RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477726.1

SIGMAR1-205, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-205ENST00000477726 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.59■■■■■ 4.25
SIGMAR1-205ENST00000477726 MROH2AA6NES4 1674 aa41.58■■■■■ 4.25
SIGMAR1-205ENST00000477726 ITGAEP38570 1179 aa41.54■■■■■ 4.24
SIGMAR1-205ENST00000477726 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
SIGMAR1-205ENST00000477726 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
SIGMAR1-205ENST00000477726 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
SIGMAR1-205ENST00000477726 ROCK1Q13464 1354 aa41.52■■■■■ 4.24
SIGMAR1-205ENST00000477726 ZMYM3Q14202 1370 aa41.51■■■■■ 4.24
SIGMAR1-205ENST00000477726 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.51■■■■■ 4.24
SIGMAR1-205ENST00000477726 C3P01024 1663 aa41.5■■■■■ 4.23
SIGMAR1-205ENST00000477726 PTPRKQ15262 1439 aa41.5■■■■■ 4.23
SIGMAR1-205ENST00000477726 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.49■■■■■ 4.23
SIGMAR1-205ENST00000477726 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
SIGMAR1-205ENST00000477726 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.42■■■■■ 4.22
SIGMAR1-205ENST00000477726 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
SIGMAR1-205ENST00000477726 KANK1Q14678 1352 aa41.38■■■■■ 4.22
SIGMAR1-205ENST00000477726 NPATQ14207 1427 aa41.38■■■■■ 4.22
SIGMAR1-205ENST00000477726 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
SIGMAR1-205ENST00000477726 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.34■■■■■ 4.21
SIGMAR1-205ENST00000477726 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.33■■■■■ 4.21
SIGMAR1-205ENST00000477726 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.33■■■■■ 4.21
SIGMAR1-205ENST00000477726 DEPDC5O75140 1603 aa41.33■■■■■ 4.21
SIGMAR1-205ENST00000477726 ABCC3O15438 1527 aa41.32■■■■■ 4.2
SIGMAR1-205ENST00000477726 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.31■■■■■ 4.2
SIGMAR1-205ENST00000477726 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.29■■■■■ 4.2
SIGMAR1-205ENST00000477726 PZPP20742 1482 aa41.28■■■■■ 4.2
SIGMAR1-205ENST00000477726 CEP152O94986 1710 aa41.21■■■■■ 4.19
SIGMAR1-205ENST00000477726 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.18■■■■■ 4.18
SIGMAR1-205ENST00000477726 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.15■■■■■ 4.18
SIGMAR1-205ENST00000477726 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.14■■■■■ 4.18
SIGMAR1-205ENST00000477726 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.14■■■■■ 4.18
SIGMAR1-205ENST00000477726 TNRQ92752 1358 aa41.13■■■■■ 4.18
SIGMAR1-205ENST00000477726 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
SIGMAR1-205ENST00000477726 UNC13BO14795 1591 aa41.12■■■■■ 4.17
SIGMAR1-205ENST00000477726 HSPA2P54652 639 aa41.09■■■■■ 4.17
SIGMAR1-205ENST00000477726 NAIPQ13075 1403 aa41.09■■■■■ 4.17
SIGMAR1-205ENST00000477726 HFM1A2PYH4 1435 aa41.08■■■■■ 4.17
SIGMAR1-205ENST00000477726 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.07■■■■■ 4.17
SIGMAR1-205ENST00000477726 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.07■■■■■ 4.17
SIGMAR1-205ENST00000477726 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.03■■■■■ 4.16
SIGMAR1-205ENST00000477726 ERVK-7P63135 1459 aa41.03■■■■■ 4.16
SIGMAR1-205ENST00000477726 NUP155O75694 1391 aa41.01■■■■■ 4.16
SIGMAR1-205ENST00000477726 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.15
SIGMAR1-205ENST00000477726 NLRP1Q9C000 1473 aa41■■■■■ 4.15
SIGMAR1-205ENST00000477726 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
SIGMAR1-205ENST00000477726 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.99■■■■■ 4.15
SIGMAR1-205ENST00000477726 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.99■■■■■ 4.15
SIGMAR1-205ENST00000477726 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
SIGMAR1-205ENST00000477726 TET3O43151 1660 aa40.97■■■■■ 4.15
SIGMAR1-205ENST00000477726 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.96■■■■■ 4.15
SIGMAR1-205ENST00000477726 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
SIGMAR1-205ENST00000477726 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.86■■■■■ 4.13
SIGMAR1-205ENST00000477726 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
SIGMAR1-205ENST00000477726 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
SIGMAR1-205ENST00000477726 TRIM52Q96A61 297 aa40.84■■■■■ 4.13
SIGMAR1-205ENST00000477726 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.82■■■■■ 4.13
SIGMAR1-205ENST00000477726 PLA2R1Q13018 1463 aa40.82■■■■■ 4.12
SIGMAR1-205ENST00000477726 NOS1P29475 1434 aa40.81■■■■■ 4.12
SIGMAR1-205ENST00000477726 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.78■■■■■ 4.12
SIGMAR1-205ENST00000477726 PKD2Q13563 968 aa40.77■■■■■ 4.12
SIGMAR1-205ENST00000477726 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.76■■■■■ 4.11
SIGMAR1-205ENST00000477726 E9PCH4 1651 aa40.75■■■■■ 4.11
SIGMAR1-205ENST00000477726 STRCQ7RTU9 1775 aa40.75■■■■■ 4.11
SIGMAR1-205ENST00000477726 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.73■■■■■ 4.11
SIGMAR1-205ENST00000477726 SYNMO15061 1565 aa40.71■■■■■ 4.11
SIGMAR1-205ENST00000477726 IDI1Q13907 227 aa40.69■■■■■ 4.1
SIGMAR1-205ENST00000477726 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.67■■■■■ 4.1
SIGMAR1-205ENST00000477726 PTPRTO14522 1441 aa40.67■■■■■ 4.1
SIGMAR1-205ENST00000477726 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
SIGMAR1-205ENST00000477726 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.66■■■■■ 4.1
SIGMAR1-205ENST00000477726 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.65■■■■■ 4.1
SIGMAR1-205ENST00000477726 PIK3C2BO00750 1634 aa40.64■■■■■ 4.1
SIGMAR1-205ENST00000477726 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
SIGMAR1-205ENST00000477726 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.57■■■■■ 4.08
SIGMAR1-205ENST00000477726 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
SIGMAR1-205ENST00000477726 ADGRB3O60242 1522 aa40.55■■■■■ 4.08
SIGMAR1-205ENST00000477726 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.55■■■■■ 4.08
SIGMAR1-205ENST00000477726 EID1Q9Y6B2 187 aa40.54■■■■■ 4.08
SIGMAR1-205ENST00000477726 SLIT1O75093 1534 aa40.52■■■■■ 4.08
SIGMAR1-205ENST00000477726 HRCP23327 699 aa40.51■■■■■ 4.08
SIGMAR1-205ENST00000477726 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.49■■■■■ 4.07
SIGMAR1-205ENST00000477726 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.49■■■■■ 4.07
SIGMAR1-205ENST00000477726 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.49■■■■■ 4.07
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SIGMAR1-205ENST00000477726 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.46■■■■■ 4.07
SIGMAR1-205ENST00000477726 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
SIGMAR1-205ENST00000477726 MED14O60244 1454 aa40.45■■■■■ 4.07
SIGMAR1-205ENST00000477726 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
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SIGMAR1-205ENST00000477726 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.43■■■■■ 4.06
SIGMAR1-205ENST00000477726 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
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SIGMAR1-205ENST00000477726 LTKP29376 864 aa40.37■■■■■ 4.05
SIGMAR1-205ENST00000477726 IQGAP1P46940 1657 aa40.35■■■■■ 4.05
SIGMAR1-205ENST00000477726 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.34■■■■■ 4.05
SIGMAR1-205ENST00000477726 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.33■■■■■ 4.05
SIGMAR1-205ENST00000477726 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
SIGMAR1-205ENST00000477726 FOXD1Q16676 465 aa40.31■■■■■ 4.04
SIGMAR1-205ENST00000477726 CLTCL1P53675 1640 aa40.31■■■■■ 4.04
SIGMAR1-205ENST00000477726 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
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