RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 MADDQ8WXG6 1647 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-210ENST00000533686 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-210ENST00000533686 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-210ENST00000533686 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-210ENST00000533686 DEPDC5O75140 1603 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-210ENST00000533686 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-210ENST00000533686 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-210ENST00000533686 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-210ENST00000533686 PTPRMP28827 1452 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-210ENST00000533686 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-210ENST00000533686 KANK1Q14678 1352 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-210ENST00000533686 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-210ENST00000533686 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-210ENST00000533686 ZMYM3Q14202 1370 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-210ENST00000533686 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3-210ENST00000533686 ABCC3O15438 1527 aa24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3-210ENST00000533686 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.64■■□□□ 1.54
PACSIN3-210ENST00000533686 UNC13BO14795 1591 aa24.63■■□□□ 1.53
PACSIN3-210ENST00000533686 MROH2AA6NES4 1674 aa24.63■■□□□ 1.53
PACSIN3-210ENST00000533686 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-210ENST00000533686 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-210ENST00000533686 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-210ENST00000533686 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-210ENST00000533686 NUP155O75694 1391 aa24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-210ENST00000533686 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-210ENST00000533686 HRCP23327 699 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-210ENST00000533686 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-210ENST00000533686 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-210ENST00000533686 C3P01024 1663 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-210ENST00000533686 PZPP20742 1482 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-210ENST00000533686 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-210ENST00000533686 CEP152O94986 1710 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-210ENST00000533686 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3-210ENST00000533686 NPATQ14207 1427 aa24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIM52Q96A61 297 aa24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3-210ENST00000533686 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-210ENST00000533686 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-210ENST00000533686 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-210ENST00000533686 TET3O43151 1660 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-210ENST00000533686 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-210ENST00000533686 ERVK-7P63135 1459 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-210ENST00000533686 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3-210ENST00000533686 TNRQ92752 1358 aa24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3-210ENST00000533686 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3-210ENST00000533686 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.4■■□□□ 1.5
PACSIN3-210ENST00000533686 NOS1P29475 1434 aa24.4■■□□□ 1.5
PACSIN3-210ENST00000533686 PKD2Q13563 968 aa24.39■■□□□ 1.49
PACSIN3-210ENST00000533686 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.38■■□□□ 1.49
PACSIN3-210ENST00000533686 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.38■■□□□ 1.49
PACSIN3-210ENST00000533686 E9PCH4 1651 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-210ENST00000533686 NLRP1Q9C000 1473 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-210ENST00000533686 PTPRTO14522 1441 aa24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-210ENST00000533686 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-210ENST00000533686 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-210ENST00000533686 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-210ENST00000533686 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-210ENST00000533686 SYNMO15061 1565 aa24.3■■□□□ 1.48
PACSIN3-210ENST00000533686 IDI1Q13907 227 aa24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3-210ENST00000533686 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PACSIN3-210ENST00000533686 FOXD1Q16676 465 aa24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3-210ENST00000533686 PLA2R1Q13018 1463 aa24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3-210ENST00000533686 TRPM2O94759 1503 aa24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-210ENST00000533686 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
PACSIN3-210ENST00000533686 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.23■■□□□ 1.47
PACSIN3-210ENST00000533686 PIK3C2BO00750 1634 aa24.22■■□□□ 1.47
PACSIN3-210ENST00000533686 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.22■■□□□ 1.47
PACSIN3-210ENST00000533686 HSPA2P54652 639 aa24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-210ENST00000533686 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3-210ENST00000533686 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3-210ENST00000533686 ADGRB3O60242 1522 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-210ENST00000533686 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3-210ENST00000533686 CLTCL1P53675 1640 aa24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-210ENST00000533686 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-210ENST00000533686 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-210ENST00000533686 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-210ENST00000533686 SLIT1O75093 1534 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-210ENST00000533686 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-210ENST00000533686 EID1Q9Y6B2 187 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-210ENST00000533686 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-210ENST00000533686 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-210ENST00000533686 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-210ENST00000533686 LTKP29376 864 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-210ENST00000533686 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-210ENST00000533686 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-210ENST00000533686 KIF1BO60333 1816 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-210ENST00000533686 ZFYVE9O95405 1425 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-210ENST00000533686 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-210ENST00000533686 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.02■■□□□ 1.44
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