RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568316.1

RBBP6-211, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6-211ENST00000568316 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.39■■■■□ 3.58
RBBP6-211ENST00000568316 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.37■■■■□ 3.57
RBBP6-211ENST00000568316 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.33■■■■□ 3.57
RBBP6-211ENST00000568316 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
RBBP6-211ENST00000568316 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.56
RBBP6-211ENST00000568316 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.31■■■■□ 3.562e-12■■□□□ 12.6
RBBP6-211ENST00000568316 DEPDC5O75140 1603 aa37.3■■■■□ 3.56
RBBP6-211ENST00000568316 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
RBBP6-211ENST00000568316 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
RBBP6-211ENST00000568316 PPP6R1Q9UPN7 881 aa37.26■■■■□ 3.56
RBBP6-211ENST00000568316 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
RBBP6-211ENST00000568316 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.25■■■■□ 3.55
RBBP6-211ENST00000568316 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.24■■■■□ 3.55
RBBP6-211ENST00000568316 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.23■■■■□ 3.55
RBBP6-211ENST00000568316 UNC13BO14795 1591 aa37.22■■■■□ 3.55
RBBP6-211ENST00000568316 PTPRMP28827 1452 aa37.21■■■■□ 3.55
RBBP6-211ENST00000568316 KANK1Q14678 1352 aa37.21■■■■□ 3.55
RBBP6-211ENST00000568316 ABCC3O15438 1527 aa37.2■■■■□ 3.55
RBBP6-211ENST00000568316 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.2■■■■□ 3.55
RBBP6-211ENST00000568316 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.2■■■■□ 3.55
RBBP6-211ENST00000568316 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.19■■■■□ 3.54
RBBP6-211ENST00000568316 CEP152O94986 1710 aa37.17■■■■□ 3.54
RBBP6-211ENST00000568316 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
RBBP6-211ENST00000568316 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.15■■■■□ 3.54
RBBP6-211ENST00000568316 MROH2AA6NES4 1674 aa37.15■■■■□ 3.54
RBBP6-211ENST00000568316 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
RBBP6-211ENST00000568316 NUP155O75694 1391 aa37.13■■■■□ 3.53
RBBP6-211ENST00000568316 ZMYM3Q14202 1370 aa37.13■■■■□ 3.53
RBBP6-211ENST00000568316 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.11■■■■□ 3.53
RBBP6-211ENST00000568316 C3P01024 1663 aa37.1■■■■□ 3.53
RBBP6-211ENST00000568316 TRIM52Q96A61 297 aa37.08■■■■□ 3.53
RBBP6-211ENST00000568316 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.07■■■■□ 3.53
RBBP6-211ENST00000568316 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.07■■■■□ 3.52
RBBP6-211ENST00000568316 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.06■■■■□ 3.52
RBBP6-211ENST00000568316 PZPP20742 1482 aa37■■■■□ 3.51
RBBP6-211ENST00000568316 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.99■■■■□ 3.51
RBBP6-211ENST00000568316 TET3O43151 1660 aa36.99■■■■□ 3.51
RBBP6-211ENST00000568316 NPATQ14207 1427 aa36.96■■■■□ 3.51
RBBP6-211ENST00000568316 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
RBBP6-211ENST00000568316 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.94■■■■□ 3.5
RBBP6-211ENST00000568316 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.91■■■■□ 3.5
RBBP6-211ENST00000568316 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
RBBP6-211ENST00000568316 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
RBBP6-211ENST00000568316 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
RBBP6-211ENST00000568316 ERVK-7P63135 1459 aa36.88■■■■□ 3.49
RBBP6-211ENST00000568316 E9PCH4 1651 aa36.87■■■■□ 3.49
RBBP6-211ENST00000568316 HRCP23327 699 aa36.87■■■■□ 3.49
RBBP6-211ENST00000568316 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
RBBP6-211ENST00000568316 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.85■■■■□ 3.49
RBBP6-211ENST00000568316 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.83■■■■□ 3.49
RBBP6-211ENST00000568316 TNRQ92752 1358 aa36.83■■■■□ 3.49
RBBP6-211ENST00000568316 PKD2Q13563 968 aa36.81■■■■□ 3.48
RBBP6-211ENST00000568316 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.81■■■■□ 3.48
RBBP6-211ENST00000568316 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
RBBP6-211ENST00000568316 NOS1P29475 1434 aa36.76■■■■□ 3.47
RBBP6-211ENST00000568316 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.74■■■■□ 3.47
RBBP6-211ENST00000568316 FOXD1Q16676 465 aa36.73■■■■□ 3.47
RBBP6-211ENST00000568316 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.73■■■■□ 3.47
RBBP6-211ENST00000568316 SYNMO15061 1565 aa36.73■■■■□ 3.47
RBBP6-211ENST00000568316 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
RBBP6-211ENST00000568316 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.67■■■■□ 3.46
RBBP6-211ENST00000568316 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.67■■■■□ 3.46
RBBP6-211ENST00000568316 NLRP1Q9C000 1473 aa36.66■■■■□ 3.46
RBBP6-211ENST00000568316 PTPRTO14522 1441 aa36.64■■■■□ 3.46
RBBP6-211ENST00000568316 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
RBBP6-211ENST00000568316 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.63■■■■□ 3.45
RBBP6-211ENST00000568316 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.62■■■■□ 3.45
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
RBBP6-211ENST00000568316 PLA2R1Q13018 1463 aa36.6■■■■□ 3.45
RBBP6-211ENST00000568316 IDI1Q13907 227 aa36.59■■■■□ 3.45
RBBP6-211ENST00000568316 TRPM2O94759 1503 aa36.59■■■■□ 3.45
RBBP6-211ENST00000568316 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.58■■■■□ 3.45
RBBP6-211ENST00000568316 PIK3C2BO00750 1634 aa36.56■■■■□ 3.44
RBBP6-211ENST00000568316 HSPA2P54652 639 aa36.56■■■■□ 3.44
RBBP6-211ENST00000568316 CLTCL1P53675 1640 aa36.52■■■■□ 3.44
RBBP6-211ENST00000568316 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.5■■■■□ 3.43
RBBP6-211ENST00000568316 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.48■■■■□ 3.43
RBBP6-211ENST00000568316 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
RBBP6-211ENST00000568316 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
RBBP6-211ENST00000568316 ADGRB3O60242 1522 aa36.47■■■■□ 3.43
RBBP6-211ENST00000568316 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.44■■■■□ 3.42
RBBP6-211ENST00000568316 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.44■■■■□ 3.42
RBBP6-211ENST00000568316 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
RBBP6-211ENST00000568316 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.41■■■■□ 3.42
RBBP6-211ENST00000568316 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
RBBP6-211ENST00000568316 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.38■■■■□ 3.41
RBBP6-211ENST00000568316 KIF1BO60333 1816 aa36.34■■■■□ 3.41
RBBP6-211ENST00000568316 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.31■■■■□ 3.4
RBBP6-211ENST00000568316 SLIT1O75093 1534 aa36.29■■■■□ 3.4
RBBP6-211ENST00000568316 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.29■■■■□ 3.4
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
RBBP6-211ENST00000568316 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.28■■■■□ 3.4
RBBP6-211ENST00000568316 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.25■■■■□ 3.39
RBBP6-211ENST00000568316 STRCQ7RTU9 1775 aa36.25■■■■□ 3.39
RBBP6-211ENST00000568316 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.24■■■■□ 3.39
RBBP6-211ENST00000568316 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.23■■■■□ 3.39
RBBP6-211ENST00000568316 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.22■■■■□ 3.39
RBBP6-211ENST00000568316 ZFYVE9O95405 1425 aa36.21■■■■□ 3.39
RBBP6-211ENST00000568316 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
RBBP6-211ENST00000568316 LTKP29376 864 aa36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms