RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482405.7

CD99-208, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), human

TSL 2

Gene CD99, Length 842 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CD99-208	ENST00000482405	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CD99-208	ENST00000482405	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CD99-208	ENST00000482405	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CD99-208	ENST00000482405	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
CD99-208	ENST00000482405	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
CD99-208	ENST00000482405	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CD99-208	ENST00000482405	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CD99-208	ENST00000482405	NPAT	Q14207	1427 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CD99-208	ENST00000482405	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CD99-208	ENST00000482405	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CD99-208	ENST00000482405	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
CD99-208	ENST00000482405	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.05	■■■□□ 2.72
CD99-208	ENST00000482405	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
CD99-208	ENST00000482405	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.04	■■■□□ 2.72
CD99-208	ENST00000482405	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.03	■■■□□ 2.72
CD99-208	ENST00000482405	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.01	■■■□□ 2.72
CD99-208	ENST00000482405	ROCK1	Q13464	1354 aa		31.98	■■■□□ 2.71
CD99-208	ENST00000482405	ABCC3	O15438	1527 aa		31.98	■■■□□ 2.71
CD99-208	ENST00000482405	HSPA2	P54652	639 aa		31.97	■■■□□ 2.71
CD99-208	ENST00000482405	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
CD99-208	ENST00000482405	PZP	P20742	1482 aa		31.96	■■■□□ 2.71
CD99-208	ENST00000482405	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.7
CD99-208	ENST00000482405	DEPDC5	O75140	1603 aa		31.94	■■■□□ 2.7
CD99-208	ENST00000482405	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		31.92	■■■□□ 2.7
CD99-208	ENST00000482405	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
CD99-208	ENST00000482405	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		31.85	■■■□□ 2.69
CD99-208	ENST00000482405	ITGAE	P38570	1179 aa		31.85	■■■□□ 2.69
CD99-208	ENST00000482405	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.84	■■■□□ 2.69
CD99-208	ENST00000482405	CEP152	O94986	1710 aa		31.83	■■■□□ 2.69
CD99-208	ENST00000482405	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		31.83	■■■□□ 2.69
CD99-208	ENST00000482405	KANK1	Q14678	1352 aa		31.82	■■■□□ 2.69
CD99-208	ENST00000482405	TNR	Q92752	1358 aa		31.82	■■■□□ 2.69
CD99-208	ENST00000482405	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		31.82	■■■□□ 2.68
CD99-208	ENST00000482405	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	31.82	■■■□□ 2.68
CD99-208	ENST00000482405	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.82	■■■□□ 2.68
CD99-208	ENST00000482405	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
CD99-208	ENST00000482405	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		31.79	■■■□□ 2.68
CD99-208	ENST00000482405	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
CD99-208	ENST00000482405	ERVK-7	P63135	1459 aa		31.77	■■■□□ 2.68
CD99-208	ENST00000482405	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.76	■■■□□ 2.67
CD99-208	ENST00000482405	NLRP1	Q9C000	1473 aa		31.72	■■■□□ 2.67
CD99-208	ENST00000482405	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.72	■■■□□ 2.67
CD99-208	ENST00000482405	UNC13B	O14795	1591 aa		31.72	■■■□□ 2.67
CD99-208	ENST00000482405	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.68	■■■□□ 2.66
CD99-208	ENST00000482405	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		31.67	■■■□□ 2.66
CD99-208	ENST00000482405	NAIP	Q13075	1403 aa		31.66	■■■□□ 2.66
CD99-208	ENST00000482405	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.64	■■■□□ 2.66
CD99-208	ENST00000482405	HFM1	A2PYH4	1435 aa		31.61	■■■□□ 2.65
CD99-208	ENST00000482405	PTPRT	O14522	1441 aa		31.61	■■■□□ 2.65
CD99-208	ENST00000482405	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
CD99-208	ENST00000482405	NOS1	P29475	1434 aa		31.6	■■■□□ 2.65
CD99-208	ENST00000482405	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		31.6	■■■□□ 2.65
CD99-208	ENST00000482405	TET3	O43151	1660 aa		31.59	■■■□□ 2.65
CD99-208	ENST00000482405	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		31.58	■■■□□ 2.65
CD99-208	ENST00000482405	PKD2	Q13563	968 aa		31.58	■■■□□ 2.65
CD99-208	ENST00000482405	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		31.57	■■■□□ 2.64
CD99-208	ENST00000482405	NUP155	O75694	1391 aa		31.56	■■■□□ 2.64
CD99-208	ENST00000482405	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
CD99-208	ENST00000482405	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
CD99-208	ENST00000482405	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.55	■■■□□ 2.64
CD99-208	ENST00000482405	SYNM	O15061	1565 aa		31.52	■■■□□ 2.64
CD99-208	ENST00000482405	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CD99-208	ENST00000482405	IDI1	Q13907	227 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CD99-208	ENST00000482405		E9PCH4	1651 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CD99-208	ENST00000482405	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CD99-208	ENST00000482405	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		31.44	■■■□□ 2.62
CD99-208	ENST00000482405	PIK3C2B	O00750	1634 aa		31.44	■■■□□ 2.62
CD99-208	ENST00000482405	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CD99-208	ENST00000482405	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		31.41	■■■□□ 2.62
CD99-208	ENST00000482405	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
CD99-208	ENST00000482405	MED14	O60244	1454 aa		31.4	■■■□□ 2.62
CD99-208	ENST00000482405	SLIT1	O75093	1534 aa		31.4	■■■□□ 2.62
CD99-208	ENST00000482405	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
CD99-208	ENST00000482405	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.35	■■■□□ 2.61
CD99-208	ENST00000482405	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		31.35	■■■□□ 2.61
CD99-208	ENST00000482405	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
CD99-208	ENST00000482405	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		31.33	■■■□□ 2.61
CD99-208	ENST00000482405	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.31	■■■□□ 2.6
CD99-208	ENST00000482405	LTK	P29376	864 aa		31.31	■■■□□ 2.6
CD99-208	ENST00000482405	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.31	■■■□□ 2.6
CD99-208	ENST00000482405	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
CD99-208	ENST00000482405	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.3	■■■□□ 2.6
CD99-208	ENST00000482405	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		31.28	■■■□□ 2.6
CD99-208	ENST00000482405	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		31.27	■■■□□ 2.6
CD99-208	ENST00000482405	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.6
CD99-208	ENST00000482405	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.25	■■■□□ 2.59
CD99-208	ENST00000482405	EID1	Q9Y6B2	187 aa		31.25	■■■□□ 2.59
CD99-208	ENST00000482405	IQGAP1	P46940	1657 aa		31.24	■■■□□ 2.59
CD99-208	ENST00000482405	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
CD99-208	ENST00000482405	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		31.23	■■■□□ 2.59
CD99-208	ENST00000482405	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
CD99-208	ENST00000482405	ZFYVE9	O95405	1425 aa		31.2	■■■□□ 2.59
CD99-208	ENST00000482405	TRPM2	O94759	1503 aa		31.19	■■■□□ 2.58
CD99-208	ENST00000482405	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
CD99-208	ENST00000482405	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CD99-208	ENST00000482405	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		31.16	■■■□□ 2.58
CD99-208	ENST00000482405	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CD99-208	ENST00000482405	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		31.14	■■■□□ 2.58
CD99-208	ENST00000482405	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
CD99-208	ENST00000482405	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		31.14	■■■□□ 2.58

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