RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.25■■■□□ 2.11
NELFE-211ENST00000492185 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.25■■■□□ 2.11
NELFE-211ENST00000492185 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.11
NELFE-211ENST00000492185 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
NELFE-211ENST00000492185 NEO1Q92859 1461 aa28.21■■■□□ 2.11
NELFE-211ENST00000492185 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.21■■■□□ 2.11
NELFE-211ENST00000492185 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.2■■■□□ 2.1
NELFE-211ENST00000492185 GLI2P10070 1586 aa28.2■■■□□ 2.1
NELFE-211ENST00000492185 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.2■■■□□ 2.1
NELFE-211ENST00000492185 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
NELFE-211ENST00000492185 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.14e-10■■□□□ 12.8
NELFE-211ENST00000492185 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.19■■■□□ 2.1
NELFE-211ENST00000492185 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
NELFE-211ENST00000492185 E9PCH4 1651 aa28.19■■■□□ 2.1
NELFE-211ENST00000492185 TET3O43151 1660 aa28.18■■■□□ 2.1
NELFE-211ENST00000492185 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.18■■■□□ 2.1
NELFE-211ENST00000492185 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
NELFE-211ENST00000492185 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
NELFE-211ENST00000492185 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.16■■■□□ 2.1
NELFE-211ENST00000492185 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.13■■■□□ 2.09
NELFE-211ENST00000492185 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.11■■■□□ 2.09
NELFE-211ENST00000492185 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
NELFE-211ENST00000492185 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.11■■■□□ 2.09
NELFE-211ENST00000492185 PTPRTO14522 1441 aa28.1■■■□□ 2.09
NELFE-211ENST00000492185 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.1■■■□□ 2.09
NELFE-211ENST00000492185 TRPM2O94759 1503 aa28.09■■■□□ 2.09
NELFE-211ENST00000492185 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.08■■■□□ 2.09
NELFE-211ENST00000492185 A2MP01023 1474 aa28.07■■■□□ 2.08
NELFE-211ENST00000492185 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.07■■■□□ 2.08
NELFE-211ENST00000492185 KANK1Q14678 1352 aa28.05■■■□□ 2.08
NELFE-211ENST00000492185 CCDC7Q96M83 1385 aa28.05■■■□□ 2.08
NELFE-211ENST00000492185 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.05■■■□□ 2.08
NELFE-211ENST00000492185 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.04■■■□□ 2.08
NELFE-211ENST00000492185 RICTORQ6R327 1708 aa28.04■■■□□ 2.08
NELFE-211ENST00000492185 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.04■■■□□ 2.08
NELFE-211ENST00000492185 ABCA6Q8N139 1617 aa28.04■■■□□ 2.08
NELFE-211ENST00000492185 CEP152O94986 1710 aa28.03■■■□□ 2.08
NELFE-211ENST00000492185 DIP2BQ9P265 1576 aa28.02■■■□□ 2.08
NELFE-211ENST00000492185 USP47Q96K76 1375 aa28.02■■■□□ 2.08
NELFE-211ENST00000492185 KIF3BO15066 747 aa28.01■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 DCAF11Q8TEB1 546 aa28■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.99■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 LAMC1P11047 1609 aa27.99■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.98■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 CLTCL1P53675 1640 aa27.98■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.97■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 CCER2I3L3R5 266 aa27.96■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.96■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.95■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
NELFE-211ENST00000492185 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.95■■■□□ 2.06
NELFE-211ENST00000492185 ANP32CO43423 234 aa27.94■■■□□ 2.06
NELFE-211ENST00000492185 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.93■■■□□ 2.06
NELFE-211ENST00000492185 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.92■■■□□ 2.06
NELFE-211ENST00000492185 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
NELFE-211ENST00000492185 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
NELFE-211ENST00000492185 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.89■■■□□ 2.06
NELFE-211ENST00000492185 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.88■■■□□ 2.05
NELFE-211ENST00000492185 RGL3Q3MIN7 710 aa27.87■■■□□ 2.05
NELFE-211ENST00000492185 RAPGEF3O95398 923 aa27.86■■■□□ 2.05
NELFE-211ENST00000492185 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
NELFE-211ENST00000492185 MADDQ8WXG6 1647 aa27.86■■■□□ 2.05
NELFE-211ENST00000492185 STAC3Q96MF2 364 aa27.84■■■□□ 2.05
NELFE-211ENST00000492185 ABCC3O15438 1527 aa27.82■■■□□ 2.04
NELFE-211ENST00000492185 KIF1BO60333 1816 aa27.81■■■□□ 2.04
NELFE-211ENST00000492185 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.81■■■□□ 2.04
NELFE-211ENST00000492185 IFT172Q9UG01 1749 aa27.77■■■□□ 2.04
NELFE-211ENST00000492185 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.77■■■□□ 2.04
NELFE-211ENST00000492185 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
NELFE-211ENST00000492185 NPATQ14207 1427 aa27.76■■■□□ 2.04
NELFE-211ENST00000492185 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.76■■■□□ 2.04
NELFE-211ENST00000492185 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.76■■■□□ 2.03
NELFE-211ENST00000492185 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.76■■■□□ 2.03
NELFE-211ENST00000492185 TSPOAP1O95153 1857 aa27.76■■■□□ 2.03
NELFE-211ENST00000492185 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.75■■■□□ 2.03
NELFE-211ENST00000492185 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.75■■■□□ 2.03
NELFE-211ENST00000492185 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.74■■■□□ 2.03
NELFE-211ENST00000492185 MYOM2P54296 1465 aa27.73■■■□□ 2.03
NELFE-211ENST00000492185 REREQ9P2R6 1566 aa27.73■■■□□ 2.03
NELFE-211ENST00000492185 ADGRB3O60242 1522 aa27.72■■■□□ 2.03
NELFE-211ENST00000492185 MROH2AA6NES4 1674 aa27.72■■■□□ 2.03
NELFE-211ENST00000492185 IQGAP1P46940 1657 aa27.72■■■□□ 2.03
NELFE-211ENST00000492185 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.69■■■□□ 2.02
NELFE-211ENST00000492185 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.68■■■□□ 2.02
NELFE-211ENST00000492185 NOS1P29475 1434 aa27.68■■■□□ 2.02
NELFE-211ENST00000492185 GGT6Q6P531 493 aa27.67■■■□□ 2.02
NELFE-211ENST00000492185 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
NELFE-211ENST00000492185 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.66■■■□□ 2.02
NELFE-211ENST00000492185 PIK3C2BO00750 1634 aa27.66■■■□□ 2.02
NELFE-211ENST00000492185 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
NELFE-211ENST00000492185 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
NELFE-211ENST00000492185 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.63■■■□□ 2.01
NELFE-211ENST00000492185 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.63■■■□□ 2.01
NELFE-211ENST00000492185 AGLP35573 1532 aa27.63■■■□□ 2.01
NELFE-211ENST00000492185 TESK2Q96S53 571 aa27.62■■■□□ 2.01
NELFE-211ENST00000492185 SYNMO15061 1565 aa27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms