RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533708.1

RAB30-AS1-207, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB30-AS1, Length 825 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.71■■□□□ 1.39
RAB30-AS1-207ENST00000533708 DEPDC5O75140 1603 aa23.7■■□□□ 1.39
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MLECQ14165 292 aa23.69■■□□□ 1.38
RAB30-AS1-207ENST00000533708 GGT6Q6P531 493 aa23.68■■□□□ 1.38
RAB30-AS1-207ENST00000533708 UNC13BO14795 1591 aa23.68■■□□□ 1.38
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
RAB30-AS1-207ENST00000533708 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
RAB30-AS1-207ENST00000533708 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.63■■□□□ 1.37
RAB30-AS1-207ENST00000533708 HRCP23327 699 aa23.62■■□□□ 1.37
RAB30-AS1-207ENST00000533708 NUP155O75694 1391 aa23.6■■□□□ 1.37
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.59■■□□□ 1.37
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.59■■□□□ 1.37
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ABCC3O15438 1527 aa23.59■■□□□ 1.37
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TRIM52Q96A61 297 aa23.58■■□□□ 1.37
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.58■■□□□ 1.37
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KANK1Q14678 1352 aa23.57■■□□□ 1.36
RAB30-AS1-207ENST00000533708 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.57■■□□□ 1.36
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PZPP20742 1482 aa23.56■■□□□ 1.36
RAB30-AS1-207ENST00000533708 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.56■■□□□ 1.36
RAB30-AS1-207ENST00000533708 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.56■■□□□ 1.36
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MADDQ8WXG6 1647 aa23.55■■□□□ 1.36
RAB30-AS1-207ENST00000533708 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.55■■□□□ 1.36
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CEP152O94986 1710 aa23.55■■□□□ 1.36
RAB30-AS1-207ENST00000533708 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.53■■□□□ 1.36
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.5■■□□□ 1.35
RAB30-AS1-207ENST00000533708 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.49■■□□□ 1.35
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.48■■□□□ 1.35
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TET3O43151 1660 aa23.48■■□□□ 1.35
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.47■■□□□ 1.35
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ZMYM3Q14202 1370 aa23.47■■□□□ 1.35
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MROH2AA6NES4 1674 aa23.46■■□□□ 1.35
RAB30-AS1-207ENST00000533708 NPATQ14207 1427 aa23.45■■□□□ 1.34
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.45■■□□□ 1.34
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PKD2Q13563 968 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB30-AS1-207ENST00000533708 E9PCH4 1651 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PTPRMP28827 1452 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB30-AS1-207ENST00000533708 C3P01024 1663 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB30-AS1-207ENST00000533708 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RAB30-AS1-207ENST00000533708 FOXD1Q16676 465 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
RAB30-AS1-207ENST00000533708 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ERVK-7P63135 1459 aa23.36■■□□□ 1.33
RAB30-AS1-207ENST00000533708 NOS1P29475 1434 aa23.34■■□□□ 1.33
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.34■■□□□ 1.33
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PLA2R1Q13018 1463 aa23.34■■□□□ 1.33
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.34■■□□□ 1.33
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.33■■□□□ 1.33
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PTPRTO14522 1441 aa23.33■■□□□ 1.32
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SYNMO15061 1565 aa23.31■■□□□ 1.32
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.29■■□□□ 1.32
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.29■■□□□ 1.32
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TNRQ92752 1358 aa23.27■■□□□ 1.32
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TRPM2O94759 1503 aa23.27■■□□□ 1.32
RAB30-AS1-207ENST00000533708 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PIK3C2BO00750 1634 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CLTCL1P53675 1640 aa23.21■■□□□ 1.31
RAB30-AS1-207ENST00000533708 IDI1Q13907 227 aa23.2■■□□□ 1.3
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.19■■□□□ 1.3
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.19■■□□□ 1.3
RAB30-AS1-207ENST00000533708 NLRP1Q9C000 1473 aa23.17■■□□□ 1.3
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.17■■□□□ 1.3
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.14■■□□□ 1.29
RAB30-AS1-207ENST00000533708 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.13■■□□□ 1.29
RAB30-AS1-207ENST00000533708 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.12■■□□□ 1.29
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.11■■□□□ 1.29
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ADGRB3O60242 1522 aa23.1■■□□□ 1.29
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.1■■□□□ 1.29
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.09■■□□□ 1.29
RAB30-AS1-207ENST00000533708 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.08■■□□□ 1.28
RAB30-AS1-207ENST00000533708 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.06■■□□□ 1.28
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
RAB30-AS1-207ENST00000533708 NEUROD1Q13562 356 aa23.06■■□□□ 1.28
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KIF1BO60333 1816 aa23.05■■□□□ 1.28
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.04■■□□□ 1.28
RAB30-AS1-207ENST00000533708 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.04■■□□□ 1.28
RAB30-AS1-207ENST00000533708 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.04■■□□□ 1.28
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RGL3Q3MIN7 710 aa23.01■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-207ENST00000533708 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SLIT1O75093 1534 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-207ENST00000533708 HSPA2P54652 639 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ZFYVE9O95405 1425 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-207ENST00000533708 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.96■■□□□ 1.27
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