RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KDM5CP41229 1560 aa24.57■■□□□ 1.52
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.55■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.55■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATP10AO60312 1499 aa24.54■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KANK1Q14678 1352 aa24.53■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.52■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.52■■□□□ 1.52
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 TET3O43151 1660 aa24.51■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.5■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLA2R1Q13018 1463 aa24.49■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-201ENST00000456943 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.48■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-201ENST00000456943 E9PCH4 1651 aa24.48■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A2MP01023 1474 aa24.46■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.46■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF3BO15066 747 aa24.44■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.44■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.43■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DIP2BQ9P265 1576 aa24.43■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRPM2O94759 1503 aa24.42■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.41■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.4■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RICTORQ6R327 1708 aa24.4■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.4■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCA6Q8N139 1617 aa24.39■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CEP152O94986 1710 aa24.37■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PTPRTO14522 1441 aa24.37■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.36■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.36■■□□□ 1.49
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.35■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.35■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 USP47Q96K76 1375 aa24.35■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.35■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANP32CO43423 234 aa24.33■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.33■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.33■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.33■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.33■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.32■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC7Q96M83 1385 aa24.31■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RAPGEF3O95398 923 aa24.3■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RGL3Q3MIN7 710 aa24.3■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CLTCL1P53675 1640 aa24.3■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.29■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.28■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LAMC1P11047 1609 aa24.27■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.27■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.27■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TSPOAP1O95153 1857 aa24.26■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-201ENST00000456943 STAC3Q96MF2 364 aa24.24■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCER2I3L3R5 266 aa24.23■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF1BO60333 1816 aa24.22■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.22■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.21■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCC3O15438 1527 aa24.2■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GGT6Q6P531 493 aa24.19■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.18■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.18■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MADDQ8WXG6 1647 aa24.18■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-201ENST00000456943 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.17■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.15■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NPATQ14207 1427 aa24.14■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.11■■□□□ 1.45
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYOM2P54296 1465 aa24.09■■□□□ 1.45
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IFT172Q9UG01 1749 aa24.09■■□□□ 1.45
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 MROH2AA6NES4 1674 aa24.08■■□□□ 1.45
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADGRB3O60242 1522 aa24.08■■□□□ 1.45
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.07■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IQGAP1P46940 1657 aa24.04■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AGLP35573 1532 aa24.04■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NOS1P29475 1434 aa24.04■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-201ENST00000456943 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.03■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.02■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PIK3C2BO00750 1634 aa24.01■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.99■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-201ENST00000456943 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPLO60437 1756 aa23.98■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SYNMO15061 1565 aa23.98■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
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