RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		25.02	■■□□□ 1.6
RRN3-205	ENST00000563559	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	25.02	■■□□□ 1.6
RRN3-205	ENST00000563559	UNC13B	O14795	1591 aa		25.01	■■□□□ 1.59
RRN3-205	ENST00000563559	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		25.01	■■□□□ 1.59
RRN3-205	ENST00000563559	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		25	■■□□□ 1.59
RRN3-205	ENST00000563559	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	24.99	■■□□□ 1.59
RRN3-205	ENST00000563559	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		24.99	■■□□□ 1.59
RRN3-205	ENST00000563559	PLXNC1	O60486	1568 aa		24.98	■■□□□ 1.59
RRN3-205	ENST00000563559	ABCC2	Q92887	1545 aa		24.98	■■□□□ 1.59
RRN3-205	ENST00000563559	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		24.96	■■□□□ 1.59
RRN3-205	ENST00000563559	TMC1	Q8TDI8	760 aa		24.96	■■□□□ 1.59
RRN3-205	ENST00000563559	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		24.96	■■□□□ 1.59
RRN3-205	ENST00000563559	RALBP1	Q15311	655 aa		24.95	■■□□□ 1.59
RRN3-205	ENST00000563559	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	24.95	■■□□□ 1.58
RRN3-205	ENST00000563559	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		24.94	■■□□□ 1.58
RRN3-205	ENST00000563559	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	24.93	■■□□□ 1.58
RRN3-205	ENST00000563559	NUDC	Q9Y266	331 aa		24.93	■■□□□ 1.58
RRN3-205	ENST00000563559	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		24.93	■■□□□ 1.58
RRN3-205	ENST00000563559		E9PCH4	1651 aa		24.92	■■□□□ 1.58
RRN3-205	ENST00000563559	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		24.91	■■□□□ 1.58
RRN3-205	ENST00000563559	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	24.91	■■□□□ 1.58
RRN3-205	ENST00000563559	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		24.9	■■□□□ 1.58
RRN3-205	ENST00000563559	LAMC1	P11047	1609 aa		24.89	■■□□□ 1.58
RRN3-205	ENST00000563559	ATP10A	O60312	1499 aa		24.88	■■□□□ 1.57
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2R1	Q13018	1463 aa		24.88	■■□□□ 1.57
RRN3-205	ENST00000563559	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		24.88	■■□□□ 1.57
RRN3-205	ENST00000563559	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	24.88	■■□□□ 1.57
RRN3-205	ENST00000563559	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		24.87	■■□□□ 1.57
RRN3-205	ENST00000563559	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	24.87	■■□□□ 1.57
RRN3-205	ENST00000563559	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		24.86	■■□□□ 1.57
RRN3-205	ENST00000563559	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		24.86	■■□□□ 1.57
RRN3-205	ENST00000563559	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	24.85	■■□□□ 1.57
RRN3-205	ENST00000563559	PLCH2	O75038	1416 aa		24.85	■■□□□ 1.57
RRN3-205	ENST00000563559	A2M	P01023	1474 aa		24.84	■■□□□ 1.57
RRN3-205	ENST00000563559	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	24.84	■■□□□ 1.57	1e-10	■■□□□ 14.2
RRN3-205	ENST00000563559	RGL3	Q3MIN7	710 aa		24.82	■■□□□ 1.56
RRN3-205	ENST00000563559	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		24.82	■■□□□ 1.56
RRN3-205	ENST00000563559	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		24.81	■■□□□ 1.56
RRN3-205	ENST00000563559	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		24.81	■■□□□ 1.56
RRN3-205	ENST00000563559	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	24.81	■■□□□ 1.56
RRN3-205	ENST00000563559	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		24.8	■■□□□ 1.56
RRN3-205	ENST00000563559	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		24.8	■■□□□ 1.56
RRN3-205	ENST00000563559	NLRP13	Q86W25	1043 aa		24.79	■■□□□ 1.56
RRN3-205	ENST00000563559	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		24.79	■■□□□ 1.56
RRN3-205	ENST00000563559	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	24.78	■■□□□ 1.56
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		24.77	■■□□□ 1.56
RRN3-205	ENST00000563559	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	24.76	■■□□□ 1.55
RRN3-205	ENST00000563559	ABCC1	P33527	1531 aa		24.75	■■□□□ 1.55
RRN3-205	ENST00000563559	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	24.72	■■□□□ 1.55
RRN3-205	ENST00000563559	TESK2	Q96S53	571 aa		24.72	■■□□□ 1.55
RRN3-205	ENST00000563559	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		24.71	■■□□□ 1.55
RRN3-205	ENST00000563559	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		24.71	■■□□□ 1.55
RRN3-205	ENST00000563559	TMF1	P82094	1093 aa		24.7	■■□□□ 1.54
RRN3-205	ENST00000563559	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		24.7	■■□□□ 1.54
RRN3-205	ENST00000563559	INSR	P06213	1382 aa		24.7	■■□□□ 1.54
RRN3-205	ENST00000563559	PDE3B	Q13370	1112 aa		24.68	■■□□□ 1.54
RRN3-205	ENST00000563559	STAC3	Q96MF2	364 aa		24.68	■■□□□ 1.54
RRN3-205	ENST00000563559	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		24.68	■■□□□ 1.54
RRN3-205	ENST00000563559	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	24.67	■■□□□ 1.54
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		24.67	■■□□□ 1.54
RRN3-205	ENST00000563559	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		24.66	■■□□□ 1.54
RRN3-205	ENST00000563559	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		24.66	■■□□□ 1.54
RRN3-205	ENST00000563559	MSH5	O43196	834 aa		24.65	■■□□□ 1.54
RRN3-205	ENST00000563559	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	24.65	■■□□□ 1.54
RRN3-205	ENST00000563559	TRPM2	O94759	1503 aa		24.61	■■□□□ 1.53
RRN3-205	ENST00000563559	PANK3	Q9H999	370 aa		24.61	■■□□□ 1.53
RRN3-205	ENST00000563559	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		24.6	■■□□□ 1.53
RRN3-205	ENST00000563559	MADD	Q8WXG6	1647 aa		24.58	■■□□□ 1.53
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRT	O14522	1441 aa		24.58	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		24.58	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	DEPDC5	O75140	1603 aa		24.57	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	24.56	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	CDCA8	Q53HL2	280 aa		24.56	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		24.56	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	CEP152	O94986	1710 aa		24.56	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	24.55	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		24.55	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	24.54	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		24.54	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	KANK1	Q14678	1352 aa		24.54	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	IQGAP1	P46940	1657 aa		24.54	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		24.53	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	TET3	O43151	1660 aa		24.53	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	AFAP1	Q8N556	730 aa		24.53	■■□□□ 1.52
RRN3-205	ENST00000563559	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	24.51	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		24.51	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		24.5	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	ATP7A	Q04656	1500 aa		24.49	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	24.48	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		24.48	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	CLTCL1	P53675	1640 aa		24.48	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		24.48	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	FANCA	O15360	1455 aa		24.47	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		24.47	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	24.47	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	SLC24A1	O60721	1099 aa		24.47	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	SYNM	O15061	1565 aa		24.46	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		24.45	■■□□□ 1.51
RRN3-205	ENST00000563559	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	24.45	■■□□□ 1.5
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRL1	O94910	1474 aa		24.4	■■□□□ 1.5

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