RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 REREQ9P2R6 1566 aa32.49■■■□□ 2.79
ACER3-202ENST00000525194 NUP155O75694 1391 aa32.49■■■□□ 2.79
ACER3-202ENST00000525194 KIF3BO15066 747 aa32.48■■■□□ 2.79
ACER3-202ENST00000525194 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.47■■■□□ 2.79
ACER3-202ENST00000525194 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.46■■■□□ 2.79
ACER3-202ENST00000525194 DEPDC5O75140 1603 aa32.44■■■□□ 2.78
ACER3-202ENST00000525194 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
ACER3-202ENST00000525194 KANK1Q14678 1352 aa32.43■■■□□ 2.78
ACER3-202ENST00000525194 PZPP20742 1482 aa32.42■■■□□ 2.78
ACER3-202ENST00000525194 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.41■■■□□ 2.78
ACER3-202ENST00000525194 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
ACER3-202ENST00000525194 AGLP35573 1532 aa32.39■■■□□ 2.78
ACER3-202ENST00000525194 IQGAP3Q86VI3 1631 aa32.39■■■□□ 2.78
ACER3-202ENST00000525194 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
ACER3-202ENST00000525194 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.37■■■□□ 2.77
ACER3-202ENST00000525194 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
ACER3-202ENST00000525194 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.32■■■□□ 2.76
ACER3-202ENST00000525194 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.32■■■□□ 2.76
ACER3-202ENST00000525194 GGT6Q6P531 493 aa32.29■■■□□ 2.76
ACER3-202ENST00000525194 PKD2Q13563 968 aa32.28■■■□□ 2.76
ACER3-202ENST00000525194 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.26■■■□□ 2.75
ACER3-202ENST00000525194 LMTK2Q8IWU2 1503 aa32.24■■■□□ 2.75
ACER3-202ENST00000525194 TET3O43151 1660 aa32.23■■■□□ 2.75
ACER3-202ENST00000525194 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.21■■■□□ 2.75
ACER3-202ENST00000525194 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
ACER3-202ENST00000525194 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
ACER3-202ENST00000525194 FOXD1Q16676 465 aa32.17■■■□□ 2.74
ACER3-202ENST00000525194 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.17■■■□□ 2.74
ACER3-202ENST00000525194 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.17■■■□□ 2.74
ACER3-202ENST00000525194 ABCC3O15438 1527 aa32.16■■■□□ 2.74
ACER3-202ENST00000525194 CEP152O94986 1710 aa32.14■■■□□ 2.74
ACER3-202ENST00000525194 EFCAB6Q5THR3 1501 aa32.13■■■□□ 2.73
ACER3-202ENST00000525194 E9PCH4 1651 aa32.11■■■□□ 2.73
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ACER3-202ENST00000525194 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.08■■■□□ 2.73
ACER3-202ENST00000525194 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
ACER3-202ENST00000525194 MLECQ14165 292 aa32.07■■■□□ 2.72
ACER3-202ENST00000525194 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.07■■■□□ 2.72
ACER3-202ENST00000525194 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.07■■■□□ 2.72
ACER3-202ENST00000525194 NEUROD1Q13562 356 aa32.06■■■□□ 2.72
ACER3-202ENST00000525194 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa32.06■■■□□ 2.72
ACER3-202ENST00000525194 PTPRTO14522 1441 aa32■■■□□ 2.71
ACER3-202ENST00000525194 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32■■■□□ 2.71
ACER3-202ENST00000525194 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa32■■■□□ 2.71
ACER3-202ENST00000525194 NPATQ14207 1427 aa32■■■□□ 2.71
ACER3-202ENST00000525194 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
ACER3-202ENST00000525194 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.99■■■□□ 2.71
ACER3-202ENST00000525194 TRPM2O94759 1503 aa31.97■■■□□ 2.71
ACER3-202ENST00000525194 PLA2R1Q13018 1463 aa31.97■■■□□ 2.71
ACER3-202ENST00000525194 TONSLQ96HA7 1378 aa31.96■■■□□ 2.71
ACER3-202ENST00000525194 MROH2AA6NES4 1674 aa31.9■■■□□ 2.7
ACER3-202ENST00000525194 NOS1P29475 1434 aa31.88■■■□□ 2.69
ACER3-202ENST00000525194 ZMYM3Q14202 1370 aa31.87■■■□□ 2.69
ACER3-202ENST00000525194 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.86■■■□□ 2.69
ACER3-202ENST00000525194 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.84■■■□□ 2.69
ACER3-202ENST00000525194 CLTCL1P53675 1640 aa31.82■■■□□ 2.68
ACER3-202ENST00000525194 ERVK-7P63135 1459 aa31.81■■■□□ 2.68
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ACER3-202ENST00000525194 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.79■■■□□ 2.68
ACER3-202ENST00000525194 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.78■■■□□ 2.68
ACER3-202ENST00000525194 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.77■■■□□ 2.68
ACER3-202ENST00000525194 SYNMO15061 1565 aa31.77■■■□□ 2.68
ACER3-202ENST00000525194 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.77■■■□□ 2.68
ACER3-202ENST00000525194 L3MBTL2Q969R5 705 aa31.76■■■□□ 2.67
ACER3-202ENST00000525194 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
ACER3-202ENST00000525194 KIF1BO60333 1816 aa31.74■■■□□ 2.67
ACER3-202ENST00000525194 PIK3C2BO00750 1634 aa31.74■■■□□ 2.67
ACER3-202ENST00000525194 MADDQ8WXG6 1647 aa31.74■■■□□ 2.67
ACER3-202ENST00000525194 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
ACER3-202ENST00000525194 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.72■■■□□ 2.67
ACER3-202ENST00000525194 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.72■■■□□ 2.67
ACER3-202ENST00000525194 C3P01024 1663 aa31.7■■■□□ 2.66
ACER3-202ENST00000525194 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
ACER3-202ENST00000525194 IDI1Q13907 227 aa31.66■■■□□ 2.66
ACER3-202ENST00000525194 RGL3Q3MIN7 710 aa31.66■■■□□ 2.66
ACER3-202ENST00000525194 STAC3Q96MF2 364 aa31.66■■■□□ 2.66
ACER3-202ENST00000525194 TNRQ92752 1358 aa31.66■■■□□ 2.66
ACER3-202ENST00000525194 ADGRB3O60242 1522 aa31.64■■■□□ 2.66
ACER3-202ENST00000525194 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
ACER3-202ENST00000525194 DCAF11Q8TEB1 546 aa31.62■■■□□ 2.65
ACER3-202ENST00000525194 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
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ACER3-202ENST00000525194 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.57■■■□□ 2.64
ACER3-202ENST00000525194 NLRP1Q9C000 1473 aa31.57■■■□□ 2.64
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ACER3-202ENST00000525194 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa31.54■■■□□ 2.64
ACER3-202ENST00000525194 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.54■■■□□ 2.64
ACER3-202ENST00000525194 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.64
ACER3-202ENST00000525194 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.51■■■□□ 2.63
ACER3-202ENST00000525194 PTPRMP28827 1452 aa31.49■■■□□ 2.63
ACER3-202ENST00000525194 MYOM2P54296 1465 aa31.48■■■□□ 2.63
ACER3-202ENST00000525194 IFT172Q9UG01 1749 aa31.47■■■□□ 2.63
ACER3-202ENST00000525194 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.46■■■□□ 2.63
ACER3-202ENST00000525194 NBPF8Q3BBV2 869 aa31.45■■■□□ 2.63
ACER3-202ENST00000525194 PRAG1Q86YV5 1406 aa31.45■■■□□ 2.63
ACER3-202ENST00000525194 PPLO60437 1756 aa31.44■■■□□ 2.62
ACER3-202ENST00000525194 VGFO15240 615 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
ACER3-202ENST00000525194 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.42■■■□□ 2.62
ACER3-202ENST00000525194 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.42■■■□□ 2.62
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