHK1-208	ENST00000591651	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SPHK1-208	ENST00000591651	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SPHK1-208	ENST00000591651	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SPHK1-208	ENST00000591651	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SPHK1-208	ENST00000591651	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SPHK1-208	ENST00000591651	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SPHK1-208	ENST00000591651	C3	P01024	1663 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SPHK1-208	ENST00000591651	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SPHK1-208	ENST00000591651	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
SPHK1-208	ENST00000591651	ABCC3	O15438	1527 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SPHK1-208	ENST00000591651	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	31.64	■■■□□ 2.66	3e-7	■■□□□ 13.1
SPHK1-208	ENST00000591651	KANK1	Q14678	1352 aa		31.63	■■■□□ 2.65
SPHK1-208	ENST00000591651	DEPDC5	O75140	1603 aa		31.63	■■■□□ 2.65
SPHK1-208	ENST00000591651	NPAT	Q14207	1427 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SPHK1-208	ENST00000591651	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
SPHK1-208	ENST00000591651	PZP	P20742	1482 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SPHK1-208	ENST00000591651	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SPHK1-208	ENST00000591651	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SPHK1-208	ENST00000591651	NAIP	Q13075	1403 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SPHK1-208	ENST00000591651	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SPHK1-208	ENST00000591651	HFM1	A2PYH4	1435 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SPHK1-208	ENST00000591651	CEP152	O94986	1710 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SPHK1-208	ENST00000591651	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SPHK1-208	ENST00000591651	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SPHK1-208	ENST00000591651	UNC13B	O14795	1591 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SPHK1-208	ENST00000591651	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
SPHK1-208	ENST00000591651	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SPHK1-208	ENST00000591651	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
SPHK1-208	ENST00000591651	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SPHK1-208	ENST00000591651	TNR	Q92752	1358 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SPHK1-208	ENST00000591651	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SPHK1-208	ENST00000591651	NUP155	O75694	1391 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SPHK1-208	ENST00000591651	ERVK-7	P63135	1459 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SPHK1-208	ENST00000591651	HSPA2	P54652	639 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SPHK1-208	ENST00000591651	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SPHK1-208	ENST00000591651	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SPHK1-208	ENST00000591651	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SPHK1-208	ENST00000591651	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SPHK1-208	ENST00000591651	TET3	O43151	1660 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SPHK1-208	ENST00000591651	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
SPHK1-208	ENST00000591651	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
SPHK1-208	ENST00000591651	NLRP1	Q9C000	1473 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SPHK1-208	ENST00000591651	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SPHK1-208	ENST00000591651	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
SPHK1-208	ENST00000591651	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SPHK1-208	ENST00000591651	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		31.26	■■■□□ 2.6
SPHK1-208	ENST00000591651	NOS1	P29475	1434 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SPHK1-208	ENST00000591651	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
SPHK1-208	ENST00000591651	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
SPHK1-208	ENST00000591651	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		31.2	■■■□□ 2.58
SPHK1-208	ENST00000591651		E9PCH4	1651 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SPHK1-208	ENST00000591651	SYNM	O15061	1565 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SPHK1-208	ENST00000591651	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
SPHK1-208	ENST00000591651	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SPHK1-208	ENST00000591651	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SPHK1-208	ENST00000591651	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SPHK1-208	ENST00000591651	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
SPHK1-208	ENST00000591651	IDI1	Q13907	227 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SPHK1-208	ENST00000591651	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SPHK1-208	ENST00000591651	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SPHK1-208	ENST00000591651	PKD2	Q13563	968 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SPHK1-208	ENST00000591651	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SPHK1-208	ENST00000591651	PIK3C2B	O00750	1634 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SPHK1-208	ENST00000591651	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SPHK1-208	ENST00000591651	PTPRT	O14522	1441 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SPHK1-208	ENST00000591651	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		31.06	■■■□□ 2.56
SPHK1-208	ENST00000591651	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		31.05	■■■□□ 2.56
SPHK1-208	ENST00000591651	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.03	■■■□□ 2.56
SPHK1-208	ENST00000591651	HRC	P23327	699 aa		31.03	■■■□□ 2.56
SPHK1-208	ENST00000591651	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		31.03	■■■□□ 2.56
SPHK1-208	ENST00000591651	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	31.01	■■■□□ 2.55
SPHK1-208	ENST00000591651	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		31	■■■□□ 2.55
SPHK1-208	ENST00000591651	SLIT1	O75093	1534 aa		30.98	■■■□□ 2.55
SPHK1-208	ENST00000591651	TRPM2	O94759	1503 aa		30.98	■■■□□ 2.55
SPHK1-208	ENST00000591651	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		30.98	■■■□□ 2.55
SPHK1-208	ENST00000591651	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		30.98	■■■□□ 2.55
SPHK1-208	ENST00000591651	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	30.97	■■■□□ 2.55
SPHK1-208	ENST00000591651	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	30.96	■■■□□ 2.55
SPHK1-208	ENST00000591651	EID1	Q9Y6B2	187 aa		30.95	■■■□□ 2.55
SPHK1-208	ENST00000591651	FOXD1	Q16676	465 aa		30.94	■■■□□ 2.54
SPHK1-208	ENST00000591651	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	30.94	■■■□□ 2.54
SPHK1-208	ENST00000591651	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	30.93	■■■□□ 2.54
SPHK1-208	ENST00000591651	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		30.92	■■■□□ 2.54
SPHK1-208	ENST00000591651	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		30.92	■■■□□ 2.54
SPHK1-208	ENST00000591651	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		30.91	■■■□□ 2.54
SPHK1-208	ENST00000591651	MED14	O60244	1454 aa		30.91	■■■□□ 2.54
SPHK1-208	ENST00000591651	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	30.9	■■■□□ 2.54
SPHK1-208	ENST00000591651	LTK	P29376	864 aa		30.9	■■■□□ 2.54
SPHK1-208	ENST00000591651	CLTCL1	P53675	1640 aa		30.87	■■■□□ 2.53
SPHK1-208	ENST00000591651	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	30.85	■■■□□ 2.53
SPHK1-208	ENST00000591651	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		30.84	■■■□□ 2.53
SPHK1-208	ENST00000591651	ZFYVE9	O95405	1425 aa		30.83	■■■□□ 2.53
SPHK1-208	ENST00000591651	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		30.82	■■■□□ 2.52
SPHK1-208	ENST00000591651	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	30.81	■■■□□ 2.52

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