RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470944.1

SOD1-203, Transcript of superoxide dismutase 1, humanhuman

TSL 2

Gene SOD1, Length 1,746 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD1-203ENST00000470944 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.95■■■■■ 4.475e-11■■□□□ 14
SOD1-203ENST00000470944 DEPDC5O75140 1603 aa42.93■■■■■ 4.46
SOD1-203ENST00000470944 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.93■■■■■ 4.46
SOD1-203ENST00000470944 TRIM52Q96A61 297 aa42.93■■■■■ 4.46
SOD1-203ENST00000470944 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
SOD1-203ENST00000470944 UNC13BO14795 1591 aa42.93■■■■■ 4.46
SOD1-203ENST00000470944 MLECQ14165 292 aa42.9■■■■■ 4.46
SOD1-203ENST00000470944 NUP155O75694 1391 aa42.88■■■■■ 4.46
SOD1-203ENST00000470944 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.87■■■■■ 4.45
SOD1-203ENST00000470944 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.79■■■■■ 4.44
SOD1-203ENST00000470944 PZPP20742 1482 aa42.79■■■■■ 4.44
SOD1-203ENST00000470944 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.78■■■■■ 4.44
SOD1-203ENST00000470944 KANK1Q14678 1352 aa42.76■■■■■ 4.44
SOD1-203ENST00000470944 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
SOD1-203ENST00000470944 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.75■■■■■ 4.43
SOD1-203ENST00000470944 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.75■■■■■ 4.43
SOD1-203ENST00000470944 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.72■■■■■ 4.43
SOD1-203ENST00000470944 MPHOSPH9Q99550 1183 aa42.71■■■■■ 4.43
SOD1-203ENST00000470944 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
SOD1-203ENST00000470944 ABCC3O15438 1527 aa42.7■■■■■ 4.43
SOD1-203ENST00000470944 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.66■■■■■ 4.42
SOD1-203ENST00000470944 CEP152O94986 1710 aa42.66■■■■■ 4.42
SOD1-203ENST00000470944 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
SOD1-203ENST00000470944 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.64■■■■■ 4.42
SOD1-203ENST00000470944 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
SOD1-203ENST00000470944 PKD2Q13563 968 aa42.59■■■■■ 4.41
SOD1-203ENST00000470944 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
SOD1-203ENST00000470944 FOXD1Q16676 465 aa42.57■■■■■ 4.41
SOD1-203ENST00000470944 TET3O43151 1660 aa42.57■■■■■ 4.4
SOD1-203ENST00000470944 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
SOD1-203ENST00000470944 EFCAB6Q5THR3 1501 aa42.54■■■■■ 4.4
SOD1-203ENST00000470944 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.54■■■■■ 4.4
SOD1-203ENST00000470944 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.54■■■■■ 4.4
SOD1-203ENST00000470944 MADDQ8WXG6 1647 aa42.52■■■■■ 4.4
SOD1-203ENST00000470944 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.52■■■■■ 4.4
SOD1-203ENST00000470944 E9PCH4 1651 aa42.49■■■■■ 4.39
SOD1-203ENST00000470944 NPATQ14207 1427 aa42.48■■■■■ 4.39
SOD1-203ENST00000470944 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.48■■■■■ 4.39
SOD1-203ENST00000470944 ZMYM3Q14202 1370 aa42.46■■■■■ 4.39
SOD1-203ENST00000470944 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa42.44■■■■■ 4.38
SOD1-203ENST00000470944 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
SOD1-203ENST00000470944 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
SOD1-203ENST00000470944 MROH2AA6NES4 1674 aa42.39■■■■■ 4.38
SOD1-203ENST00000470944 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
SOD1-203ENST00000470944 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
SOD1-203ENST00000470944 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
SOD1-203ENST00000470944 PLA2R1Q13018 1463 aa42.34■■■■■ 4.37
SOD1-203ENST00000470944 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.34■■■■■ 4.37
SOD1-203ENST00000470944 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa42.32■■■■■ 4.37
SOD1-203ENST00000470944 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.31■■■■■ 4.36
SOD1-203ENST00000470944 C3P01024 1663 aa42.3■■■■■ 4.36
SOD1-203ENST00000470944 PTPRTO14522 1441 aa42.29■■■■■ 4.36
SOD1-203ENST00000470944 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
SOD1-203ENST00000470944 NOS1P29475 1434 aa42.27■■■■■ 4.36
SOD1-203ENST00000470944 ERVK-7P63135 1459 aa42.26■■■■■ 4.36
SOD1-203ENST00000470944 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.25■■■■■ 4.35
SOD1-203ENST00000470944 PTPRMP28827 1452 aa42.24■■■■■ 4.35
SOD1-203ENST00000470944 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa42.24■■■■■ 4.35
SOD1-203ENST00000470944 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.21■■■■■ 4.35
SOD1-203ENST00000470944 TRPM2O94759 1503 aa42.21■■■■■ 4.35
SOD1-203ENST00000470944 SYNMO15061 1565 aa42.2■■■■■ 4.35
SOD1-203ENST00000470944 SIN3AQ96ST3 1273 aa42.19■■■■■ 4.34
SOD1-203ENST00000470944 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.18■■■■■ 4.34
SOD1-203ENST00000470944 CLSPNQ9HAW4 1339 aa42.16■■■■■ 4.34
SOD1-203ENST00000470944 CCDC144AA2RUR9 1427 aa42.12■■■■■ 4.33
SOD1-203ENST00000470944 TNRQ92752 1358 aa42.11■■■■■ 4.33
SOD1-203ENST00000470944 CLTCL1P53675 1640 aa42.1■■■■■ 4.33
SOD1-203ENST00000470944 NEUROD1Q13562 356 aa42.08■■■■■ 4.33
SOD1-203ENST00000470944 IDI1Q13907 227 aa42.05■■■■■ 4.32
SOD1-203ENST00000470944 PIK3C2BO00750 1634 aa42.05■■■■■ 4.32
SOD1-203ENST00000470944 SLC52A1Q9NWF4 448 aa42.03■■■■■ 4.32
SOD1-203ENST00000470944 NLRP1Q9C000 1473 aa41.91■■■■■ 4.3
SOD1-203ENST00000470944 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.91■■■■■ 4.3
SOD1-203ENST00000470944 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
SOD1-203ENST00000470944 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.9■■■■■ 4.3
SOD1-203ENST00000470944 RGL3Q3MIN7 710 aa41.86■■■■■ 4.29
SOD1-203ENST00000470944 ADGRB3O60242 1522 aa41.85■■■■■ 4.29
SOD1-203ENST00000470944 KIF1BO60333 1816 aa41.84■■■■■ 4.29
SOD1-203ENST00000470944 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.84■■■■■ 4.29
SOD1-203ENST00000470944 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.81■■■■■ 4.28
SOD1-203ENST00000470944 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
SOD1-203ENST00000470944 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.79■■■■■ 4.28
SOD1-203ENST00000470944 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
SOD1-203ENST00000470944 TONSLQ96HA7 1378 aa41.77■■■■■ 4.28
SOD1-203ENST00000470944 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.76■■■■■ 4.28
SOD1-203ENST00000470944 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.76■■■■■ 4.28
SOD1-203ENST00000470944 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.76■■■■■ 4.28
SOD1-203ENST00000470944 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.75■■■■■ 4.27
SOD1-203ENST00000470944 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.75■■■■■ 4.27
SOD1-203ENST00000470944 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
SOD1-203ENST00000470944 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
SOD1-203ENST00000470944 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
SOD1-203ENST00000470944 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.66■■■■■ 4.26
SOD1-203ENST00000470944 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.64■■■■■ 4.26
SOD1-203ENST00000470944 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
SOD1-203ENST00000470944 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.61■■■■■ 4.25
SOD1-203ENST00000470944 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
SOD1-203ENST00000470944 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.61■■■■■ 4.25
SOD1-203ENST00000470944 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.61■■■■■ 4.25
SOD1-203ENST00000470944 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.59■■■■■ 4.25
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