RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586773.5

CIRBP-211, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-211ENST00000586773 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.67■■■□□ 2.66
CIRBP-211ENST00000586773 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.67■■■□□ 2.66
CIRBP-211ENST00000586773 KIF15Q9NS87 1388 aa31.67■■■□□ 2.66
CIRBP-211ENST00000586773 NPATQ14207 1427 aa31.66■■■□□ 2.66
CIRBP-211ENST00000586773 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
CIRBP-211ENST00000586773 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
CIRBP-211ENST00000586773 HSPA2P54652 639 aa31.65■■■□□ 2.66
CIRBP-211ENST00000586773 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.64■■■□□ 2.66
CIRBP-211ENST00000586773 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.62■■■□□ 2.65
CIRBP-211ENST00000586773 ERBINQ96RT1 1412 aa31.59■■■□□ 2.65
CIRBP-211ENST00000586773 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
CIRBP-211ENST00000586773 PTPRKQ15262 1439 aa31.56■■■□□ 2.64
CIRBP-211ENST00000586773 NCOA1Q15788 1441 aa31.55■■■□□ 2.64
CIRBP-211ENST00000586773 ADGRL2O95490 1459 aa31.52■■■□□ 2.64
CIRBP-211ENST00000586773 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
CIRBP-211ENST00000586773 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.5■■■□□ 2.635e-6■■■□□ 18.7
CIRBP-211ENST00000586773 PZPP20742 1482 aa31.48■■■□□ 2.63
CIRBP-211ENST00000586773 KANK1Q14678 1352 aa31.46■■■□□ 2.63
CIRBP-211ENST00000586773 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.46■■■□□ 2.63
CIRBP-211ENST00000586773 ABCC3O15438 1527 aa31.45■■■□□ 2.63
CIRBP-211ENST00000586773 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.44■■■□□ 2.621e-19■□□□□ 10
CIRBP-211ENST00000586773 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.44■■■□□ 2.62
CIRBP-211ENST00000586773 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CIRBP-211ENST00000586773 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.42■■■□□ 2.62
CIRBP-211ENST00000586773 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
CIRBP-211ENST00000586773 TNRQ92752 1358 aa31.42■■■□□ 2.62
CIRBP-211ENST00000586773 ITGAEP38570 1179 aa31.41■■■□□ 2.62
CIRBP-211ENST00000586773 ROCK1Q13464 1354 aa31.4■■■□□ 2.62
CIRBP-211ENST00000586773 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.39■■■□□ 2.62
CIRBP-211ENST00000586773 DEPDC5O75140 1603 aa31.38■■■□□ 2.61
CIRBP-211ENST00000586773 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
CIRBP-211ENST00000586773 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
CIRBP-211ENST00000586773 CEP152O94986 1710 aa31.37■■■□□ 2.61
CIRBP-211ENST00000586773 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.35■■■□□ 2.61
CIRBP-211ENST00000586773 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
CIRBP-211ENST00000586773 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.34■■■□□ 2.61
CIRBP-211ENST00000586773 STRCQ7RTU9 1775 aa31.33■■■□□ 2.61
CIRBP-211ENST00000586773 NLRP1Q9C000 1473 aa31.31■■■□□ 2.6
CIRBP-211ENST00000586773 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.31■■■□□ 2.6
CIRBP-211ENST00000586773 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.28■■■□□ 2.6
CIRBP-211ENST00000586773 ERVK-7P63135 1459 aa31.27■■■□□ 2.6
CIRBP-211ENST00000586773 PLA2R1Q13018 1463 aa31.27■■■□□ 2.6
CIRBP-211ENST00000586773 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.26■■■□□ 2.59
CIRBP-211ENST00000586773 PKD2Q13563 968 aa31.26■■■□□ 2.59
CIRBP-211ENST00000586773 PTPRTO14522 1441 aa31.25■■■□□ 2.59
CIRBP-211ENST00000586773 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
CIRBP-211ENST00000586773 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.25■■■□□ 2.59
CIRBP-211ENST00000586773 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
CIRBP-211ENST00000586773 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.21■■■□□ 2.59
CIRBP-211ENST00000586773 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.2■■■□□ 2.58
CIRBP-211ENST00000586773 UNC13BO14795 1591 aa31.16■■■□□ 2.58
CIRBP-211ENST00000586773 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.14■■■□□ 2.58
CIRBP-211ENST00000586773 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.14■■■□□ 2.58
CIRBP-211ENST00000586773 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
CIRBP-211ENST00000586773 TET3O43151 1660 aa31.1■■■□□ 2.57
CIRBP-211ENST00000586773 NUP155O75694 1391 aa31.09■■■□□ 2.57
CIRBP-211ENST00000586773 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.08■■■□□ 2.57
CIRBP-211ENST00000586773 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.06■■■□□ 2.56
CIRBP-211ENST00000586773 CERKQ8TCT0 537 aa31.06■■■□□ 2.56
CIRBP-211ENST00000586773 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CIRBP-211ENST00000586773 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.05■■■□□ 2.56
CIRBP-211ENST00000586773 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.05■■■□□ 2.56
CIRBP-211ENST00000586773 NOS1P29475 1434 aa31.04■■■□□ 2.56
CIRBP-211ENST00000586773 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
CIRBP-211ENST00000586773 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.03■■■□□ 2.56
CIRBP-211ENST00000586773 NAIPQ13075 1403 aa31.02■■■□□ 2.56
CIRBP-211ENST00000586773 IDI1Q13907 227 aa31.01■■■□□ 2.55
CIRBP-211ENST00000586773 FBXO41Q8TF61 875 aa31.01■■■□□ 2.55
CIRBP-211ENST00000586773 HFM1A2PYH4 1435 aa30.99■■■□□ 2.55
CIRBP-211ENST00000586773 PIK3C2BO00750 1634 aa30.98■■■□□ 2.55
CIRBP-211ENST00000586773 SYNMO15061 1565 aa30.98■■■□□ 2.55
CIRBP-211ENST00000586773 EID1Q9Y6B2 187 aa30.97■■■□□ 2.55
CIRBP-211ENST00000586773 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
CIRBP-211ENST00000586773 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.96■■■□□ 2.55
CIRBP-211ENST00000586773 MED14O60244 1454 aa30.95■■■□□ 2.55
CIRBP-211ENST00000586773 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
CIRBP-211ENST00000586773 E9PCH4 1651 aa30.94■■■□□ 2.54
CIRBP-211ENST00000586773 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.93■■■□□ 2.54
CIRBP-211ENST00000586773 SLIT1O75093 1534 aa30.93■■■□□ 2.54
CIRBP-211ENST00000586773 TRIM52Q96A61 297 aa30.91■■■□□ 2.54
CIRBP-211ENST00000586773 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
CIRBP-211ENST00000586773 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
CIRBP-211ENST00000586773 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.9■■■□□ 2.54
CIRBP-211ENST00000586773 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.9■■■□□ 2.54
CIRBP-211ENST00000586773 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.9■■■□□ 2.54
CIRBP-211ENST00000586773 ADGRB3O60242 1522 aa30.88■■■□□ 2.53
CIRBP-211ENST00000586773 IQGAP1P46940 1657 aa30.87■■■□□ 2.53
CIRBP-211ENST00000586773 LTKP29376 864 aa30.85■■■□□ 2.53
CIRBP-211ENST00000586773 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
CIRBP-211ENST00000586773 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
CIRBP-211ENST00000586773 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.82■■■□□ 2.52
CIRBP-211ENST00000586773 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
CIRBP-211ENST00000586773 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
CIRBP-211ENST00000586773 CPS1P31327 1500 aa30.76■■■□□ 2.51
CIRBP-211ENST00000586773 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.76■■■□□ 2.51
CIRBP-211ENST00000586773 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.76■■■□□ 2.51
CIRBP-211ENST00000586773 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.74■■■□□ 2.51
CIRBP-211ENST00000586773 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
CIRBP-211ENST00000586773 BCANQ96GW7 911 aa30.73■■■□□ 2.51
CIRBP-211ENST00000586773 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms