RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548390.5

LETMD1-215, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LETMD1, Length 549 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-215ENST00000548390 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.63■■□□□ 1.69
LETMD1-215ENST00000548390 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.62■■□□□ 1.69
LETMD1-215ENST00000548390 UNC13BO14795 1591 aa25.61■■□□□ 1.69
LETMD1-215ENST00000548390 NUP155O75694 1391 aa25.6■■□□□ 1.69
LETMD1-215ENST00000548390 KIF3BO15066 747 aa25.58■■□□□ 1.69
LETMD1-215ENST00000548390 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.57■■□□□ 1.68
LETMD1-215ENST00000548390 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.57■■□□□ 1.68
LETMD1-215ENST00000548390 AGLP35573 1532 aa25.56■■□□□ 1.68
LETMD1-215ENST00000548390 KANK1Q14678 1352 aa25.56■■□□□ 1.68
LETMD1-215ENST00000548390 DEPDC5O75140 1603 aa25.55■■□□□ 1.68
LETMD1-215ENST00000548390 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
LETMD1-215ENST00000548390 PZPP20742 1482 aa25.53■■□□□ 1.68
LETMD1-215ENST00000548390 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
LETMD1-215ENST00000548390 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
LETMD1-215ENST00000548390 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
LETMD1-215ENST00000548390 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.5■■□□□ 1.67
LETMD1-215ENST00000548390 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.49■■□□□ 1.67
LETMD1-215ENST00000548390 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.47■■□□□ 1.67
LETMD1-215ENST00000548390 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.47■■□□□ 1.67
LETMD1-215ENST00000548390 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
LETMD1-215ENST00000548390 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.45■■□□□ 1.67
LETMD1-215ENST00000548390 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.43■■□□□ 1.66
LETMD1-215ENST00000548390 PKD2Q13563 968 aa25.43■■□□□ 1.66
LETMD1-215ENST00000548390 GGT6Q6P531 493 aa25.43■■□□□ 1.66
LETMD1-215ENST00000548390 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.37■■□□□ 1.65
LETMD1-215ENST00000548390 TET3O43151 1660 aa25.36■■□□□ 1.65
LETMD1-215ENST00000548390 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.36■■□□□ 1.65
LETMD1-215ENST00000548390 ABCC3O15438 1527 aa25.35■■□□□ 1.65
LETMD1-215ENST00000548390 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
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LETMD1-215ENST00000548390 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.3■■□□□ 1.64
LETMD1-215ENST00000548390 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.3■■□□□ 1.64
LETMD1-215ENST00000548390 FOXD1Q16676 465 aa25.3■■□□□ 1.64
LETMD1-215ENST00000548390 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.29■■□□□ 1.64
LETMD1-215ENST00000548390 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
LETMD1-215ENST00000548390 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.26■■□□□ 1.63
LETMD1-215ENST00000548390 MLECQ14165 292 aa25.25■■□□□ 1.63
LETMD1-215ENST00000548390 PTPRTO14522 1441 aa25.25■■□□□ 1.63
LETMD1-215ENST00000548390 CEP152O94986 1710 aa25.25■■□□□ 1.63
LETMD1-215ENST00000548390 E9PCH4 1651 aa25.24■■□□□ 1.63
LETMD1-215ENST00000548390 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.23■■□□□ 1.63
LETMD1-215ENST00000548390 NPATQ14207 1427 aa25.23■■□□□ 1.63
LETMD1-215ENST00000548390 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.23■■□□□ 1.63
LETMD1-215ENST00000548390 PLA2R1Q13018 1463 aa25.21■■□□□ 1.63
LETMD1-215ENST00000548390 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.2■■□□□ 1.63
LETMD1-215ENST00000548390 NEUROD1Q13562 356 aa25.2■■□□□ 1.62
LETMD1-215ENST00000548390 TRPM2O94759 1503 aa25.19■■□□□ 1.62
LETMD1-215ENST00000548390 TONSLQ96HA7 1378 aa25.16■■□□□ 1.62
LETMD1-215ENST00000548390 NOS1P29475 1434 aa25.15■■□□□ 1.62
LETMD1-215ENST00000548390 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
LETMD1-215ENST00000548390 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.14■■□□□ 1.61
LETMD1-215ENST00000548390 ZMYM3Q14202 1370 aa25.13■■□□□ 1.61
LETMD1-215ENST00000548390 MROH2AA6NES4 1674 aa25.11■■□□□ 1.61
LETMD1-215ENST00000548390 ERVK-7P63135 1459 aa25.09■■□□□ 1.61
LETMD1-215ENST00000548390 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.08■■□□□ 1.61
LETMD1-215ENST00000548390 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.05■■□□□ 1.6
LETMD1-215ENST00000548390 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.05■■□□□ 1.6
LETMD1-215ENST00000548390 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.05■■□□□ 1.6
LETMD1-215ENST00000548390 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.04■■□□□ 1.6
LETMD1-215ENST00000548390 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.03■■□□□ 1.6
LETMD1-215ENST00000548390 CLTCL1P53675 1640 aa25.02■■□□□ 1.6
LETMD1-215ENST00000548390 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
LETMD1-215ENST00000548390 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.01■■□□□ 1.59
LETMD1-215ENST00000548390 SYNMO15061 1565 aa25.01■■□□□ 1.59
LETMD1-215ENST00000548390 L3MBTL2Q969R5 705 aa25■■□□□ 1.59
LETMD1-215ENST00000548390 PIK3C2BO00750 1634 aa24.99■■□□□ 1.59
LETMD1-215ENST00000548390 MADDQ8WXG6 1647 aa24.98■■□□□ 1.59
LETMD1-215ENST00000548390 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
LETMD1-215ENST00000548390 STAC3Q96MF2 364 aa24.98■■□□□ 1.59
LETMD1-215ENST00000548390 TNRQ92752 1358 aa24.97■■□□□ 1.59
LETMD1-215ENST00000548390 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.96■■□□□ 1.59
LETMD1-215ENST00000548390 IDI1Q13907 227 aa24.95■■□□□ 1.58
LETMD1-215ENST00000548390 ADGRB3O60242 1522 aa24.93■■□□□ 1.58
LETMD1-215ENST00000548390 C3P01024 1663 aa24.92■■□□□ 1.58
LETMD1-215ENST00000548390 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.91■■□□□ 1.58
LETMD1-215ENST00000548390 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
LETMD1-215ENST00000548390 RGL3Q3MIN7 710 aa24.91■■□□□ 1.58
LETMD1-215ENST00000548390 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
LETMD1-215ENST00000548390 KIF1BO60333 1816 aa24.91■■□□□ 1.58
LETMD1-215ENST00000548390 NLRP1Q9C000 1473 aa24.9■■□□□ 1.58
LETMD1-215ENST00000548390 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
LETMD1-215ENST00000548390 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
LETMD1-215ENST00000548390 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.88■■□□□ 1.57
LETMD1-215ENST00000548390 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.87■■□□□ 1.57
LETMD1-215ENST00000548390 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.85■■□□□ 1.57
LETMD1-215ENST00000548390 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
LETMD1-215ENST00000548390 PTPRMP28827 1452 aa24.83■■□□□ 1.57
LETMD1-215ENST00000548390 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.83■■□□□ 1.57
LETMD1-215ENST00000548390 MYOM2P54296 1465 aa24.82■■□□□ 1.56
LETMD1-215ENST00000548390 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.81■■□□□ 1.56
LETMD1-215ENST00000548390 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
LETMD1-215ENST00000548390 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.8■■□□□ 1.56
LETMD1-215ENST00000548390 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.79■■□□□ 1.56
LETMD1-215ENST00000548390 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
LETMD1-215ENST00000548390 ZFYVE9O95405 1425 aa24.78■■□□□ 1.56
LETMD1-215ENST00000548390 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
LETMD1-215ENST00000548390 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.77■■□□□ 1.56
LETMD1-215ENST00000548390 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
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