RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554698.5

SDR39U1-208, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDR39U1, Length 1,364 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDR39U1-208	ENST00000554698	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SDR39U1-208	ENST00000554698	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SDR39U1-208	ENST00000554698	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SDR39U1-208	ENST00000554698	NAIP	Q13075	1403 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SDR39U1-208	ENST00000554698	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
SDR39U1-208	ENST00000554698	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SDR39U1-208	ENST00000554698	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SDR39U1-208	ENST00000554698	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
SDR39U1-208	ENST00000554698	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SDR39U1-208	ENST00000554698	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SDR39U1-208	ENST00000554698	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SDR39U1-208	ENST00000554698	ABCC3	O15438	1527 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SDR39U1-208	ENST00000554698	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SDR39U1-208	ENST00000554698	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SDR39U1-208	ENST00000554698	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.24	■■■□□ 2.75	6e-6	■□□□□ 8.3
SDR39U1-208	ENST00000554698	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SDR39U1-208	ENST00000554698	KANK1	Q14678	1352 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SDR39U1-208	ENST00000554698	UNC13B	O14795	1591 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
SDR39U1-208	ENST00000554698	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
SDR39U1-208	ENST00000554698	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
SDR39U1-208	ENST00000554698	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SDR39U1-208	ENST00000554698	C3	P01024	1663 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SDR39U1-208	ENST00000554698	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SDR39U1-208	ENST00000554698	PZP	P20742	1482 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SDR39U1-208	ENST00000554698	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SDR39U1-208	ENST00000554698	CEP152	O94986	1710 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SDR39U1-208	ENST00000554698	NUP155	O75694	1391 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SDR39U1-208	ENST00000554698	NPAT	Q14207	1427 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SDR39U1-208	ENST00000554698	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SDR39U1-208	ENST00000554698	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
SDR39U1-208	ENST00000554698	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SDR39U1-208	ENST00000554698	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SDR39U1-208	ENST00000554698	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SDR39U1-208	ENST00000554698	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SDR39U1-208	ENST00000554698	TET3	O43151	1660 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SDR39U1-208	ENST00000554698	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	ERVK-7	P63135	1459 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	HRC	P23327	699 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	TNR	Q92752	1358 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SDR39U1-208	ENST00000554698	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
SDR39U1-208	ENST00000554698	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SDR39U1-208	ENST00000554698	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SDR39U1-208	ENST00000554698	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SDR39U1-208	ENST00000554698	NOS1	P29475	1434 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SDR39U1-208	ENST00000554698		E9PCH4	1651 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
SDR39U1-208	ENST00000554698	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SDR39U1-208	ENST00000554698	NLRP1	Q9C000	1473 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SDR39U1-208	ENST00000554698	PKD2	Q13563	968 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SDR39U1-208	ENST00000554698	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SDR39U1-208	ENST00000554698	SYNM	O15061	1565 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SDR39U1-208	ENST00000554698	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SDR39U1-208	ENST00000554698	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SDR39U1-208	ENST00000554698	PTPRT	O14522	1441 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SDR39U1-208	ENST00000554698	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SDR39U1-208	ENST00000554698	HSPA2	P54652	639 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SDR39U1-208	ENST00000554698	IDI1	Q13907	227 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SDR39U1-208	ENST00000554698	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SDR39U1-208	ENST00000554698	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SDR39U1-208	ENST00000554698	PIK3C2B	O00750	1634 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		31.7	■■■□□ 2.66
SDR39U1-208	ENST00000554698	FOXD1	Q16676	465 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SDR39U1-208	ENST00000554698	TRPM2	O94759	1503 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SDR39U1-208	ENST00000554698	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SDR39U1-208	ENST00000554698	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
SDR39U1-208	ENST00000554698	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SDR39U1-208	ENST00000554698	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SDR39U1-208	ENST00000554698	CLTCL1	P53675	1640 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SDR39U1-208	ENST00000554698	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SDR39U1-208	ENST00000554698	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLIT1	O75093	1534 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SDR39U1-208	ENST00000554698	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SDR39U1-208	ENST00000554698	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SDR39U1-208	ENST00000554698	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
SDR39U1-208	ENST00000554698	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SDR39U1-208	ENST00000554698	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SDR39U1-208	ENST00000554698	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZFYVE9	O95405	1425 aa		31.44	■■■□□ 2.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	LTK	P29376	864 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	EID1	Q9Y6B2	187 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	MED14	O60244	1454 aa		31.4	■■■□□ 2.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms