RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.01■■■■■ 4.96
PITX1-204ENST00000504936 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.01■■■■■ 4.16
PITX1-204ENST00000504936 ABCC9O60706 1549 aa40.1■■■■■ 4.01
PITX1-204ENST00000504936 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.57■■■■□ 3.77
PITX1-204ENST00000504936 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.57■■■■□ 3.76
PITX1-204ENST00000504936 NACADO15069 1562 aa38.48■■■■□ 3.75
PITX1-204ENST00000504936 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.34■■■■□ 3.73
PITX1-204ENST00000504936 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.13■■■■□ 3.69
PITX1-204ENST00000504936 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38■■■■□ 3.67
PITX1-204ENST00000504936 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.82■■■■□ 3.65
PITX1-204ENST00000504936 SCRIBQ14160 1630 aa37.5■■■■□ 3.59
PITX1-204ENST00000504936 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.42■■■■□ 3.58
PITX1-204ENST00000504936 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.33■■■■□ 3.57
PITX1-204ENST00000504936 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.9■■■■□ 3.5
PITX1-204ENST00000504936 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.6■■■■□ 3.45
PITX1-204ENST00000504936 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
PITX1-204ENST00000504936 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.27■■■■□ 3.4
PITX1-204ENST00000504936 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.99■■■■□ 3.35
PITX1-204ENST00000504936 SMARCA4P51532 1647 aa35.79■■■■□ 3.32
PITX1-204ENST00000504936 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
PITX1-204ENST00000504936 SMARCA2P51531 1590 aa35.52■■■■□ 3.28
PITX1-204ENST00000504936 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.48■■■■□ 3.27
PITX1-204ENST00000504936 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.48■■■■□ 3.27
PITX1-204ENST00000504936 NCAPD3P42695 1498 aa35.4■■■■□ 3.26
PITX1-204ENST00000504936 HMGXB3Q12766 1538 aa35.33■■■■□ 3.25
PITX1-204ENST00000504936 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.32■■■■□ 3.24
PITX1-204ENST00000504936 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
PITX1-204ENST00000504936 WIZO95785 1651 aa35.2■■■■□ 3.23
PITX1-204ENST00000504936 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
PITX1-204ENST00000504936 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
PITX1-204ENST00000504936 NESP48681 1621 aa34.67■■■■□ 3.14
PITX1-204ENST00000504936 ERCC6Q03468 1493 aa34.63■■■■□ 3.13
PITX1-204ENST00000504936 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.6■■■■□ 3.13
PITX1-204ENST00000504936 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.41■■■■□ 3.1
PITX1-204ENST00000504936 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.41■■■■□ 3.1
PITX1-204ENST00000504936 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.33■■■■□ 3.09
PITX1-204ENST00000504936 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
PITX1-204ENST00000504936 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.31■■■■□ 3.08
PITX1-204ENST00000504936 PRDM2Q13029 1718 aa34.23■■■■□ 3.07
PITX1-204ENST00000504936 CFTRP13569 1480 aa34.2■■■■□ 3.07
PITX1-204ENST00000504936 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
PITX1-204ENST00000504936 CUX2O14529 1486 aa34.14■■■■□ 3.06
PITX1-204ENST00000504936 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.1■■■■□ 3.05
PITX1-204ENST00000504936 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.09■■■■□ 3.05
PITX1-204ENST00000504936 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.01■■■■□ 3.03
PITX1-204ENST00000504936 WDR62O43379 1518 aa33.88■■■■□ 3.01
PITX1-204ENST00000504936 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
PITX1-204ENST00000504936 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.55■■■□□ 2.96
PITX1-204ENST00000504936 TOPBP1Q92547 1522 aa33.55■■■□□ 2.96
PITX1-204ENST00000504936 ABCC8Q09428 1581 aa33.52■■■□□ 2.96
PITX1-204ENST00000504936 IFT140Q96RY7 1462 aa33.33■■■□□ 2.93
PITX1-204ENST00000504936 CUX1P39880 1505 aa33.31■■■□□ 2.92
PITX1-204ENST00000504936 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
PITX1-204ENST00000504936 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.22■■■□□ 2.91
PITX1-204ENST00000504936 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.18■■■□□ 2.9
PITX1-204ENST00000504936 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.18■■■□□ 2.9
PITX1-204ENST00000504936 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
PITX1-204ENST00000504936 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.12■■■□□ 2.89
PITX1-204ENST00000504936 SOGA1O94964 1423 aa33.11■■■□□ 2.89
PITX1-204ENST00000504936 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.1■■■□□ 2.89
PITX1-204ENST00000504936 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.08■■■□□ 2.89
PITX1-204ENST00000504936 SYNJ1O43426 1573 aa33.06■■■□□ 2.88
PITX1-204ENST00000504936 TOP2BQ02880 1626 aa33.05■■■□□ 2.88
PITX1-204ENST00000504936 WDR97A6NE52 1622 aa33■■■□□ 2.87
PITX1-204ENST00000504936 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.99■■■□□ 2.874e-12■■□□□ 14.4
PITX1-204ENST00000504936 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.96■■■□□ 2.87
PITX1-204ENST00000504936 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
PITX1-204ENST00000504936 PBRM1Q86U86 1689 aa32.85■■■□□ 2.85
PITX1-204ENST00000504936 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.84■■■□□ 2.85
PITX1-204ENST00000504936 CHD1O14646 1710 aa32.8■■■□□ 2.84
PITX1-204ENST00000504936 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.77■■■□□ 2.84
PITX1-204ENST00000504936 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.76■■■□□ 2.84
PITX1-204ENST00000504936 GRIN2BQ13224 1484 aa32.74■■■□□ 2.83
PITX1-204ENST00000504936 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.74■■■□□ 2.83
PITX1-204ENST00000504936 FBLN2P98095 1184 aa32.69■■■□□ 2.82
PITX1-204ENST00000504936 OSCARQ8IYS5 282 aa32.69■■■□□ 2.82
PITX1-204ENST00000504936 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
PITX1-204ENST00000504936 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
PITX1-204ENST00000504936 SYNJ2O15056 1496 aa32.52■■■□□ 2.8
PITX1-204ENST00000504936 ADAMTS12P58397 1594 aa32.49■■■□□ 2.79
PITX1-204ENST00000504936 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.47■■■□□ 2.79
PITX1-204ENST00000504936 KIF27Q86VH2 1401 aa32.41■■■□□ 2.78
PITX1-204ENST00000504936 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.35■■■□□ 2.77
PITX1-204ENST00000504936 TRIM41Q8WV44 630 aa32.35■■■□□ 2.77
PITX1-204ENST00000504936 GRIN2AQ12879 1464 aa32.33■■■□□ 2.77
PITX1-204ENST00000504936 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.29■■■□□ 2.76
PITX1-204ENST00000504936 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.29■■■□□ 2.76
PITX1-204ENST00000504936 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.29■■■□□ 2.76
PITX1-204ENST00000504936 CUL7Q14999 1698 aa32.28■■■□□ 2.76
PITX1-204ENST00000504936 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.27■■■□□ 2.76
PITX1-204ENST00000504936 ARHGEF11O15085 1522 aa32.23■■■□□ 2.75
PITX1-204ENST00000504936 CEP170Q5SW79 1584 aa32.19■■■□□ 2.74
PITX1-204ENST00000504936 IGF1RP08069 1367 aa32.17■■■□□ 2.74
PITX1-204ENST00000504936 NUP160Q12769 1436 aa32.11■■■□□ 2.73
PITX1-204ENST00000504936 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.1■■■□□ 2.73
PITX1-204ENST00000504936 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.06■■■□□ 2.72
PITX1-204ENST00000504936 ARAP1Q96P48 1450 aa31.96■■■□□ 2.71
PITX1-204ENST00000504936 SHROOM2Q13796 1616 aa31.93■■■□□ 2.7
PITX1-204ENST00000504936 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.91■■■□□ 2.7
PITX1-204ENST00000504936 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.9■■■□□ 2.7
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