RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.19■□□□□ 0.02
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GGA3-209ENST00000580646 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15□□□□□ -0.01
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GGA3-209ENST00000580646 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.97□□□□□ -0.01
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GGA3-209ENST00000580646 SLIT1O75093 1534 aa14.8□□□□□ -0.04
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GGA3-209ENST00000580646 E9PCH4 1651 aa14.77□□□□□ -0.05
GGA3-209ENST00000580646 CPS1P31327 1500 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-209ENST00000580646 IQGAP1P46940 1657 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-209ENST00000580646 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-209ENST00000580646 ADGRB3O60242 1522 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-209ENST00000580646 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GGA3-209ENST00000580646 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
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