RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 NCOA1Q15788 1441 aa28.54■■■□□ 2.16
GCSHP2-201ENST00000560971 PTPRKQ15262 1439 aa28.53■■■□□ 2.16
GCSHP2-201ENST00000560971 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.52■■■□□ 2.16
GCSHP2-201ENST00000560971 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
GCSHP2-201ENST00000560971 HSPA2P54652 639 aa28.51■■■□□ 2.15
GCSHP2-201ENST00000560971 ADGRL2O95490 1459 aa28.51■■■□□ 2.15
GCSHP2-201ENST00000560971 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
GCSHP2-201ENST00000560971 ITGAEP38570 1179 aa28.5■■■□□ 2.15
GCSHP2-201ENST00000560971 ERBINQ96RT1 1412 aa28.5■■■□□ 2.15
GCSHP2-201ENST00000560971 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.49■■■□□ 2.15
GCSHP2-201ENST00000560971 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.48■■■□□ 2.15
GCSHP2-201ENST00000560971 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
GCSHP2-201ENST00000560971 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.46■■■□□ 2.15
GCSHP2-201ENST00000560971 NPATQ14207 1427 aa28.45■■■□□ 2.15
GCSHP2-201ENST00000560971 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.44■■■□□ 2.14
GCSHP2-201ENST00000560971 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.44■■■□□ 2.14
GCSHP2-201ENST00000560971 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
GCSHP2-201ENST00000560971 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCC3O15438 1527 aa28.41■■■□□ 2.14
GCSHP2-201ENST00000560971 ROCK1Q13464 1354 aa28.37■■■□□ 2.13
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.37■■■□□ 2.13
GCSHP2-201ENST00000560971 PZPP20742 1482 aa28.37■■■□□ 2.13
GCSHP2-201ENST00000560971 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
GCSHP2-201ENST00000560971 DEPDC5O75140 1603 aa28.35■■■□□ 2.13
GCSHP2-201ENST00000560971 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
GCSHP2-201ENST00000560971 CEP152O94986 1710 aa28.34■■■□□ 2.13
GCSHP2-201ENST00000560971 KANK1Q14678 1352 aa28.31■■■□□ 2.12
GCSHP2-201ENST00000560971 TNRQ92752 1358 aa28.3■■■□□ 2.12
GCSHP2-201ENST00000560971 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.29■■■□□ 2.12
GCSHP2-201ENST00000560971 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.29■■■□□ 2.12
GCSHP2-201ENST00000560971 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.26■■■□□ 2.11
GCSHP2-201ENST00000560971 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
GCSHP2-201ENST00000560971 ERVK-7P63135 1459 aa28.22■■■□□ 2.11
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.22■■■□□ 2.11
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
GCSHP2-201ENST00000560971 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.22■■■□□ 2.11
GCSHP2-201ENST00000560971 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.21■■■□□ 2.11
GCSHP2-201ENST00000560971 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.2■■■□□ 2.11
GCSHP2-201ENST00000560971 STRCQ7RTU9 1775 aa28.19■■■□□ 2.1
GCSHP2-201ENST00000560971 UNC13BO14795 1591 aa28.16■■■□□ 2.1
GCSHP2-201ENST00000560971 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
GCSHP2-201ENST00000560971 NLRP1Q9C000 1473 aa28.15■■■□□ 2.1
GCSHP2-201ENST00000560971 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.13■■■□□ 2.09
GCSHP2-201ENST00000560971 NAIPQ13075 1403 aa28.13■■■□□ 2.09
GCSHP2-201ENST00000560971 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.13■■■□□ 2.09
GCSHP2-201ENST00000560971 NUP155O75694 1391 aa28.11■■■□□ 2.09
GCSHP2-201ENST00000560971 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.1■■■□□ 2.09
GCSHP2-201ENST00000560971 PLA2R1Q13018 1463 aa28.08■■■□□ 2.09
GCSHP2-201ENST00000560971 HFM1A2PYH4 1435 aa28.08■■■□□ 2.09
GCSHP2-201ENST00000560971 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.07■■■□□ 2.08
GCSHP2-201ENST00000560971 TET3O43151 1660 aa28.07■■■□□ 2.08
GCSHP2-201ENST00000560971 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
GCSHP2-201ENST00000560971 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.05■■■□□ 2.08
GCSHP2-201ENST00000560971 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.05■■■□□ 2.08
GCSHP2-201ENST00000560971 NOS1P29475 1434 aa28.04■■■□□ 2.08
GCSHP2-201ENST00000560971 PTPRTO14522 1441 aa28.03■■■□□ 2.08
GCSHP2-201ENST00000560971 PKD2Q13563 968 aa28.03■■■□□ 2.08
GCSHP2-201ENST00000560971 SYNMO15061 1565 aa28.03■■■□□ 2.08
GCSHP2-201ENST00000560971 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
GCSHP2-201ENST00000560971 IDI1Q13907 227 aa28■■■□□ 2.07
GCSHP2-201ENST00000560971 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.98■■■□□ 2.07
GCSHP2-201ENST00000560971 E9PCH4 1651 aa27.97■■■□□ 2.07
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.97■■■□□ 2.07
GCSHP2-201ENST00000560971 PIK3C2BO00750 1634 aa27.96■■■□□ 2.07
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIM52Q96A61 297 aa27.95■■■□□ 2.06
GCSHP2-201ENST00000560971 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.94■■■□□ 2.06
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.93■■■□□ 2.06
GCSHP2-201ENST00000560971 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.92■■■□□ 2.06
GCSHP2-201ENST00000560971 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
GCSHP2-201ENST00000560971 LTKP29376 864 aa27.86■■■□□ 2.05
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.86■■■□□ 2.05
GCSHP2-201ENST00000560971 SLIT1O75093 1534 aa27.86■■■□□ 2.05
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.86■■■□□ 2.05
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GCSHP2-201ENST00000560971 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.85■■■□□ 2.05
GCSHP2-201ENST00000560971 ADGRB3O60242 1522 aa27.85■■■□□ 2.05
GCSHP2-201ENST00000560971 MED14O60244 1454 aa27.84■■■□□ 2.05
GCSHP2-201ENST00000560971 CERKQ8TCT0 537 aa27.84■■■□□ 2.05
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
GCSHP2-201ENST00000560971 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
GCSHP2-201ENST00000560971 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.04
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GCSHP2-201ENST00000560971 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.82■■■□□ 2.04
GCSHP2-201ENST00000560971 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
GCSHP2-201ENST00000560971 EID1Q9Y6B2 187 aa27.81■■■□□ 2.04
GCSHP2-201ENST00000560971 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.8■■■□□ 2.04
GCSHP2-201ENST00000560971 IQGAP1P46940 1657 aa27.78■■■□□ 2.04
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GCSHP2-201ENST00000560971 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
GCSHP2-201ENST00000560971 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.77■■■□□ 2.04
GCSHP2-201ENST00000560971 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.74■■■□□ 2.03
GCSHP2-201ENST00000560971 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.73■■■□□ 2.03
GCSHP2-201ENST00000560971 FOXD1Q16676 465 aa27.73■■■□□ 2.03
GCSHP2-201ENST00000560971 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.72■■■□□ 2.03
GCSHP2-201ENST00000560971 TRPM2O94759 1503 aa27.71■■■□□ 2.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ZFYVE9O95405 1425 aa27.7■■■□□ 2.03
GCSHP2-201ENST00000560971 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.7■■■□□ 2.03
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXO41Q8TF61 875 aa27.7■■■□□ 2.02
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