RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
PITX1-204ENST00000504936 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.05■■■□□ 2.24
PITX1-204ENST00000504936 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.04■■■□□ 2.24
PITX1-204ENST00000504936 ADGRL2O95490 1459 aa29.04■■■□□ 2.24
PITX1-204ENST00000504936 ERBINQ96RT1 1412 aa29.03■■■□□ 2.24
PITX1-204ENST00000504936 CEP152O94986 1710 aa29.03■■■□□ 2.24
PITX1-204ENST00000504936 NCOA1Q15788 1441 aa29.01■■■□□ 2.23
PITX1-204ENST00000504936 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PITX1-204ENST00000504936 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PITX1-204ENST00000504936 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.99■■■□□ 2.23
PITX1-204ENST00000504936 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.99■■■□□ 2.23
PITX1-204ENST00000504936 ZMYM3Q14202 1370 aa28.99■■■□□ 2.23
PITX1-204ENST00000504936 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.98■■■□□ 2.23
PITX1-204ENST00000504936 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
PITX1-204ENST00000504936 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
PITX1-204ENST00000504936 PTPRKQ15262 1439 aa28.96■■■□□ 2.23
PITX1-204ENST00000504936 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.96■■■□□ 2.23
PITX1-204ENST00000504936 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.95■■■□□ 2.22
PITX1-204ENST00000504936 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
PITX1-204ENST00000504936 DEPDC5O75140 1603 aa28.93■■■□□ 2.22
PITX1-204ENST00000504936 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.93■■■□□ 2.22
PITX1-204ENST00000504936 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
PITX1-204ENST00000504936 ABCC3O15438 1527 aa28.91■■■□□ 2.22
PITX1-204ENST00000504936 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.91■■■□□ 2.22
PITX1-204ENST00000504936 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.9■■■□□ 2.22
PITX1-204ENST00000504936 KANK1Q14678 1352 aa28.88■■■□□ 2.21
PITX1-204ENST00000504936 ROCK1Q13464 1354 aa28.88■■■□□ 2.21
PITX1-204ENST00000504936 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.87■■■□□ 2.21
PITX1-204ENST00000504936 NPATQ14207 1427 aa28.87■■■□□ 2.21
PITX1-204ENST00000504936 PZPP20742 1482 aa28.85■■■□□ 2.21
PITX1-204ENST00000504936 HSPA2P54652 639 aa28.84■■■□□ 2.21
PITX1-204ENST00000504936 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
PITX1-204ENST00000504936 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.8■■■□□ 2.2
PITX1-204ENST00000504936 UNC13BO14795 1591 aa28.78■■■□□ 2.2
PITX1-204ENST00000504936 TNRQ92752 1358 aa28.76■■■□□ 2.2
PITX1-204ENST00000504936 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
PITX1-204ENST00000504936 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
PITX1-204ENST00000504936 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX1-204ENST00000504936 ERVK-7P63135 1459 aa28.71■■■□□ 2.19
PITX1-204ENST00000504936 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.7■■■□□ 2.18
PITX1-204ENST00000504936 TET3O43151 1660 aa28.7■■■□□ 2.18
PITX1-204ENST00000504936 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX1-204ENST00000504936 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX1-204ENST00000504936 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.67■■■□□ 2.18
PITX1-204ENST00000504936 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.66■■■□□ 2.18
PITX1-204ENST00000504936 NAIPQ13075 1403 aa28.65■■■□□ 2.18
PITX1-204ENST00000504936 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.65■■■□□ 2.18
PITX1-204ENST00000504936 STRCQ7RTU9 1775 aa28.65■■■□□ 2.18
PITX1-204ENST00000504936 NLRP1Q9C000 1473 aa28.63■■■□□ 2.17
PITX1-204ENST00000504936 NUP155O75694 1391 aa28.62■■■□□ 2.17
PITX1-204ENST00000504936 HFM1A2PYH4 1435 aa28.61■■■□□ 2.17
PITX1-204ENST00000504936 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.58■■■□□ 2.17
PITX1-204ENST00000504936 E9PCH4 1651 aa28.58■■■□□ 2.17
PITX1-204ENST00000504936 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PITX1-204ENST00000504936 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
PITX1-204ENST00000504936 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.54■■■□□ 2.16
PITX1-204ENST00000504936 SYNMO15061 1565 aa28.54■■■□□ 2.16
PITX1-204ENST00000504936 TRIM52Q96A61 297 aa28.53■■■□□ 2.16
PITX1-204ENST00000504936 PIK3C2BO00750 1634 aa28.53■■■□□ 2.16
PITX1-204ENST00000504936 PLA2R1Q13018 1463 aa28.52■■■□□ 2.16
PITX1-204ENST00000504936 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.49■■■□□ 2.15
PITX1-204ENST00000504936 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.48■■■□□ 2.15
PITX1-204ENST00000504936 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.47■■■□□ 2.15
PITX1-204ENST00000504936 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.47■■■□□ 2.15
PITX1-204ENST00000504936 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
PITX1-204ENST00000504936 NOS1P29475 1434 aa28.46■■■□□ 2.15
PITX1-204ENST00000504936 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.46■■■□□ 2.15
PITX1-204ENST00000504936 PKD2Q13563 968 aa28.42■■■□□ 2.14
PITX1-204ENST00000504936 ADGRB3O60242 1522 aa28.41■■■□□ 2.14
PITX1-204ENST00000504936 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
PITX1-204ENST00000504936 PTPRTO14522 1441 aa28.4■■■□□ 2.14
PITX1-204ENST00000504936 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.39■■■□□ 2.14
PITX1-204ENST00000504936 IDI1Q13907 227 aa28.38■■■□□ 2.13
PITX1-204ENST00000504936 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.38■■■□□ 2.13
PITX1-204ENST00000504936 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.37■■■□□ 2.13
PITX1-204ENST00000504936 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.37■■■□□ 2.13
PITX1-204ENST00000504936 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
PITX1-204ENST00000504936 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
PITX1-204ENST00000504936 IQGAP1P46940 1657 aa28.35■■■□□ 2.13
PITX1-204ENST00000504936 SLIT1O75093 1534 aa28.3■■■□□ 2.12
PITX1-204ENST00000504936 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
PITX1-204ENST00000504936 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.3■■■□□ 2.12
PITX1-204ENST00000504936 KIF1BO60333 1816 aa28.29■■■□□ 2.12
PITX1-204ENST00000504936 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.29■■■□□ 2.12
PITX1-204ENST00000504936 EID1Q9Y6B2 187 aa28.29■■■□□ 2.12
PITX1-204ENST00000504936 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PITX1-204ENST00000504936 TRPM2O94759 1503 aa28.27■■■□□ 2.12
PITX1-204ENST00000504936 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.27■■■□□ 2.12
PITX1-204ENST00000504936 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.26■■■□□ 2.12
PITX1-204ENST00000504936 CLTCL1P53675 1640 aa28.26■■■□□ 2.11
PITX1-204ENST00000504936 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.25■■■□□ 2.11
PITX1-204ENST00000504936 MED14O60244 1454 aa28.23■■■□□ 2.11
PITX1-204ENST00000504936 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
PITX1-204ENST00000504936 LTKP29376 864 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX1-204ENST00000504936 FOXD1Q16676 465 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX1-204ENST00000504936 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PITX1-204ENST00000504936 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.19■■■□□ 2.1
PITX1-204ENST00000504936 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PITX1-204ENST00000504936 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.18■■■□□ 2.1
PITX1-204ENST00000504936 BCANQ96GW7 911 aa28.18■■■□□ 2.1
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