RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543823.1

SYTL1-208, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-208ENST00000543823 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.01■■□□□ 1.75
SYTL1-208ENST00000543823 CD109Q6YHK3 1445 aa26■■□□□ 1.75
SYTL1-208ENST00000543823 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.99■■□□□ 1.75
SYTL1-208ENST00000543823 CCDC7Q96M83 1385 aa25.98■■□□□ 1.75
SYTL1-208ENST00000543823 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.96■■□□□ 1.75
SYTL1-208ENST00000543823 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.95■■□□□ 1.74
SYTL1-208ENST00000543823 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.95■■□□□ 1.74
SYTL1-208ENST00000543823 CCER2I3L3R5 266 aa25.95■■□□□ 1.74
SYTL1-208ENST00000543823 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.94■■□□□ 1.74
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SYTL1-208ENST00000543823 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.94■■□□□ 1.74
SYTL1-208ENST00000543823 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.94■■□□□ 1.74
SYTL1-208ENST00000543823 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.94■■□□□ 1.74
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SYTL1-208ENST00000543823 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.93■■□□□ 1.74
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SYTL1-208ENST00000543823 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.88■■□□□ 1.73
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SYTL1-208ENST00000543823 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.87■■□□□ 1.73
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SYTL1-208ENST00000543823 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.82■■□□□ 1.72
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SYTL1-208ENST00000543823 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.8■■□□□ 1.72
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SYTL1-208ENST00000543823 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.75■■□□□ 1.71
SYTL1-208ENST00000543823 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.75■■□□□ 1.71
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SYTL1-208ENST00000543823 RICTORQ6R327 1708 aa25.68■■□□□ 1.7
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SYTL1-208ENST00000543823 DIP2BQ9P265 1576 aa25.66■■□□□ 1.7
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SYTL1-208ENST00000543823 GGT6Q6P531 493 aa25.64■■□□□ 1.69
SYTL1-208ENST00000543823 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.63■■□□□ 1.69
SYTL1-208ENST00000543823 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.63■■□□□ 1.69
SYTL1-208ENST00000543823 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.62■■□□□ 1.69
SYTL1-208ENST00000543823 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.69
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SYTL1-208ENST00000543823 NPATQ14207 1427 aa25.57■■□□□ 1.68
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SYTL1-208ENST00000543823 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
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SYTL1-208ENST00000543823 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.45■■□□□ 1.66
SYTL1-208ENST00000543823 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.43■■□□□ 1.66
SYTL1-208ENST00000543823 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.43■■□□□ 1.66
SYTL1-208ENST00000543823 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.42■■□□□ 1.66
SYTL1-208ENST00000543823 IFT172Q9UG01 1749 aa25.42■■□□□ 1.66
SYTL1-208ENST00000543823 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SYTL1-208ENST00000543823 ADGRB3O60242 1522 aa25.42■■□□□ 1.66
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