RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 KIF15Q9NS87 1388 aa36.98■■■■□ 3.51
SMKR1-201ENST00000462322 NPATQ14207 1427 aa36.98■■■■□ 3.51
SMKR1-201ENST00000462322 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.98■■■■□ 3.51
SMKR1-201ENST00000462322 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.97■■■■□ 3.51
SMKR1-201ENST00000462322 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.97■■■■□ 3.51
SMKR1-201ENST00000462322 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.94■■■■□ 3.5
SMKR1-201ENST00000462322 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
SMKR1-201ENST00000462322 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.93■■■■□ 3.5
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRKQ15262 1439 aa36.92■■■■□ 3.5
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.91■■■■□ 3.5
SMKR1-201ENST00000462322 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
SMKR1-201ENST00000462322 ERBINQ96RT1 1412 aa36.85■■■■□ 3.49
SMKR1-201ENST00000462322 NCOA1Q15788 1441 aa36.84■■■■□ 3.49
SMKR1-201ENST00000462322 PZPP20742 1482 aa36.8■■■■□ 3.48
SMKR1-201ENST00000462322 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.79■■■■□ 3.48
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRL2O95490 1459 aa36.79■■■■□ 3.48
SMKR1-201ENST00000462322 ABCC3O15438 1527 aa36.78■■■■□ 3.48
SMKR1-201ENST00000462322 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.76■■■■□ 3.48
SMKR1-201ENST00000462322 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.47
SMKR1-201ENST00000462322 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.73■■■■□ 3.47
SMKR1-201ENST00000462322 TNRQ92752 1358 aa36.73■■■■□ 3.47
SMKR1-201ENST00000462322 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
SMKR1-201ENST00000462322 STRCQ7RTU9 1775 aa36.7■■■■□ 3.47
SMKR1-201ENST00000462322 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
SMKR1-201ENST00000462322 CEP152O94986 1710 aa36.68■■■■□ 3.46
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
SMKR1-201ENST00000462322 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.68■■■■□ 3.46
SMKR1-201ENST00000462322 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.67■■■■□ 3.46
SMKR1-201ENST00000462322 ITGAEP38570 1179 aa36.67■■■■□ 3.46
SMKR1-201ENST00000462322 KANK1Q14678 1352 aa36.66■■■■□ 3.46
SMKR1-201ENST00000462322 DEPDC5O75140 1603 aa36.66■■■■□ 3.46
SMKR1-201ENST00000462322 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.65■■■■□ 3.46
SMKR1-201ENST00000462322 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.64■■■■□ 3.46
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.64■■■■□ 3.46
SMKR1-201ENST00000462322 ROCK1Q13464 1354 aa36.6■■■■□ 3.45
SMKR1-201ENST00000462322 ERVK-7P63135 1459 aa36.56■■■■□ 3.44
SMKR1-201ENST00000462322 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.56■■■■□ 3.44
SMKR1-201ENST00000462322 NLRP1Q9C000 1473 aa36.56■■■■□ 3.44
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRTO14522 1441 aa36.55■■■■□ 3.44
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.54■■■■□ 3.44
SMKR1-201ENST00000462322 PLA2R1Q13018 1463 aa36.54■■■■□ 3.44
SMKR1-201ENST00000462322 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.54■■■■□ 3.44
SMKR1-201ENST00000462322 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
SMKR1-201ENST00000462322 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.52■■■■□ 3.44
SMKR1-201ENST00000462322 PKD2Q13563 968 aa36.5■■■■□ 3.43
SMKR1-201ENST00000462322 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.49■■■■□ 3.43
SMKR1-201ENST00000462322 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
SMKR1-201ENST00000462322 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.45■■■■□ 3.43
SMKR1-201ENST00000462322 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
SMKR1-201ENST00000462322 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.39■■■■□ 3.42
SMKR1-201ENST00000462322 UNC13BO14795 1591 aa36.38■■■■□ 3.41
SMKR1-201ENST00000462322 CERKQ8TCT0 537 aa36.36■■■■□ 3.41
SMKR1-201ENST00000462322 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.35■■■■□ 3.41
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO41Q8TF61 875 aa36.31■■■■□ 3.4
SMKR1-201ENST00000462322 TET3O43151 1660 aa36.3■■■■□ 3.4
SMKR1-201ENST00000462322 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
SMKR1-201ENST00000462322 NUP155O75694 1391 aa36.28■■■■□ 3.4
SMKR1-201ENST00000462322 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
SMKR1-201ENST00000462322 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.28■■■■□ 3.4
SMKR1-201ENST00000462322 NOS1P29475 1434 aa36.27■■■■□ 3.4
SMKR1-201ENST00000462322 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.25■■■■□ 3.39
SMKR1-201ENST00000462322 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.25■■■■□ 3.39
SMKR1-201ENST00000462322 SYNMO15061 1565 aa36.24■■■■□ 3.39
SMKR1-201ENST00000462322 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.24■■■■□ 3.39
SMKR1-201ENST00000462322 IDI1Q13907 227 aa36.24■■■■□ 3.39
SMKR1-201ENST00000462322 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.23■■■■□ 3.39
SMKR1-201ENST00000462322 PIK3C2BO00750 1634 aa36.23■■■■□ 3.39
SMKR1-201ENST00000462322 NAIPQ13075 1403 aa36.22■■■■□ 3.39
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
SMKR1-201ENST00000462322 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.2■■■■□ 3.39
SMKR1-201ENST00000462322 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.19■■■■□ 3.38
SMKR1-201ENST00000462322 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
SMKR1-201ENST00000462322 MED14O60244 1454 aa36.18■■■■□ 3.38
SMKR1-201ENST00000462322 E9PCH4 1651 aa36.15■■■■□ 3.38
SMKR1-201ENST00000462322 HFM1A2PYH4 1435 aa36.14■■■■□ 3.38
SMKR1-201ENST00000462322 SLIT1O75093 1534 aa36.13■■■■□ 3.38
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.13■■■■□ 3.37
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SMKR1-201ENST00000462322 EID1Q9Y6B2 187 aa36.12■■■■□ 3.37
SMKR1-201ENST00000462322 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
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SMKR1-201ENST00000462322 LTKP29376 864 aa36.1■■■■□ 3.37
SMKR1-201ENST00000462322 IQGAP1P46940 1657 aa36.1■■■■□ 3.37
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRB3O60242 1522 aa36.08■■■■□ 3.37
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SMKR1-201ENST00000462322 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36■■■■□ 3.35
SMKR1-201ENST00000462322 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
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SMKR1-201ENST00000462322 CPS1P31327 1500 aa35.93■■■■□ 3.34
SMKR1-201ENST00000462322 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.92■■■■□ 3.34
SMKR1-201ENST00000462322 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.9■■■■□ 3.34
SMKR1-201ENST00000462322 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
SMKR1-201ENST00000462322 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
SMKR1-201ENST00000462322 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.88■■■■□ 3.33
SMKR1-201ENST00000462322 ZFYVE9O95405 1425 aa35.86■■■■□ 3.33
SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
SMKR1-201ENST00000462322 BCANQ96GW7 911 aa35.85■■■■□ 3.33
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