RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525151.5

TRAF3IP2-AS1-208, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 609 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.17■■■□□ 2.1
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DEPDC5O75140 1603 aa28.15■■■□□ 2.1
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MED14O60244 1454 aa28.14■■■□□ 2.09
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IQGAP1P46940 1657 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TNRQ92752 1358 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PZPP20742 1482 aa28.08■■■□□ 2.09
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.08■■■□□ 2.09
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.06■■■□□ 2.08
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SYNMO15061 1565 aa28.06■■■□□ 2.08
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.03■■■□□ 2.08
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MBD5Q9P267 1494 aa28.02■■■□□ 2.08
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.02■■■□□ 2.08
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.02■■■□□ 2.08
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MIA2Q96PC5 1412 aa27.99■■■□□ 2.07
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NLRP1Q9C000 1473 aa27.98■■■□□ 2.07
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 POTEAQ6S8J7 498 aa27.98■■■□□ 2.07
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.95■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.94■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TIAM1Q13009 1591 aa27.94■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.93■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KIF3BO15066 747 aa27.91■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.78■■■□□ 2.04
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.77■■■□□ 2.04
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ABCC3O15438 1527 aa27.77■■■□□ 2.04
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NCOA2Q15596 1464 aa27.76■■■□□ 2.04
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ERVK-7P63135 1459 aa27.75■■■□□ 2.03
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.75■■■□□ 2.03
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.73■■■□□ 2.03
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CEP152O94986 1710 aa27.72■■■□□ 2.03
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.72■■■□□ 2.03
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LTKP29376 864 aa27.72■■■□□ 2.03
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.71■■■□□ 2.03
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SLIT1O75093 1534 aa27.69■■■□□ 2.02
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.69■■■□□ 2.02
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MAP3K1Q13233 1512 aa27.67■■■□□ 2.02
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.67■■■□□ 2.02
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CEP162Q5TB80 1403 aa27.65■■■□□ 2.02
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.62■■■□□ 2.01
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PHLPP1O60346 1717 aa27.61■■■□□ 2.01
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TMEM94Q12767 1356 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PIK3C2BO00750 1634 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.55■■■□□ 2
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TET3O43151 1660 aa27.53■■■□□ 2
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.53■■■□□ 2
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.53■■■□□ 2
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LRP6O75581 1613 aa27.52■■■□□ 2
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.49■■□□□ 1.99
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NWD1Q149M9 1564 aa27.48■■□□□ 1.99
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.47■■□□□ 1.99
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KCNA6P17658 529 aa27.46■■□□□ 1.99
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 JCADQ9P266 1359 aa27.46■■□□□ 1.99
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.43■■□□□ 1.98
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TSPY4P0CV99 314 aa27.43■■□□□ 1.98
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TSPY10P0CW01 314 aa27.43■■□□□ 1.98
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 EID1Q9Y6B2 187 aa27.42■■□□□ 1.98
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TRIM52Q96A61 297 aa27.4■■□□□ 1.98
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.4■■□□□ 1.98
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.38■■□□□ 1.97
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SLAIN2Q9P270 581 aa27.38■■□□□ 1.97
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SHPRHQ149N8 1683 aa27.36■■□□□ 1.97
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.33■■□□□ 1.97
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MSH6P52701 1360 aa27.33■■□□□ 1.97
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IDI1Q13907 227 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DIP2AQ14689 1571 aa27.26■■□□□ 1.96
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ADGRB3O60242 1522 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms