RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.52■■■■■ 4.72
NELFE-211ENST00000492185 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.67■■■■□ 3.78
NELFE-211ENST00000492185 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
NELFE-211ENST00000492185 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.88■■■■□ 3.49
NELFE-211ENST00000492185 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.45■■■■□ 3.43
NELFE-211ENST00000492185 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.34■■■■□ 3.41
NELFE-211ENST00000492185 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.29■■■■□ 3.4
NELFE-211ENST00000492185 ABCC9O60706 1549 aa36.02■■■■□ 3.36
NELFE-211ENST00000492185 NACADO15069 1562 aa35.87■■■■□ 3.33
NELFE-211ENST00000492185 SCRIBQ14160 1630 aa35.52■■■■□ 3.28
NELFE-211ENST00000492185 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.41■■■■□ 3.26
NELFE-211ENST00000492185 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
NELFE-211ENST00000492185 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.83■■■■□ 3.17
NELFE-211ENST00000492185 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
NELFE-211ENST00000492185 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.54■■■■□ 3.12
NELFE-211ENST00000492185 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.43■■■■□ 3.1
NELFE-211ENST00000492185 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.4■■■■□ 3.1
NELFE-211ENST00000492185 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
NELFE-211ENST00000492185 SMARCA4P51532 1647 aa34.14■■■■□ 3.06
NELFE-211ENST00000492185 WIZO95785 1651 aa34.14■■■■□ 3.06
NELFE-211ENST00000492185 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.11■■■■□ 3.05
NELFE-211ENST00000492185 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34■■■■□ 3.03
NELFE-211ENST00000492185 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
NELFE-211ENST00000492185 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.76■■■■□ 3
NELFE-211ENST00000492185 SMARCA2P51531 1590 aa33.52■■■□□ 2.96
NELFE-211ENST00000492185 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
NELFE-211ENST00000492185 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.45■■■□□ 2.95
NELFE-211ENST00000492185 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.44■■■□□ 2.94
NELFE-211ENST00000492185 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
NELFE-211ENST00000492185 TRIM41Q8WV44 630 aa33.14■■■□□ 2.9
NELFE-211ENST00000492185 HMGXB3Q12766 1538 aa33.11■■■□□ 2.89
NELFE-211ENST00000492185 NCAPD3P42695 1498 aa33.1■■■□□ 2.89
NELFE-211ENST00000492185 ABCC8Q09428 1581 aa32.87■■■□□ 2.85
NELFE-211ENST00000492185 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.75■■■□□ 2.83
NELFE-211ENST00000492185 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.67■■■□□ 2.82
NELFE-211ENST00000492185 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.59■■■□□ 2.81
NELFE-211ENST00000492185 SYNJ1O43426 1573 aa32.5■■■□□ 2.79
NELFE-211ENST00000492185 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
NELFE-211ENST00000492185 CFTRP13569 1480 aa32.49■■■□□ 2.79
NELFE-211ENST00000492185 PRDM2Q13029 1718 aa32.42■■■□□ 2.78
NELFE-211ENST00000492185 EEA1Q15075 1411 aa32.39■■■□□ 2.78
NELFE-211ENST00000492185 TOP2BQ02880 1626 aa32.35■■■□□ 2.77
NELFE-211ENST00000492185 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.34■■■□□ 2.77
NELFE-211ENST00000492185 SOGA1O94964 1423 aa32.33■■■□□ 2.77
NELFE-211ENST00000492185 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.23■■■□□ 2.75
NELFE-211ENST00000492185 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.2■■■□□ 2.75
NELFE-211ENST00000492185 CUX1P39880 1505 aa32.15■■■□□ 2.74
NELFE-211ENST00000492185 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.1■■■□□ 2.73
NELFE-211ENST00000492185 KIF21BO75037 1637 aa32■■■□□ 2.71
NELFE-211ENST00000492185 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.95■■■□□ 2.71
NELFE-211ENST00000492185 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.94■■■□□ 2.7
NELFE-211ENST00000492185 GOLGA3Q08378 1498 aa31.94■■■□□ 2.7
NELFE-211ENST00000492185 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.91■■■□□ 2.7
NELFE-211ENST00000492185 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.89■■■□□ 2.7
NELFE-211ENST00000492185 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.88■■■□□ 2.69
NELFE-211ENST00000492185 NESP48681 1621 aa31.8■■■□□ 2.68
NELFE-211ENST00000492185 CEP162Q5TB80 1403 aa31.78■■■□□ 2.68
NELFE-211ENST00000492185 KIF27Q86VH2 1401 aa31.72■■■□□ 2.67
NELFE-211ENST00000492185 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.72■■■□□ 2.67
NELFE-211ENST00000492185 PRXQ9BXM0 1461 aa31.7■■■□□ 2.66
NELFE-211ENST00000492185 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.69■■■□□ 2.66
NELFE-211ENST00000492185 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.69■■■□□ 2.66
NELFE-211ENST00000492185 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.68■■■□□ 2.66
NELFE-211ENST00000492185 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.67■■■□□ 2.66
NELFE-211ENST00000492185 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.66■■■□□ 2.66
NELFE-211ENST00000492185 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
NELFE-211ENST00000492185 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
NELFE-211ENST00000492185 TOPBP1Q92547 1522 aa31.61■■■□□ 2.65
NELFE-211ENST00000492185 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.56■■■□□ 2.64
NELFE-211ENST00000492185 CUX2O14529 1486 aa31.54■■■□□ 2.64
NELFE-211ENST00000492185 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
NELFE-211ENST00000492185 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
NELFE-211ENST00000492185 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.48■■■□□ 2.63
NELFE-211ENST00000492185 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.46■■■□□ 2.63
NELFE-211ENST00000492185 IGF1RP08069 1367 aa31.43■■■□□ 2.62
NELFE-211ENST00000492185 CLIP1P30622 1438 aa31.42■■■□□ 2.62
NELFE-211ENST00000492185 WDR97A6NE52 1622 aa31.39■■■□□ 2.62
NELFE-211ENST00000492185 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.36■■■□□ 2.61
NELFE-211ENST00000492185 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.24■■■□□ 2.59
NELFE-211ENST00000492185 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.24■■■□□ 2.59
NELFE-211ENST00000492185 HRCP23327 699 aa31.21■■■□□ 2.59
NELFE-211ENST00000492185 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.2■■■□□ 2.59
NELFE-211ENST00000492185 CUL7Q14999 1698 aa31.18■■■□□ 2.58
NELFE-211ENST00000492185 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.18■■■□□ 2.58
NELFE-211ENST00000492185 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
NELFE-211ENST00000492185 ARAP1Q96P48 1450 aa31.13■■■□□ 2.57
NELFE-211ENST00000492185 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
NELFE-211ENST00000492185 WDR62O43379 1518 aa31.04■■■□□ 2.56
NELFE-211ENST00000492185 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.03■■■□□ 2.56
NELFE-211ENST00000492185 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.03■■■□□ 2.56
NELFE-211ENST00000492185 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
NELFE-211ENST00000492185 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.91■■■□□ 2.54
NELFE-211ENST00000492185 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
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NELFE-211ENST00000492185 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
NELFE-211ENST00000492185 IFT140Q96RY7 1462 aa30.86■■■□□ 2.53
NELFE-211ENST00000492185 ERCC6Q03468 1493 aa30.79■■■□□ 2.52
NELFE-211ENST00000492185 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.78■■■□□ 2.52
NELFE-211ENST00000492185 APLP2Q06481 763 aa30.75■■■□□ 2.51
NELFE-211ENST00000492185 ADAMTS12P58397 1594 aa30.74■■■□□ 2.51
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