RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-208ENST00000544253 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
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ANKRD49-208ENST00000544253 AFAP1Q8N556 730 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.27□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 ERBINQ96RT1 1412 aa9.27□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 MED14O60244 1454 aa9.27□□□□□ -0.93
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ANKRD49-208ENST00000544253 ZMYM3Q14202 1370 aa9.25□□□□□ -0.93
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ANKRD49-208ENST00000544253 GGT6Q6P531 493 aa9.03□□□□□ -0.96
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ANKRD49-208ENST00000544253 LAMC1P11047 1609 aa9□□□□□ -0.97
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ANKRD49-208ENST00000544253 APLP2Q06481 763 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa8.97□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD49-208ENST00000544253 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD49-208ENST00000544253 DCCP43146 1447 aa8.95□□□□□ -0.98
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