RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476842.1

SMIM4-202, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMIM4, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-202ENST00000476842 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
SMIM4-202ENST00000476842 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.02■■□□□ 1.92
SMIM4-202ENST00000476842 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.01■■□□□ 1.91
SMIM4-202ENST00000476842 ZMYM3Q14202 1370 aa26.99■■□□□ 1.91
SMIM4-202ENST00000476842 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.99■■□□□ 1.91
SMIM4-202ENST00000476842 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
SMIM4-202ENST00000476842 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.98■■□□□ 1.91
SMIM4-202ENST00000476842 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SMIM4-202ENST00000476842 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.93■■□□□ 1.9
SMIM4-202ENST00000476842 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
SMIM4-202ENST00000476842 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.9■■□□□ 1.9
SMIM4-202ENST00000476842 MROH2AA6NES4 1674 aa26.88■■□□□ 1.89
SMIM4-202ENST00000476842 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SMIM4-202ENST00000476842 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.87■■□□□ 1.89
SMIM4-202ENST00000476842 KANK1Q14678 1352 aa26.87■■□□□ 1.89
SMIM4-202ENST00000476842 C3P01024 1663 aa26.85■■□□□ 1.89
SMIM4-202ENST00000476842 NPATQ14207 1427 aa26.84■■□□□ 1.89
SMIM4-202ENST00000476842 ABCC3O15438 1527 aa26.84■■□□□ 1.89
SMIM4-202ENST00000476842 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SMIM4-202ENST00000476842 DEPDC5O75140 1603 aa26.83■■□□□ 1.88
SMIM4-202ENST00000476842 NAIPQ13075 1403 aa26.82■■□□□ 1.88
SMIM4-202ENST00000476842 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
SMIM4-202ENST00000476842 HFM1A2PYH4 1435 aa26.8■■□□□ 1.88
SMIM4-202ENST00000476842 PZPP20742 1482 aa26.79■■□□□ 1.88
SMIM4-202ENST00000476842 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.78■■□□□ 1.88
SMIM4-202ENST00000476842 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SMIM4-202ENST00000476842 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.76■■□□□ 1.87
SMIM4-202ENST00000476842 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.76■■□□□ 1.87
SMIM4-202ENST00000476842 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.74■■□□□ 1.87
SMIM4-202ENST00000476842 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SMIM4-202ENST00000476842 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.73■■□□□ 1.87
SMIM4-202ENST00000476842 NUP155O75694 1391 aa26.73■■□□□ 1.87
SMIM4-202ENST00000476842 TNRQ92752 1358 aa26.71■■□□□ 1.87
SMIM4-202ENST00000476842 UNC13BO14795 1591 aa26.7■■□□□ 1.86
SMIM4-202ENST00000476842 CEP152O94986 1710 aa26.69■■□□□ 1.86
SMIM4-202ENST00000476842 HSPA2P54652 639 aa26.68■■□□□ 1.86
SMIM4-202ENST00000476842 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.68■■□□□ 1.86
SMIM4-202ENST00000476842 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.66■■□□□ 1.86
SMIM4-202ENST00000476842 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.66■■□□□ 1.86
SMIM4-202ENST00000476842 ERVK-7P63135 1459 aa26.65■■□□□ 1.86
SMIM4-202ENST00000476842 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.63■■□□□ 1.85
SMIM4-202ENST00000476842 TRIM52Q96A61 297 aa26.63■■□□□ 1.85
SMIM4-202ENST00000476842 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.63■■□□□ 1.85
SMIM4-202ENST00000476842 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.61■■□□□ 1.85
SMIM4-202ENST00000476842 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SMIM4-202ENST00000476842 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.6■■□□□ 1.85
SMIM4-202ENST00000476842 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SMIM4-202ENST00000476842 NLRP1Q9C000 1473 aa26.59■■□□□ 1.85
SMIM4-202ENST00000476842 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.58■■□□□ 1.85
SMIM4-202ENST00000476842 NOS1P29475 1434 aa26.57■■□□□ 1.84
SMIM4-202ENST00000476842 TET3O43151 1660 aa26.57■■□□□ 1.84
SMIM4-202ENST00000476842 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.56■■□□□ 1.84
SMIM4-202ENST00000476842 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SMIM4-202ENST00000476842 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SMIM4-202ENST00000476842 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.54■■□□□ 1.84
SMIM4-202ENST00000476842 IDI1Q13907 227 aa26.53■■□□□ 1.84
SMIM4-202ENST00000476842 HRCP23327 699 aa26.52■■□□□ 1.84
SMIM4-202ENST00000476842 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SMIM4-202ENST00000476842 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.51■■□□□ 1.83
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SMIM4-202ENST00000476842 PKD2Q13563 968 aa26.49■■□□□ 1.83
SMIM4-202ENST00000476842 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SMIM4-202ENST00000476842 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.47■■□□□ 1.83
SMIM4-202ENST00000476842 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.46■■□□□ 1.83
SMIM4-202ENST00000476842 E9PCH4 1651 aa26.46■■□□□ 1.83
SMIM4-202ENST00000476842 SYNMO15061 1565 aa26.46■■□□□ 1.83
SMIM4-202ENST00000476842 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SMIM4-202ENST00000476842 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.45■■□□□ 1.82
SMIM4-202ENST00000476842 PLA2R1Q13018 1463 aa26.44■■□□□ 1.82
SMIM4-202ENST00000476842 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.44■■□□□ 1.82
SMIM4-202ENST00000476842 PTPRTO14522 1441 aa26.44■■□□□ 1.82
SMIM4-202ENST00000476842 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.42■■□□□ 1.82
SMIM4-202ENST00000476842 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.41■■□□□ 1.82
SMIM4-202ENST00000476842 STRCQ7RTU9 1775 aa26.36■■□□□ 1.81
SMIM4-202ENST00000476842 PIK3C2BO00750 1634 aa26.36■■□□□ 1.81
SMIM4-202ENST00000476842 FOXD1Q16676 465 aa26.35■■□□□ 1.81
SMIM4-202ENST00000476842 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.34■■□□□ 1.81
SMIM4-202ENST00000476842 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.33■■□□□ 1.8
SMIM4-202ENST00000476842 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.32■■□□□ 1.8
SMIM4-202ENST00000476842 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SMIM4-202ENST00000476842 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.32■■□□□ 1.8
SMIM4-202ENST00000476842 EID1Q9Y6B2 187 aa26.31■■□□□ 1.8
SMIM4-202ENST00000476842 ADGRB3O60242 1522 aa26.3■■□□□ 1.8
SMIM4-202ENST00000476842 SLIT1O75093 1534 aa26.3■■□□□ 1.8
SMIM4-202ENST00000476842 LTKP29376 864 aa26.3■■□□□ 1.8
SMIM4-202ENST00000476842 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SMIM4-202ENST00000476842 TRPM2O94759 1503 aa26.29■■□□□ 1.8
SMIM4-202ENST00000476842 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.28■■□□□ 1.8
SMIM4-202ENST00000476842 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SMIM4-202ENST00000476842 MED14O60244 1454 aa26.26■■□□□ 1.79
SMIM4-202ENST00000476842 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.25■■□□□ 1.79
SMIM4-202ENST00000476842 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SMIM4-202ENST00000476842 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
SMIM4-202ENST00000476842 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
SMIM4-202ENST00000476842 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.21■■□□□ 1.79
SMIM4-202ENST00000476842 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.21■■□□□ 1.79
SMIM4-202ENST00000476842 ZFYVE9O95405 1425 aa26.2■■□□□ 1.78
SMIM4-202ENST00000476842 CLTCL1P53675 1640 aa26.19■■□□□ 1.78
SMIM4-202ENST00000476842 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.18■■□□□ 1.78
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
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