RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532063.5

ILK-212, Transcript of integrin linked kinase, human

TSL 2 BASIC

Gene ILK, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILK-212	ENST00000532063	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		43.15	■■■■■ 4.5
ILK-212	ENST00000532063	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		43.14	■■■■■ 4.5
ILK-212	ENST00000532063	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		43.13	■■■■■ 4.5
ILK-212	ENST00000532063	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		43.1	■■■■■ 4.49
ILK-212	ENST00000532063	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	43.1	■■■■■ 4.49
ILK-212	ENST00000532063	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		43.08	■■■■■ 4.49
ILK-212	ENST00000532063	KANK1	Q14678	1352 aa		43.06	■■■■■ 4.48
ILK-212	ENST00000532063	FOXD1	Q16676	465 aa		43.06	■■■■■ 4.48
ILK-212	ENST00000532063	KIF3B	O15066	747 aa		43.05	■■■■■ 4.48
ILK-212	ENST00000532063	DEPDC5	O75140	1603 aa		43.05	■■■■■ 4.48
ILK-212	ENST00000532063	TONSL	Q96HA7	1378 aa		43.04	■■■■■ 4.48
ILK-212	ENST00000532063	ABCA6	Q8N139	1617 aa		43.04	■■■■■ 4.48
ILK-212	ENST00000532063	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		43	■■■■■ 4.47
ILK-212	ENST00000532063	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.95	■■■■■ 4.47
ILK-212	ENST00000532063	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.95	■■■■■ 4.47
ILK-212	ENST00000532063	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.93	■■■■■ 4.46
ILK-212	ENST00000532063	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.92	■■■■■ 4.46
ILK-212	ENST00000532063	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.91	■■■■■ 4.46
ILK-212	ENST00000532063	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.91	■■■■■ 4.46
ILK-212	ENST00000532063	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.91	■■■■■ 4.46
ILK-212	ENST00000532063	ATP10A	O60312	1499 aa		42.87	■■■■■ 4.45
ILK-212	ENST00000532063	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
ILK-212	ENST00000532063	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.84	■■■■■ 4.45
ILK-212	ENST00000532063	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	42.82	■■■■■ 4.45
ILK-212	ENST00000532063	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.81	■■■■■ 4.44
ILK-212	ENST00000532063	TET3	O43151	1660 aa		42.8	■■■■■ 4.44
ILK-212	ENST00000532063	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.78	■■■■■ 4.44
ILK-212	ENST00000532063	GGT6	Q6P531	493 aa		42.72	■■■■■ 4.43
ILK-212	ENST00000532063	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		42.72	■■■■■ 4.43
ILK-212	ENST00000532063	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.71	■■■■■ 4.43
ILK-212	ENST00000532063	AGL	P35573	1532 aa		42.7	■■■■■ 4.43
ILK-212	ENST00000532063	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		42.67	■■■■■ 4.42
ILK-212	ENST00000532063	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.67	■■■■■ 4.42
ILK-212	ENST00000532063		E9PCH4	1651 aa		42.66	■■■■■ 4.42
ILK-212	ENST00000532063	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		42.65	■■■■■ 4.42
ILK-212	ENST00000532063	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		42.64	■■■■■ 4.42
ILK-212	ENST00000532063	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.63	■■■■■ 4.41
ILK-212	ENST00000532063	PTPRT	O14522	1441 aa		42.63	■■■■■ 4.41
ILK-212	ENST00000532063	ABCC3	O15438	1527 aa		42.59	■■■■■ 4.41
ILK-212	ENST00000532063	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.41
ILK-212	ENST00000532063	TRPM2	O94759	1503 aa		42.57	■■■■■ 4.4
ILK-212	ENST00000532063	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	42.55	■■■■■ 4.4
ILK-212	ENST00000532063	CEP152	O94986	1710 aa		42.53	■■■■■ 4.4
ILK-212	ENST00000532063	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		42.5	■■■■■ 4.39
ILK-212	ENST00000532063	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.48	■■■■■ 4.39
ILK-212	ENST00000532063	NPAT	Q14207	1427 aa		42.44	■■■■■ 4.39
ILK-212	ENST00000532063	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.43	■■■■■ 4.38
ILK-212	ENST00000532063	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.4	■■■■■ 4.38
ILK-212	ENST00000532063	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.34	■■■■■ 4.37
ILK-212	ENST00000532063	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.33	■■■■■ 4.37
ILK-212	ENST00000532063	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		42.33	■■■■■ 4.37
ILK-212	ENST00000532063	CLTCL1	P53675	1640 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ILK-212	ENST00000532063	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ILK-212	ENST00000532063	STAC3	Q96MF2	364 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ILK-212	ENST00000532063	NOS1	P29475	1434 aa		42.29	■■■■■ 4.36
ILK-212	ENST00000532063	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.28	■■■■■ 4.36
ILK-212	ENST00000532063	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.28	■■■■■ 4.36
ILK-212	ENST00000532063	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.28	■■■■■ 4.36
ILK-212	ENST00000532063	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		42.27	■■■■■ 4.36
ILK-212	ENST00000532063	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.26	■■■■■ 4.36
ILK-212	ENST00000532063	MLEC	Q14165	292 aa		42.22	■■■■■ 4.35
ILK-212	ENST00000532063	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		42.2	■■■■■ 4.35
ILK-212	ENST00000532063	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	42.17	■■■■■ 4.34
ILK-212	ENST00000532063	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		42.17	■■■■■ 4.34
ILK-212	ENST00000532063	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.13	■■■■■ 4.33
ILK-212	ENST00000532063	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.33
ILK-212	ENST00000532063	KIF1B	O60333	1816 aa		42.13	■■■■■ 4.33
ILK-212	ENST00000532063	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.12	■■■■■ 4.33
ILK-212	ENST00000532063	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		42.12	■■■■■ 4.33
ILK-212	ENST00000532063	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	42.1	■■■■■ 4.33
ILK-212	ENST00000532063	SYNM	O15061	1565 aa		42.09	■■■■■ 4.33
ILK-212	ENST00000532063	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.08	■■■■■ 4.33
ILK-212	ENST00000532063	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.08	■■■■■ 4.33
ILK-212	ENST00000532063	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.07	■■■■■ 4.33
ILK-212	ENST00000532063	ADGRB3	O60242	1522 aa		42.07	■■■■■ 4.33
ILK-212	ENST00000532063	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.03	■■■■■ 4.32
ILK-212	ENST00000532063	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.03	■■■■■ 4.32
ILK-212	ENST00000532063	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		42.02	■■■■■ 4.32
ILK-212	ENST00000532063	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
ILK-212	ENST00000532063	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	41.99	■■■■■ 4.31
ILK-212	ENST00000532063	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		41.99	■■■■■ 4.31
ILK-212	ENST00000532063	IDI1	Q13907	227 aa		41.97	■■■■■ 4.31
ILK-212	ENST00000532063	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	41.97	■■■■■ 4.31
ILK-212	ENST00000532063	MYOM2	P54296	1465 aa		41.97	■■■■■ 4.31
ILK-212	ENST00000532063	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	41.96	■■■■■ 4.31
ILK-212	ENST00000532063	MROH2A	A6NES4	1674 aa		41.94	■■■■■ 4.31
ILK-212	ENST00000532063	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	41.94	■■■■■ 4.3
ILK-212	ENST00000532063	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		41.92	■■■■■ 4.3
ILK-212	ENST00000532063	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		41.91	■■■■■ 4.3
ILK-212	ENST00000532063	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		41.89	■■■■■ 4.3
ILK-212	ENST00000532063	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.89	■■■■■ 4.3
ILK-212	ENST00000532063	USP47	Q96K76	1375 aa		41.86	■■■■■ 4.29
ILK-212	ENST00000532063	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	41.84	■■■■■ 4.29
ILK-212	ENST00000532063	IFT172	Q9UG01	1749 aa		41.84	■■■■■ 4.29
ILK-212	ENST00000532063	LAMC1	P11047	1609 aa		41.82	■■■■■ 4.29
ILK-212	ENST00000532063	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		41.81	■■■■■ 4.28
ILK-212	ENST00000532063	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	41.79	■■■■■ 4.28
ILK-212	ENST00000532063	TNR	Q92752	1358 aa		41.78	■■■■■ 4.28
ILK-212	ENST00000532063	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		41.78	■■■■■ 4.28
ILK-212	ENST00000532063	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		41.78	■■■■■ 4.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms