RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561029.1

ANKRD17-210, Transcript of ankyrin repeat domain 17, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD17, Length 2,717 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD17-210ENST00000561029 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
ANKRD17-210ENST00000561029 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
ANKRD17-210ENST00000561029 IL27Q8NEV9 243 aa29.06■■■□□ 2.24
ANKRD17-210ENST00000561029 MBD5Q9P267 1494 aa29.06■■■□□ 2.24
ANKRD17-210ENST00000561029 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
ANKRD17-210ENST00000561029 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
ANKRD17-210ENST00000561029 NEFMP07197 916 aa29.02■■■□□ 2.24
ANKRD17-210ENST00000561029 PDE4AP27815 886 aa29.02■■■□□ 2.24
ANKRD17-210ENST00000561029 KDM5CP41229 1560 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD17-210ENST00000561029 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
ANKRD17-210ENST00000561029 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
ANKRD17-210ENST00000561029 KIF15Q9NS87 1388 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD17-210ENST00000561029 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.99■■■□□ 2.23
ANKRD17-210ENST00000561029 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.98■■■□□ 2.23
ANKRD17-210ENST00000561029 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
ANKRD17-210ENST00000561029 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD17-210ENST00000561029 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
ANKRD17-210ENST00000561029 BACH2Q9BYV9 841 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD17-210ENST00000561029 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
ANKRD17-210ENST00000561029 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
ANKRD17-210ENST00000561029 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.93■■■□□ 2.22
ANKRD17-210ENST00000561029 USP35Q9P2H5 1018 aa28.92■■■□□ 2.22
ANKRD17-210ENST00000561029 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD17-210ENST00000561029 MS4A1P11836 297 aa28.89■■■□□ 2.21
ANKRD17-210ENST00000561029 RALBP1Q15311 655 aa28.88■■■□□ 2.21
ANKRD17-210ENST00000561029 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.87■■■□□ 2.21
ANKRD17-210ENST00000561029 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.86■■■□□ 2.21
ANKRD17-210ENST00000561029 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
ANKRD17-210ENST00000561029 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.86■■■□□ 2.21
ANKRD17-210ENST00000561029 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.86■■■□□ 2.21
ANKRD17-210ENST00000561029 CHD1O14646 1710 aa28.86■■■□□ 2.21
ANKRD17-210ENST00000561029 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD17-210ENST00000561029 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD17-210ENST00000561029 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.84■■■□□ 2.21
ANKRD17-210ENST00000561029 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.84■■■□□ 2.21
ANKRD17-210ENST00000561029 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
ANKRD17-210ENST00000561029 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.24e-7■■■□□ 14.8
ANKRD17-210ENST00000561029 PREX2Q70Z35 1606 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD17-210ENST00000561029 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD17-210ENST00000561029 PDE3BQ13370 1112 aa28.79■■■□□ 2.2
ANKRD17-210ENST00000561029 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.78■■■□□ 2.2
ANKRD17-210ENST00000561029 SKAP1Q86WV1 359 aa28.78■■■□□ 2.2
ANKRD17-210ENST00000561029 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.78■■■□□ 2.2
ANKRD17-210ENST00000561029 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.78■■■□□ 2.2
ANKRD17-210ENST00000561029 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD17-210ENST00000561029 PLIN1O60240 522 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD17-210ENST00000561029 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD17-210ENST00000561029 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.76■■■□□ 2.2
ANKRD17-210ENST00000561029 NLRP13Q86W25 1043 aa28.76■■■□□ 2.19
ANKRD17-210ENST00000561029 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.75■■■□□ 2.19
ANKRD17-210ENST00000561029 RGL3Q3MIN7 710 aa28.75■■■□□ 2.19
ANKRD17-210ENST00000561029 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.74■■■□□ 2.19
ANKRD17-210ENST00000561029 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.74■■■□□ 2.19
ANKRD17-210ENST00000561029 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.191e-7■■■□□ 15.5
ANKRD17-210ENST00000561029 CRBNQ96SW2 442 aa28.71■■■□□ 2.19
ANKRD17-210ENST00000561029 E9PCH4 1651 aa28.69■■■□□ 2.18
ANKRD17-210ENST00000561029 SHROOM2Q13796 1616 aa28.68■■■□□ 2.18
ANKRD17-210ENST00000561029 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.68■■■□□ 2.18
ANKRD17-210ENST00000561029 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
ANKRD17-210ENST00000561029 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.66■■■□□ 2.18
ANKRD17-210ENST00000561029 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.65■■■□□ 2.18
ANKRD17-210ENST00000561029 ABCC2Q92887 1545 aa28.65■■■□□ 2.18
ANKRD17-210ENST00000561029 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.64■■■□□ 2.18
ANKRD17-210ENST00000561029 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.64■■■□□ 2.18
ANKRD17-210ENST00000561029 PLA2R1Q13018 1463 aa28.63■■■□□ 2.17
ANKRD17-210ENST00000561029 GSE1Q14687 1217 aa28.63■■■□□ 2.17
ANKRD17-210ENST00000561029 SLC4A3P48751 1232 aa28.63■■■□□ 2.17
ANKRD17-210ENST00000561029 NFKBIBQ15653 356 aa28.62■■■□□ 2.17
ANKRD17-210ENST00000561029 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.58■■■□□ 2.17
ANKRD17-210ENST00000561029 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
ANKRD17-210ENST00000561029 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
ANKRD17-210ENST00000561029 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.58■■■□□ 2.17
ANKRD17-210ENST00000561029 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.56■■■□□ 2.16
ANKRD17-210ENST00000561029 UNC13BO14795 1591 aa28.56■■■□□ 2.16
ANKRD17-210ENST00000561029 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.56■■■□□ 2.16
ANKRD17-210ENST00000561029 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
ANKRD17-210ENST00000561029 A2MP01023 1474 aa28.53■■■□□ 2.16
ANKRD17-210ENST00000561029 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
ANKRD17-210ENST00000561029 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
ANKRD17-210ENST00000561029 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.51■■■□□ 2.15
ANKRD17-210ENST00000561029 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.5■■■□□ 2.15
ANKRD17-210ENST00000561029 PLCH2O75038 1416 aa28.5■■■□□ 2.15
ANKRD17-210ENST00000561029 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.5■■■□□ 2.15
ANKRD17-210ENST00000561029 PLXNC1O60486 1568 aa28.49■■■□□ 2.15
ANKRD17-210ENST00000561029 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.48■■■□□ 2.15
ANKRD17-210ENST00000561029 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
ANKRD17-210ENST00000561029 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.47■■■□□ 2.15
ANKRD17-210ENST00000561029 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.47■■■□□ 2.15
ANKRD17-210ENST00000561029 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
ANKRD17-210ENST00000561029 INSRP06213 1382 aa28.44■■■□□ 2.14
ANKRD17-210ENST00000561029 FAM161AQ3B820 660 aa28.44■■■□□ 2.14
ANKRD17-210ENST00000561029 AFAP1Q8N556 730 aa28.43■■■□□ 2.14
ANKRD17-210ENST00000561029 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.43■■■□□ 2.14
ANKRD17-210ENST00000561029 PANK3Q9H999 370 aa28.43■■■□□ 2.14
ANKRD17-210ENST00000561029 C8orf34Q49A92 452 aa28.41■■■□□ 2.14
ANKRD17-210ENST00000561029 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.41■■■□□ 2.14
ANKRD17-210ENST00000561029 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.4■■■□□ 2.14
ANKRD17-210ENST00000561029 ERBINQ96RT1 1412 aa28.4■■■□□ 2.14
ANKRD17-210ENST00000561029 TESK2Q96S53 571 aa28.4■■■□□ 2.14
ANKRD17-210ENST00000561029 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms