RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DEPDC5O75140 1603 aa36.24■■■■□ 3.39
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.2■■■■□ 3.39
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HFM1A2PYH4 1435 aa36.19■■■■□ 3.38
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NAIPQ13075 1403 aa36.19■■■■□ 3.38
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.19■■■■□ 3.38
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MROH2AA6NES4 1674 aa36.17■■■■□ 3.38
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.17■■■■□ 3.38
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABCC3O15438 1527 aa36.09■■■■□ 3.37
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C3P01024 1663 aa36.09■■■■□ 3.37
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.08■■■■□ 3.37
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.07■■■■□ 3.37
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.05■■■■□ 3.364e-9■■■■□ 24
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.01■■■■□ 3.36
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.99■■■■□ 3.35
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.97■■■■□ 3.35
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.97■■■■□ 3.35
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.96■■■■□ 3.35
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PZPP20742 1482 aa35.92■■■■□ 3.34
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NUP155O75694 1391 aa35.91■■■■□ 3.34
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TET3O43151 1660 aa35.91■■■■□ 3.34
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.89■■■■□ 3.34
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.88■■■■□ 3.33
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NPATQ14207 1427 aa35.87■■■■□ 3.33
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.84■■■■□ 3.33
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.81■■■■□ 3.32
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRIM52Q96A61 297 aa35.8■■■■□ 3.32
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.79■■■■□ 3.32
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ERVK-7P63135 1459 aa35.78■■■■□ 3.32
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 E9PCH4 1651 aa35.78■■■■□ 3.32
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.73■■■■□ 3.31
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TNRQ92752 1358 aa35.72■■■■□ 3.31
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HRCP23327 699 aa35.7■■■■□ 3.31
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.69■■■■□ 3.3
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.66■■■■□ 3.3
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NOS1P29475 1434 aa35.66■■■■□ 3.3
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PKD2Q13563 968 aa35.58■■■■□ 3.29
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.58■■■■□ 3.29
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.57■■■■□ 3.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTPRTO14522 1441 aa35.52■■■■□ 3.28
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRPM2O94759 1503 aa35.49■■■■□ 3.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.47■■■■□ 3.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.46■■■■□ 3.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.46■■■■□ 3.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.45■■■■□ 3.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HSPA2P54652 639 aa35.43■■■■□ 3.26
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FOXD1Q16676 465 aa35.43■■■■□ 3.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADGRB3O60242 1522 aa35.41■■■■□ 3.26
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STRCQ7RTU9 1775 aa35.29■■■■□ 3.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.28■■■■□ 3.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLIT1O75093 1534 aa35.27■■■■□ 3.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.25■■■■□ 3.23
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.25■■■■□ 3.23
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.22■■■■□ 3.23
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.16■■■■□ 3.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.16■■■■□ 3.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.16■■■■□ 3.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZFYVE9O95405 1425 aa35.14■■■■□ 3.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.13■■■■□ 3.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EID1Q9Y6B2 187 aa35.11■■■■□ 3.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MED14O60244 1454 aa35.09■■■■□ 3.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.09■■■■□ 3.21
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