RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.25■■■■□ 3.55
PITX3-202ENST00000539804 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
PITX3-202ENST00000539804 KIF15Q9NS87 1388 aa37.22■■■■□ 3.55
PITX3-202ENST00000539804 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.2■■■■□ 3.55
PITX3-202ENST00000539804 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.2■■■■□ 3.55
PITX3-202ENST00000539804 ERBINQ96RT1 1412 aa37.19■■■■□ 3.54
PITX3-202ENST00000539804 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
PITX3-202ENST00000539804 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.15■■■■□ 3.54
PITX3-202ENST00000539804 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.14■■■■□ 3.54
PITX3-202ENST00000539804 ADGRL2O95490 1459 aa37.11■■■■□ 3.53
PITX3-202ENST00000539804 NCOA1Q15788 1441 aa37.1■■■■□ 3.53
PITX3-202ENST00000539804 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
PITX3-202ENST00000539804 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.09■■■■□ 3.53
PITX3-202ENST00000539804 PTPRKQ15262 1439 aa37.07■■■■□ 3.52
PITX3-202ENST00000539804 HSPA2P54652 639 aa37.05■■■■□ 3.52
PITX3-202ENST00000539804 PZPP20742 1482 aa37.03■■■■□ 3.52
PITX3-202ENST00000539804 KANK1Q14678 1352 aa37.03■■■■□ 3.52
PITX3-202ENST00000539804 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
PITX3-202ENST00000539804 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37■■■■□ 3.51
PITX3-202ENST00000539804 ROCK1Q13464 1354 aa36.98■■■■□ 3.51
PITX3-202ENST00000539804 ABCC3O15438 1527 aa36.97■■■■□ 3.51
PITX3-202ENST00000539804 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
PITX3-202ENST00000539804 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.92■■■■□ 3.5
PITX3-202ENST00000539804 TNRQ92752 1358 aa36.92■■■■□ 3.5
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.92■■■■□ 3.5
PITX3-202ENST00000539804 DEPDC5O75140 1603 aa36.92■■■■□ 3.5
PITX3-202ENST00000539804 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.91■■■■□ 3.5
PITX3-202ENST00000539804 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
PITX3-202ENST00000539804 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
PITX3-202ENST00000539804 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.87■■■■□ 3.49
PITX3-202ENST00000539804 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
PITX3-202ENST00000539804 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.85■■■■□ 3.49
PITX3-202ENST00000539804 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.85■■■■□ 3.49
PITX3-202ENST00000539804 NLRP1Q9C000 1473 aa36.84■■■■□ 3.49
PITX3-202ENST00000539804 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.84■■■■□ 3.49
PITX3-202ENST00000539804 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
PITX3-202ENST00000539804 CEP152O94986 1710 aa36.81■■■■□ 3.48
PITX3-202ENST00000539804 ITGAEP38570 1179 aa36.8■■■■□ 3.48
PITX3-202ENST00000539804 PLA2R1Q13018 1463 aa36.8■■■■□ 3.48
PITX3-202ENST00000539804 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.8■■■■□ 3.48
PITX3-202ENST00000539804 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.78■■■■□ 3.48
PITX3-202ENST00000539804 PKD2Q13563 968 aa36.77■■■■□ 3.48
PITX3-202ENST00000539804 PTPRTO14522 1441 aa36.76■■■■□ 3.47
PITX3-202ENST00000539804 ERVK-7P63135 1459 aa36.75■■■■□ 3.47
PITX3-202ENST00000539804 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.75■■■■□ 3.47
PITX3-202ENST00000539804 STRCQ7RTU9 1775 aa36.73■■■■□ 3.47
PITX3-202ENST00000539804 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
PITX3-202ENST00000539804 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.66■■■■□ 3.46
PITX3-202ENST00000539804 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
PITX3-202ENST00000539804 UNC13BO14795 1591 aa36.65■■■■□ 3.46
PITX3-202ENST00000539804 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.64■■■■□ 3.46
PITX3-202ENST00000539804 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.59■■■■□ 3.45
PITX3-202ENST00000539804 TET3O43151 1660 aa36.58■■■■□ 3.45
PITX3-202ENST00000539804 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.56■■■■□ 3.44
PITX3-202ENST00000539804 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
PITX3-202ENST00000539804 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.54■■■■□ 3.44
PITX3-202ENST00000539804 NUP155O75694 1391 aa36.53■■■■□ 3.44
PITX3-202ENST00000539804 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.52■■■■□ 3.44
PITX3-202ENST00000539804 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.51■■■■□ 3.44
PITX3-202ENST00000539804 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.51■■■■□ 3.43
PITX3-202ENST00000539804 NOS1P29475 1434 aa36.51■■■■□ 3.43
PITX3-202ENST00000539804 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
PITX3-202ENST00000539804 HFM1A2PYH4 1435 aa36.48■■■■□ 3.43
PITX3-202ENST00000539804 NAIPQ13075 1403 aa36.47■■■■□ 3.43
PITX3-202ENST00000539804 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
PITX3-202ENST00000539804 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.44■■■■□ 3.42
PITX3-202ENST00000539804 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
PITX3-202ENST00000539804 CERKQ8TCT0 537 aa36.43■■■■□ 3.42
PITX3-202ENST00000539804 EID1Q9Y6B2 187 aa36.41■■■■□ 3.42
PITX3-202ENST00000539804 MED14O60244 1454 aa36.4■■■■□ 3.42
PITX3-202ENST00000539804 IDI1Q13907 227 aa36.4■■■■□ 3.42
PITX3-202ENST00000539804 FBXO41Q8TF61 875 aa36.4■■■■□ 3.42
PITX3-202ENST00000539804 SYNMO15061 1565 aa36.38■■■■□ 3.41
PITX3-202ENST00000539804 PIK3C2BO00750 1634 aa36.37■■■■□ 3.41
PITX3-202ENST00000539804 SLIT1O75093 1534 aa36.37■■■■□ 3.41
PITX3-202ENST00000539804 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
PITX3-202ENST00000539804 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.34■■■■□ 3.41
PITX3-202ENST00000539804 E9PCH4 1651 aa36.33■■■■□ 3.41
PITX3-202ENST00000539804 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.33■■■■□ 3.41
PITX3-202ENST00000539804 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
PITX3-202ENST00000539804 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.41
PITX3-202ENST00000539804 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.32■■■■□ 3.4
PITX3-202ENST00000539804 ADGRB3O60242 1522 aa36.31■■■■□ 3.4
PITX3-202ENST00000539804 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
PITX3-202ENST00000539804 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.31■■■■□ 3.4
PITX3-202ENST00000539804 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.3■■■■□ 3.4
PITX3-202ENST00000539804 IQGAP1P46940 1657 aa36.27■■■■□ 3.4
PITX3-202ENST00000539804 TRIM52Q96A61 297 aa36.27■■■■□ 3.4
PITX3-202ENST00000539804 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.26■■■■□ 3.39
PITX3-202ENST00000539804 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
PITX3-202ENST00000539804 CPS1P31327 1500 aa36.18■■■■□ 3.38
PITX3-202ENST00000539804 LTKP29376 864 aa36.18■■■■□ 3.38
PITX3-202ENST00000539804 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.38
PITX3-202ENST00000539804 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
PITX3-202ENST00000539804 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.14■■■■□ 3.38
PITX3-202ENST00000539804 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
PITX3-202ENST00000539804 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.13■■■■□ 3.37
PITX3-202ENST00000539804 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
PITX3-202ENST00000539804 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.09■■■■□ 3.37
PITX3-202ENST00000539804 TRPM2O94759 1503 aa36.07■■■■□ 3.36
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