RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545825.1

CCDC189-211, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC189, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-211ENST00000545825 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
CCDC189-211ENST00000545825 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.61■■■■□ 3.13
CCDC189-211ENST00000545825 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.6■■■■□ 3.13
CCDC189-211ENST00000545825 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.6■■■■□ 3.13
CCDC189-211ENST00000545825 NCOA1Q15788 1441 aa34.59■■■■□ 3.13
CCDC189-211ENST00000545825 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.59■■■■□ 3.13
CCDC189-211ENST00000545825 ADGRL2O95490 1459 aa34.58■■■■□ 3.13
CCDC189-211ENST00000545825 ERBINQ96RT1 1412 aa34.58■■■■□ 3.13
CCDC189-211ENST00000545825 NPATQ14207 1427 aa34.55■■■■□ 3.12
CCDC189-211ENST00000545825 PTPRKQ15262 1439 aa34.55■■■■□ 3.12
CCDC189-211ENST00000545825 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.54■■■■□ 3.12
CCDC189-211ENST00000545825 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.54■■■■□ 3.12
CCDC189-211ENST00000545825 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.53■■■■□ 3.12
CCDC189-211ENST00000545825 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
CCDC189-211ENST00000545825 HSPA2P54652 639 aa34.53■■■■□ 3.12
CCDC189-211ENST00000545825 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.53■■■■□ 3.12
CCDC189-211ENST00000545825 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
CCDC189-211ENST00000545825 ABCC3O15438 1527 aa34.47■■■■□ 3.11
CCDC189-211ENST00000545825 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
CCDC189-211ENST00000545825 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.1
CCDC189-211ENST00000545825 PZPP20742 1482 aa34.44■■■■□ 3.1
CCDC189-211ENST00000545825 DEPDC5O75140 1603 aa34.43■■■■□ 3.1
CCDC189-211ENST00000545825 ROCK1Q13464 1354 aa34.4■■■■□ 3.1
CCDC189-211ENST00000545825 ITGAEP38570 1179 aa34.39■■■■□ 3.1
CCDC189-211ENST00000545825 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.38■■■■□ 3.09
CCDC189-211ENST00000545825 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
CCDC189-211ENST00000545825 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.37■■■■□ 3.09
CCDC189-211ENST00000545825 CEP152O94986 1710 aa34.37■■■■□ 3.09
CCDC189-211ENST00000545825 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.35■■■■□ 3.09
CCDC189-211ENST00000545825 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.33■■■■□ 3.09
CCDC189-211ENST00000545825 TNRQ92752 1358 aa34.31■■■■□ 3.08
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
CCDC189-211ENST00000545825 KANK1Q14678 1352 aa34.3■■■■□ 3.08
CCDC189-211ENST00000545825 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.3■■■■□ 3.08
CCDC189-211ENST00000545825 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CCDC189-211ENST00000545825 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.25■■■■□ 3.07
CCDC189-211ENST00000545825 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.25■■■■□ 3.07
CCDC189-211ENST00000545825 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.25■■■■□ 3.07
CCDC189-211ENST00000545825 STRCQ7RTU9 1775 aa34.24■■■■□ 3.07
CCDC189-211ENST00000545825 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.24■■■■□ 3.07
CCDC189-211ENST00000545825 ERVK-7P63135 1459 aa34.23■■■■□ 3.07
CCDC189-211ENST00000545825 UNC13BO14795 1591 aa34.19■■■■□ 3.06
CCDC189-211ENST00000545825 NLRP1Q9C000 1473 aa34.18■■■■□ 3.06
CCDC189-211ENST00000545825 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.14■■■■□ 3.06
CCDC189-211ENST00000545825 PLA2R1Q13018 1463 aa34.13■■■■□ 3.05
CCDC189-211ENST00000545825 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
CCDC189-211ENST00000545825 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.1■■■■□ 3.05
CCDC189-211ENST00000545825 NAIPQ13075 1403 aa34.08■■■■□ 3.05
CCDC189-211ENST00000545825 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.07■■■■□ 3.05
CCDC189-211ENST00000545825 TET3O43151 1660 aa34.06■■■■□ 3.04
CCDC189-211ENST00000545825 PTPRTO14522 1441 aa34.05■■■■□ 3.04
CCDC189-211ENST00000545825 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.05■■■■□ 3.04
CCDC189-211ENST00000545825 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.04■■■■□ 3.04
CCDC189-211ENST00000545825 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.04■■■■□ 3.04
CCDC189-211ENST00000545825 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
CCDC189-211ENST00000545825 HFM1A2PYH4 1435 aa34.03■■■■□ 3.04
CCDC189-211ENST00000545825 NUP155O75694 1391 aa34.02■■■■□ 3.04
CCDC189-211ENST00000545825 NOS1P29475 1434 aa34.02■■■■□ 3.04
CCDC189-211ENST00000545825 PKD2Q13563 968 aa34.01■■■■□ 3.03
CCDC189-211ENST00000545825 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
CCDC189-211ENST00000545825 SYNMO15061 1565 aa33.99■■■■□ 3.03
CCDC189-211ENST00000545825 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.96■■■■□ 3.03
CCDC189-211ENST00000545825 E9PCH4 1651 aa33.94■■■■□ 3.02
CCDC189-211ENST00000545825 PIK3C2BO00750 1634 aa33.93■■■■□ 3.02
CCDC189-211ENST00000545825 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
CCDC189-211ENST00000545825 IDI1Q13907 227 aa33.91■■■■□ 3.02
CCDC189-211ENST00000545825 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.9■■■■□ 3.02
CCDC189-211ENST00000545825 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.89■■■■□ 3.02
CCDC189-211ENST00000545825 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.86■■■■□ 3.01
CCDC189-211ENST00000545825 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
CCDC189-211ENST00000545825 ARHGAP23Q9P227 1491 aa33.83■■■■□ 3.01
CCDC189-211ENST00000545825 SLIT1O75093 1534 aa33.83■■■■□ 3.01
CCDC189-211ENST00000545825 MED14O60244 1454 aa33.82■■■■□ 3
CCDC189-211ENST00000545825 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.81■■■■□ 3
CCDC189-211ENST00000545825 ADGRB3O60242 1522 aa33.8■■■■□ 3
CCDC189-211ENST00000545825 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.78■■■■□ 3
CCDC189-211ENST00000545825 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
CCDC189-211ENST00000545825 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.77■■■■□ 3
CCDC189-211ENST00000545825 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
CCDC189-211ENST00000545825 CERKQ8TCT0 537 aa33.76■■■□□ 2.99
CCDC189-211ENST00000545825 TRIM52Q96A61 297 aa33.76■■■□□ 2.99
CCDC189-211ENST00000545825 LTKP29376 864 aa33.74■■■□□ 2.99
CCDC189-211ENST00000545825 TXNDC2Q86VQ3 553 aa33.73■■■□□ 2.99
CCDC189-211ENST00000545825 IQGAP1P46940 1657 aa33.73■■■□□ 2.99
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
CCDC189-211ENST00000545825 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.7■■■□□ 2.99
CCDC189-211ENST00000545825 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.7■■■□□ 2.98
CCDC189-211ENST00000545825 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
CCDC189-211ENST00000545825 EID1Q9Y6B2 187 aa33.69■■■□□ 2.98
CCDC189-211ENST00000545825 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.67■■■□□ 2.98
CCDC189-211ENST00000545825 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
CCDC189-211ENST00000545825 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.65■■■□□ 2.98
CCDC189-211ENST00000545825 FBXO41Q8TF61 875 aa33.63■■■□□ 2.97
CCDC189-211ENST00000545825 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
CCDC189-211ENST00000545825 TRPM2O94759 1503 aa33.61■■■□□ 2.97
CCDC189-211ENST00000545825 ZFYVE9O95405 1425 aa33.61■■■□□ 2.97
CCDC189-211ENST00000545825 RIMS2Q9UQ26 1411 aa33.57■■■□□ 2.96
CCDC189-211ENST00000545825 CLTCL1P53675 1640 aa33.56■■■□□ 2.96
CCDC189-211ENST00000545825 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.56■■■□□ 2.96
CCDC189-211ENST00000545825 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
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