RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491163.1

C7orf50-208, Transcript of chromosome 7 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene C7orf50, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf50-208ENST00000491163 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.81■■■□□ 2.52
C7orf50-208ENST00000491163 PTPRKQ15262 1439 aa30.78■■■□□ 2.52
C7orf50-208ENST00000491163 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.78■■■□□ 2.52
C7orf50-208ENST00000491163 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.78■■■□□ 2.52
C7orf50-208ENST00000491163 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.77■■■□□ 2.52
C7orf50-208ENST00000491163 HSPA2P54652 639 aa30.77■■■□□ 2.52
C7orf50-208ENST00000491163 NCOA1Q15788 1441 aa30.76■■■□□ 2.51
C7orf50-208ENST00000491163 ADGRL2O95490 1459 aa30.76■■■□□ 2.51
C7orf50-208ENST00000491163 ERBINQ96RT1 1412 aa30.74■■■□□ 2.51
C7orf50-208ENST00000491163 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.74■■■□□ 2.51
C7orf50-208ENST00000491163 ITGAEP38570 1179 aa30.72■■■□□ 2.51
C7orf50-208ENST00000491163 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.72■■■□□ 2.51
C7orf50-208ENST00000491163 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.7■■■□□ 2.5
C7orf50-208ENST00000491163 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
C7orf50-208ENST00000491163 ABCC3O15438 1527 aa30.69■■■□□ 2.5
C7orf50-208ENST00000491163 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.69■■■□□ 2.5
C7orf50-208ENST00000491163 CEP152O94986 1710 aa30.69■■■□□ 2.5
C7orf50-208ENST00000491163 NPATQ14207 1427 aa30.67■■■□□ 2.5
C7orf50-208ENST00000491163 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
C7orf50-208ENST00000491163 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
C7orf50-208ENST00000491163 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
C7orf50-208ENST00000491163 DEPDC5O75140 1603 aa30.64■■■□□ 2.5
C7orf50-208ENST00000491163 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.64■■■□□ 2.57e-7■■■■■ 45.1
C7orf50-208ENST00000491163 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.63■■■□□ 2.49
C7orf50-208ENST00000491163 PZPP20742 1482 aa30.63■■■□□ 2.49
C7orf50-208ENST00000491163 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
C7orf50-208ENST00000491163 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.62■■■□□ 2.491e-7■□□□□ 10.9
C7orf50-208ENST00000491163 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.6■■■□□ 2.49
C7orf50-208ENST00000491163 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.59■■■□□ 2.49
C7orf50-208ENST00000491163 ROCK1Q13464 1354 aa30.56■■■□□ 2.48
C7orf50-208ENST00000491163 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
C7orf50-208ENST00000491163 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
C7orf50-208ENST00000491163 TNRQ92752 1358 aa30.53■■■□□ 2.48
C7orf50-208ENST00000491163 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
C7orf50-208ENST00000491163 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.5■■■□□ 2.47
C7orf50-208ENST00000491163 STRCQ7RTU9 1775 aa30.49■■■□□ 2.47
C7orf50-208ENST00000491163 KANK1Q14678 1352 aa30.49■■■□□ 2.47
C7orf50-208ENST00000491163 ERVK-7P63135 1459 aa30.47■■■□□ 2.47
C7orf50-208ENST00000491163 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.46■■■□□ 2.47
C7orf50-208ENST00000491163 UNC13BO14795 1591 aa30.45■■■□□ 2.46
C7orf50-208ENST00000491163 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.44■■■□□ 2.46
C7orf50-208ENST00000491163 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.44■■■□□ 2.46
C7orf50-208ENST00000491163 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.4■■■□□ 2.46
C7orf50-208ENST00000491163 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.4■■■□□ 2.46
C7orf50-208ENST00000491163 NLRP1Q9C000 1473 aa30.36■■■□□ 2.45
C7orf50-208ENST00000491163 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.36■■■□□ 2.45
C7orf50-208ENST00000491163 TET3O43151 1660 aa30.33■■■□□ 2.45
C7orf50-208ENST00000491163 NAIPQ13075 1403 aa30.33■■■□□ 2.45
C7orf50-208ENST00000491163 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.32■■■□□ 2.44
C7orf50-208ENST00000491163 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.32■■■□□ 2.44
C7orf50-208ENST00000491163 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.31■■■□□ 2.44
C7orf50-208ENST00000491163 PLA2R1Q13018 1463 aa30.31■■■□□ 2.44
C7orf50-208ENST00000491163 SYNMO15061 1565 aa30.29■■■□□ 2.44
C7orf50-208ENST00000491163 NUP155O75694 1391 aa30.28■■■□□ 2.44
C7orf50-208ENST00000491163 HFM1A2PYH4 1435 aa30.27■■■□□ 2.44
C7orf50-208ENST00000491163 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.25■■■□□ 2.43
C7orf50-208ENST00000491163 E9PCH4 1651 aa30.25■■■□□ 2.43
C7orf50-208ENST00000491163 PIK3C2BO00750 1634 aa30.24■■■□□ 2.43
C7orf50-208ENST00000491163 NOS1P29475 1434 aa30.23■■■□□ 2.43
C7orf50-208ENST00000491163 PTPRTO14522 1441 aa30.22■■■□□ 2.43
C7orf50-208ENST00000491163 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
C7orf50-208ENST00000491163 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.22■■■□□ 2.43
C7orf50-208ENST00000491163 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
C7orf50-208ENST00000491163 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.2■■■□□ 2.42
C7orf50-208ENST00000491163 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
C7orf50-208ENST00000491163 PKD2Q13563 968 aa30.18■■■□□ 2.42
C7orf50-208ENST00000491163 IDI1Q13907 227 aa30.15■■■□□ 2.42
C7orf50-208ENST00000491163 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.1■■■□□ 2.41
C7orf50-208ENST00000491163 ADGRB3O60242 1522 aa30.1■■■□□ 2.41
C7orf50-208ENST00000491163 TRIM52Q96A61 297 aa30.09■■■□□ 2.41
C7orf50-208ENST00000491163 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.09■■■□□ 2.41
C7orf50-208ENST00000491163 SLIT1O75093 1534 aa30.06■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.06■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.06■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.05■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.05■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 IQGAP1P46940 1657 aa30.04■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.03■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 MED14O60244 1454 aa30.02■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 LTKP29376 864 aa30.02■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.02■■■□□ 2.4
C7orf50-208ENST00000491163 CERKQ8TCT0 537 aa30■■■□□ 2.39
C7orf50-208ENST00000491163 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30■■■□□ 2.39
C7orf50-208ENST00000491163 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.99■■■□□ 2.39
C7orf50-208ENST00000491163 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
C7orf50-208ENST00000491163 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
C7orf50-208ENST00000491163 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.96■■■□□ 2.39
C7orf50-208ENST00000491163 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
C7orf50-208ENST00000491163 EID1Q9Y6B2 187 aa29.93■■■□□ 2.38
C7orf50-208ENST00000491163 CLTCL1P53675 1640 aa29.93■■■□□ 2.38
C7orf50-208ENST00000491163 TRPM2O94759 1503 aa29.92■■■□□ 2.38
C7orf50-208ENST00000491163 FOXD1Q16676 465 aa29.91■■■□□ 2.38
C7orf50-208ENST00000491163 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
C7orf50-208ENST00000491163 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.9■■■□□ 2.38
C7orf50-208ENST00000491163 ZFYVE9O95405 1425 aa29.89■■■□□ 2.38
C7orf50-208ENST00000491163 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.88■■■□□ 2.37
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