RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 ADGRL2O95490 1459 aa30.26■■■□□ 2.44
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SMIM20-201ENST00000506197 ROCK1Q13464 1354 aa30.23■■■□□ 2.43
SMIM20-201ENST00000506197 NCOA1Q15788 1441 aa30.2■■■□□ 2.42
SMIM20-201ENST00000506197 KIF15Q9NS87 1388 aa30.17■■■□□ 2.42
SMIM20-201ENST00000506197 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.17■■■□□ 2.42
SMIM20-201ENST00000506197 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.16■■■□□ 2.42
SMIM20-201ENST00000506197 ZMYM3Q14202 1370 aa30.15■■■□□ 2.42
SMIM20-201ENST00000506197 STRCQ7RTU9 1775 aa30.15■■■□□ 2.42
SMIM20-201ENST00000506197 NPATQ14207 1427 aa30.15■■■□□ 2.42
SMIM20-201ENST00000506197 GGT6Q6P531 493 aa30.15■■■□□ 2.42
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SMIM20-201ENST00000506197 HFM1A2PYH4 1435 aa30.11■■■□□ 2.41
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SMIM20-201ENST00000506197 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.08■■■□□ 2.41
SMIM20-201ENST00000506197 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.07■■■□□ 2.4
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SMIM20-201ENST00000506197 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.04■■■□□ 2.4
SMIM20-201ENST00000506197 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.04■■■□□ 2.4
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SMIM20-201ENST00000506197 DEPDC5O75140 1603 aa29.89■■■□□ 2.37
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SMIM20-201ENST00000506197 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.84■■■□□ 2.37
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SMIM20-201ENST00000506197 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
SMIM20-201ENST00000506197 CEP152O94986 1710 aa29.8■■■□□ 2.36
SMIM20-201ENST00000506197 TRIM52Q96A61 297 aa29.8■■■□□ 2.36
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SMIM20-201ENST00000506197 ERVK-7P63135 1459 aa29.68■■■□□ 2.34
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SMIM20-201ENST00000506197 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.64■■■□□ 2.34
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SMIM20-201ENST00000506197 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
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SMIM20-201ENST00000506197 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.58■■■□□ 2.33
SMIM20-201ENST00000506197 E9PCH4 1651 aa29.56■■■□□ 2.32
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SMIM20-201ENST00000506197 IQGAP1P46940 1657 aa29.5■■■□□ 2.31
SMIM20-201ENST00000506197 MED14O60244 1454 aa29.5■■■□□ 2.31
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SMIM20-201ENST00000506197 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.46■■■□□ 2.31
SMIM20-201ENST00000506197 PIK3C2BO00750 1634 aa29.45■■■□□ 2.3
SMIM20-201ENST00000506197 CPS1P31327 1500 aa29.44■■■□□ 2.3
SMIM20-201ENST00000506197 FOXD1Q16676 465 aa29.42■■■□□ 2.3
SMIM20-201ENST00000506197 SYNMO15061 1565 aa29.4■■■□□ 2.3
SMIM20-201ENST00000506197 SLIT1O75093 1534 aa29.4■■■□□ 2.3
SMIM20-201ENST00000506197 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
SMIM20-201ENST00000506197 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.39■■■□□ 2.3
SMIM20-201ENST00000506197 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
SMIM20-201ENST00000506197 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
SMIM20-201ENST00000506197 NOS1P29475 1434 aa29.35■■■□□ 2.29
SMIM20-201ENST00000506197 TRPM2O94759 1503 aa29.35■■■□□ 2.29
SMIM20-201ENST00000506197 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.34■■■□□ 2.29
SMIM20-201ENST00000506197 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.31■■■□□ 2.28
SMIM20-201ENST00000506197 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.31■■■□□ 2.28
SMIM20-201ENST00000506197 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.3■■■□□ 2.28
SMIM20-201ENST00000506197 ADGRB3O60242 1522 aa29.3■■■□□ 2.28
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