RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542167.2

PUS1-208, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PUS1, Length 2,151 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-208ENST00000542167 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.34■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 ASXL2Q76L83 1435 aa22.34■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 E9PCH4 1651 aa22.33■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.33■■□□□ 1.17
PUS1-208ENST00000542167 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
PUS1-208ENST00000542167 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PUS1-208ENST00000542167 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PUS1-208ENST00000542167 NBR1Q14596 966 aa22.32■■□□□ 1.16
PUS1-208ENST00000542167 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.3■■□□□ 1.16
PUS1-208ENST00000542167 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.29■■□□□ 1.16
PUS1-208ENST00000542167 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PUS1-208ENST00000542167 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.28■■□□□ 1.16
PUS1-208ENST00000542167 KIF15Q9NS87 1388 aa22.28■■□□□ 1.16
PUS1-208ENST00000542167 PLCH2O75038 1416 aa22.28■■□□□ 1.16
PUS1-208ENST00000542167 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.158e-7■■□□□ 13
PUS1-208ENST00000542167 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.26■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.25■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 PKD2Q13563 968 aa22.25■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 TMC1Q8TDI8 760 aa22.25■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.24■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.22■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.22■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.22■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.21■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.21■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.2■■□□□ 1.15
PUS1-208ENST00000542167 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PUS1-208ENST00000542167 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.2■■□□□ 1.14
PUS1-208ENST00000542167 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.2■■□□□ 1.14
PUS1-208ENST00000542167 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.2■■□□□ 1.14
PUS1-208ENST00000542167 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.2■■□□□ 1.14
PUS1-208ENST00000542167 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PUS1-208ENST00000542167 TSPY4P0CV99 314 aa22.18■■□□□ 1.14
PUS1-208ENST00000542167 TSPY10P0CW01 314 aa22.18■■□□□ 1.14
PUS1-208ENST00000542167 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.16■■□□□ 1.14
PUS1-208ENST00000542167 RALBP1Q15311 655 aa22.16■■□□□ 1.14
PUS1-208ENST00000542167 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.16■■□□□ 1.14
PUS1-208ENST00000542167 ABCC1P33527 1531 aa22.16■■□□□ 1.14
PUS1-208ENST00000542167 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PUS1-208ENST00000542167 FANCAO15360 1455 aa22.13■■□□□ 1.13
PUS1-208ENST00000542167 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.12■■□□□ 1.13
PUS1-208ENST00000542167 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PUS1-208ENST00000542167 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.11■■□□□ 1.13
PUS1-208ENST00000542167 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.1■■□□□ 1.13
PUS1-208ENST00000542167 NUP155O75694 1391 aa22.1■■□□□ 1.13
PUS1-208ENST00000542167 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.1■■□□□ 1.13
PUS1-208ENST00000542167 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.1■■□□□ 1.13
PUS1-208ENST00000542167 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.09■■□□□ 1.13
PUS1-208ENST00000542167 CD109Q6YHK3 1445 aa22.08■■□□□ 1.12
PUS1-208ENST00000542167 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.07■■□□□ 1.12
PUS1-208ENST00000542167 PDE3BQ13370 1112 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-208ENST00000542167 NLRP13Q86W25 1043 aa22.05■■□□□ 1.12
PUS1-208ENST00000542167 PDE4AP27815 886 aa22.05■■□□□ 1.12
PUS1-208ENST00000542167 MS4A1P11836 297 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-208ENST00000542167 ADGRL1O94910 1474 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-208ENST00000542167 BACH2Q9BYV9 841 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-208ENST00000542167 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-208ENST00000542167 PLXNC1O60486 1568 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-208ENST00000542167 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PUS1-208ENST00000542167 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.01■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 INSRP06213 1382 aa22.01■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 LAMC1P11047 1609 aa22.01■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.01■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 PRAG1Q86YV5 1406 aa22■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 SCAPERQ9BY12 1400 aa22■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 AFAP1Q8N556 730 aa21.99■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.99■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.99■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.98■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 GLI2P10070 1586 aa21.97■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 DIP2BQ9P265 1576 aa21.96■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.96■■□□□ 1.11
PUS1-208ENST00000542167 USP35Q9P2H5 1018 aa21.95■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.95■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.94■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.94■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.93■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 ATP7AQ04656 1500 aa21.92■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 NEFMP07197 916 aa21.91■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.91■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 NEO1Q92859 1461 aa21.91■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.9■■□□□ 1.1
PUS1-208ENST00000542167 UNC13BO14795 1591 aa21.89■■□□□ 1.09
PUS1-208ENST00000542167 A2MP01023 1474 aa21.89■■□□□ 1.09
PUS1-208ENST00000542167 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.89■■□□□ 1.09
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