RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561610.1

PPP4C-202, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-202ENST00000561610 PLXNC1O60486 1568 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP4C-202ENST00000561610 KIF3BO15066 747 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP4C-202ENST00000561610 KIF15Q9NS87 1388 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP4C-202ENST00000561610 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.121e-10■■□□□ 12.5
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PPP4C-202ENST00000561610 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP4C-202ENST00000561610 STRCQ7RTU9 1775 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP4C-202ENST00000561610 PTPRKQ15262 1439 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP4C-202ENST00000561610 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PPP4C-202ENST00000561610 NCOA1Q15788 1441 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4C-202ENST00000561610 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4C-202ENST00000561610 ADGRL2O95490 1459 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP4C-202ENST00000561610 ERBINQ96RT1 1412 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4C-202ENST00000561610 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PPP4C-202ENST00000561610 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
PPP4C-202ENST00000561610 ROCK1Q13464 1354 aa28.16■■■□□ 2.1
PPP4C-202ENST00000561610 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PPP4C-202ENST00000561610 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.14■■■□□ 2.1
PPP4C-202ENST00000561610 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.14■■■□□ 2.09
PPP4C-202ENST00000561610 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.14■■■□□ 2.09
PPP4C-202ENST00000561610 PTPRTO14522 1441 aa28.13■■■□□ 2.09
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PPP4C-202ENST00000561610 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PPP4C-202ENST00000561610 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.09■■■□□ 2.09
PPP4C-202ENST00000561610 KANK1Q14678 1352 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP4C-202ENST00000561610 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP4C-202ENST00000561610 C3P01024 1663 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP4C-202ENST00000561610 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP4C-202ENST00000561610 ZMYM3Q14202 1370 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP4C-202ENST00000561610 MROH2AA6NES4 1674 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP4C-202ENST00000561610 CEP152O94986 1710 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP4C-202ENST00000561610 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP4C-202ENST00000561610 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28■■■□□ 2.07
PPP4C-202ENST00000561610 DEPDC5O75140 1603 aa28■■■□□ 2.07
PPP4C-202ENST00000561610 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
PPP4C-202ENST00000561610 ABCC3O15438 1527 aa27.99■■■□□ 2.07
PPP4C-202ENST00000561610 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
PPP4C-202ENST00000561610 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PPP4C-202ENST00000561610 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.98■■■□□ 2.07
PPP4C-202ENST00000561610 NAIPQ13075 1403 aa27.96■■■□□ 2.07
PPP4C-202ENST00000561610 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.94■■■□□ 2.06
PPP4C-202ENST00000561610 HFM1A2PYH4 1435 aa27.94■■■□□ 2.06
PPP4C-202ENST00000561610 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.94■■■□□ 2.06
PPP4C-202ENST00000561610 TRIM52Q96A61 297 aa27.92■■■□□ 2.06
PPP4C-202ENST00000561610 UNC13BO14795 1591 aa27.91■■■□□ 2.06
PPP4C-202ENST00000561610 NUP155O75694 1391 aa27.91■■■□□ 2.06
PPP4C-202ENST00000561610 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
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PPP4C-202ENST00000561610 PZPP20742 1482 aa27.89■■■□□ 2.06
PPP4C-202ENST00000561610 NPATQ14207 1427 aa27.86■■■□□ 2.05
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PPP4C-202ENST00000561610 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.85■■■□□ 2.05
PPP4C-202ENST00000561610 TNRQ92752 1358 aa27.83■■■□□ 2.05
PPP4C-202ENST00000561610 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.82■■■□□ 2.04
PPP4C-202ENST00000561610 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.81■■■□□ 2.04
PPP4C-202ENST00000561610 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.81■■■□□ 2.04
PPP4C-202ENST00000561610 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
PPP4C-202ENST00000561610 TET3O43151 1660 aa27.8■■■□□ 2.04
PPP4C-202ENST00000561610 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.79■■■□□ 2.04
PPP4C-202ENST00000561610 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
PPP4C-202ENST00000561610 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.79■■■□□ 2.04
PPP4C-202ENST00000561610 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.78■■■□□ 2.04
PPP4C-202ENST00000561610 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.78■■■□□ 2.04
PPP4C-202ENST00000561610 ERVK-7P63135 1459 aa27.77■■■□□ 2.04
PPP4C-202ENST00000561610 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.73■■■□□ 2.03
PPP4C-202ENST00000561610 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
PPP4C-202ENST00000561610 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
PPP4C-202ENST00000561610 E9PCH4 1651 aa27.7■■■□□ 2.03
PPP4C-202ENST00000561610 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
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PPP4C-202ENST00000561610 HSPA1LP34931 641 aa27.67■■■□□ 2.02
PPP4C-202ENST00000561610 PIP4K2BP78356 416 aa27.67■■■□□ 2.02
PPP4C-202ENST00000561610 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.67■■■□□ 2.02
PPP4C-202ENST00000561610 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.67■■■□□ 2.02
PPP4C-202ENST00000561610 NLRP1Q9C000 1473 aa27.67■■■□□ 2.02
PPP4C-202ENST00000561610 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
PPP4C-202ENST00000561610 PKD2Q13563 968 aa27.65■■■□□ 2.02
PPP4C-202ENST00000561610 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
PPP4C-202ENST00000561610 PLA2R1Q13018 1463 aa27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-202ENST00000561610 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.61■■■□□ 2.01
PPP4C-202ENST00000561610 NOS1P29475 1434 aa27.61■■■□□ 2.01
PPP4C-202ENST00000561610 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
PPP4C-202ENST00000561610 SYNMO15061 1565 aa27.61■■■□□ 2.01
PPP4C-202ENST00000561610 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.6■■■□□ 2.01
PPP4C-202ENST00000561610 IDI1Q13907 227 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4C-202ENST00000561610 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
PPP4C-202ENST00000561610 FOXD1Q16676 465 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-202ENST00000561610 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-202ENST00000561610 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-202ENST00000561610 PIK3C2BO00750 1634 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-202ENST00000561610 TOM1O60784 492 aa27.52■■■□□ 2
PPP4C-202ENST00000561610 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.52■■■□□ 2
PPP4C-202ENST00000561610 HRCP23327 699 aa27.5■■□□□ 1.99
PPP4C-202ENST00000561610 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.47■■□□□ 1.99
PPP4C-202ENST00000561610 ADGRB3O60242 1522 aa27.47■■□□□ 1.99
PPP4C-202ENST00000561610 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
PPP4C-202ENST00000561610 CPS1P31327 1500 aa27.46■■□□□ 1.99
PPP4C-202ENST00000561610 TRPM2O94759 1503 aa27.44■■□□□ 1.98
PPP4C-202ENST00000561610 EID1Q9Y6B2 187 aa27.43■■□□□ 1.98
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