RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
ATG4B-216ENST00000475195 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-216ENST00000475195 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-216ENST00000475195 ADGRL2O95490 1459 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-216ENST00000475195 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-216ENST00000475195 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
ATG4B-216ENST00000475195 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-216ENST00000475195 ERBINQ96RT1 1412 aa25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-216ENST00000475195 NPATQ14207 1427 aa25.28■■□□□ 1.64
ATG4B-216ENST00000475195 PTPRKQ15262 1439 aa25.28■■□□□ 1.64
ATG4B-216ENST00000475195 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.27■■□□□ 1.64
ATG4B-216ENST00000475195 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ATG4B-216ENST00000475195 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.25■■□□□ 1.63
ATG4B-216ENST00000475195 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.25■■□□□ 1.63
ATG4B-216ENST00000475195 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.23■■□□□ 1.63
ATG4B-216ENST00000475195 ROCK1Q13464 1354 aa25.21■■□□□ 1.63
ATG4B-216ENST00000475195 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.2■■□□□ 1.62
ATG4B-216ENST00000475195 HSPA2P54652 639 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-216ENST00000475195 DEPDC5O75140 1603 aa25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-216ENST00000475195 ABCC3O15438 1527 aa25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-216ENST00000475195 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-216ENST00000475195 PZPP20742 1482 aa25.16■■□□□ 1.62
ATG4B-216ENST00000475195 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ATG4B-216ENST00000475195 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.15■■□□□ 1.62
ATG4B-216ENST00000475195 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
ATG4B-216ENST00000475195 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.1■■□□□ 1.61
ATG4B-216ENST00000475195 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.1■■□□□ 1.61
ATG4B-216ENST00000475195 ITGAEP38570 1179 aa25.09■■□□□ 1.61
ATG4B-216ENST00000475195 KANK1Q14678 1352 aa25.08■■□□□ 1.61
ATG4B-216ENST00000475195 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.611e-13■□□□□ 11.2
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ATG4B-216ENST00000475195 CEP152O94986 1710 aa25.07■■□□□ 1.6
ATG4B-216ENST00000475195 TNRQ92752 1358 aa25.05■■□□□ 1.6
ATG4B-216ENST00000475195 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.05■■□□□ 1.6
ATG4B-216ENST00000475195 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.04■■□□□ 1.6
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ATG4B-216ENST00000475195 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.03■■□□□ 1.6
ATG4B-216ENST00000475195 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.02■■□□□ 1.6
ATG4B-216ENST00000475195 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ATG4B-216ENST00000475195 STRCQ7RTU9 1775 aa25.01■■□□□ 1.59
ATG4B-216ENST00000475195 ERVK-7P63135 1459 aa25■■□□□ 1.59
ATG4B-216ENST00000475195 NLRP1Q9C000 1473 aa24.99■■□□□ 1.59
ATG4B-216ENST00000475195 UNC13BO14795 1591 aa24.98■■□□□ 1.59
ATG4B-216ENST00000475195 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.98■■□□□ 1.59
ATG4B-216ENST00000475195 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
ATG4B-216ENST00000475195 NAIPQ13075 1403 aa24.95■■□□□ 1.59
ATG4B-216ENST00000475195 PLA2R1Q13018 1463 aa24.95■■□□□ 1.58
ATG4B-216ENST00000475195 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.92■■□□□ 1.58
ATG4B-216ENST00000475195 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
ATG4B-216ENST00000475195 PTPRTO14522 1441 aa24.92■■□□□ 1.58
ATG4B-216ENST00000475195 HFM1A2PYH4 1435 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG4B-216ENST00000475195 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
ATG4B-216ENST00000475195 NOS1P29475 1434 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4B-216ENST00000475195 PKD2Q13563 968 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4B-216ENST00000475195 TET3O43151 1660 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4B-216ENST00000475195 NUP155O75694 1391 aa24.89■■□□□ 1.57
ATG4B-216ENST00000475195 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4B-216ENST00000475195 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4B-216ENST00000475195 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.87■■□□□ 1.57
ATG4B-216ENST00000475195 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-216ENST00000475195 IDI1Q13907 227 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4B-216ENST00000475195 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4B-216ENST00000475195 SYNMO15061 1565 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-216ENST00000475195 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-216ENST00000475195 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-216ENST00000475195 E9PCH4 1651 aa24.8■■□□□ 1.56
ATG4B-216ENST00000475195 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ATG4B-216ENST00000475195 PIK3C2BO00750 1634 aa24.76■■□□□ 1.55
ATG4B-216ENST00000475195 MED14O60244 1454 aa24.76■■□□□ 1.55
ATG4B-216ENST00000475195 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-216ENST00000475195 SLIT1O75093 1534 aa24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-216ENST00000475195 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.74■■□□□ 1.55
ATG4B-216ENST00000475195 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.7■■□□□ 1.55
ATG4B-216ENST00000475195 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.7■■□□□ 1.54
ATG4B-216ENST00000475195 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-216ENST00000475195 LTKP29376 864 aa24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-216ENST00000475195 TRIM52Q96A61 297 aa24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-216ENST00000475195 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.67■■□□□ 1.54
ATG4B-216ENST00000475195 CERKQ8TCT0 537 aa24.67■■□□□ 1.54
ATG4B-216ENST00000475195 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.67■■□□□ 1.54
ATG4B-216ENST00000475195 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
ATG4B-216ENST00000475195 ADGRB3O60242 1522 aa24.66■■□□□ 1.54
ATG4B-216ENST00000475195 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.66■■□□□ 1.54
ATG4B-216ENST00000475195 EID1Q9Y6B2 187 aa24.65■■□□□ 1.54
ATG4B-216ENST00000475195 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.64■■□□□ 1.53
ATG4B-216ENST00000475195 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
ATG4B-216ENST00000475195 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.61■■□□□ 1.53
ATG4B-216ENST00000475195 IQGAP1P46940 1657 aa24.6■■□□□ 1.53
ATG4B-216ENST00000475195 HRCP23327 699 aa24.58■■□□□ 1.53
ATG4B-216ENST00000475195 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
ATG4B-216ENST00000475195 FBXO41Q8TF61 875 aa24.58■■□□□ 1.53
ATG4B-216ENST00000475195 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.58■■□□□ 1.53
ATG4B-216ENST00000475195 ZFYVE9O95405 1425 aa24.58■■□□□ 1.53
ATG4B-216ENST00000475195 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.57■■□□□ 1.52
ATG4B-216ENST00000475195 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
ATG4B-216ENST00000475195 TRPM2O94759 1503 aa24.56■■□□□ 1.52
ATG4B-216ENST00000475195 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.54■■□□□ 1.52
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