RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456317.1

TTPAL-204, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 2

Gene TTPAL, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-204ENST00000456317 PRXQ9BXM0 1461 aa13.35□□□□□ -0.27
TTPAL-204ENST00000456317 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa13.33□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.32□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.32□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.3□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.29□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 GGT6Q6P531 493 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 TRIM52Q96A61 297 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPAL-204ENST00000456317 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TTPAL-204ENST00000456317 LRRC7Q96NW7 1537 aa13.27□□□□□ -0.29
TTPAL-204ENST00000456317 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
TTPAL-204ENST00000456317 KIF14Q15058 1648 aa13.26□□□□□ -0.29
TTPAL-204ENST00000456317 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.26□□□□□ -0.29
TTPAL-204ENST00000456317 SYNMO15061 1565 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-204ENST00000456317 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-204ENST00000456317 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-204ENST00000456317 CLIP1P30622 1438 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-204ENST00000456317 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-204ENST00000456317 ABCC1P33527 1531 aa13.21□□□□□ -0.29
TTPAL-204ENST00000456317 TNRQ92752 1358 aa13.2□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 IQGAP1P46940 1657 aa13.2□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.2□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.19□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.19□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 MED14O60244 1454 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.18□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 DEPDC5O75140 1603 aa13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 RXRBP28702 533 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 A2MP01023 1474 aa13.16□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.15□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.15□□□□□ -0.3
TTPAL-204ENST00000456317 PREX2Q70Z35 1606 aa13.13□□□□□ -0.31
TTPAL-204ENST00000456317 JCADQ9P266 1359 aa13.13□□□□□ -0.31
TTPAL-204ENST00000456317 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TTPAL-204ENST00000456317 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.13□□□□□ -0.31
TTPAL-204ENST00000456317 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa13.12□□□□□ -0.31
TTPAL-204ENST00000456317 ATP7AQ04656 1500 aa13.11□□□□□ -0.31
TTPAL-204ENST00000456317 PLXNC1O60486 1568 aa13.11□□□□□ -0.31
TTPAL-204ENST00000456317 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
TTPAL-204ENST00000456317 NLRP1Q9C000 1473 aa13.1□□□□□ -0.31
TTPAL-204ENST00000456317 PHLPP1O60346 1717 aa13.08□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 FMN1Q68DA7 1419 aa13.08□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 MIA2Q96PC5 1412 aa13.08□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 PZPP20742 1482 aa13.08□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.08□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa13.06□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.06□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa13.05□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.05□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.04□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13.03□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 TMEM94Q12767 1356 aa13.03□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
TTPAL-204ENST00000456317 KIF3BO15066 747 aa13.02□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 LRP6O75581 1613 aa13.02□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 SLAIN2Q9P270 581 aa12.99□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa12.98□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 MSH6P52701 1360 aa12.98□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 EID1Q9Y6B2 187 aa12.98□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.97□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 ATAD2Q6PL18 1390 aa12.97□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 AFF2P51816 1311 aa12.97□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 SPDYE2BA6NHP3 402 aa12.97□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 SPDYE6P0CI01 402 aa12.97□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 SPDYE2Q495Y8 402 aa12.97□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 RGS12O14924 1447 aa12.96□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa12.96□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 AKT1S1Q96B36 256 aa12.96□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TTPAL-204ENST00000456317 KCNA6P17658 529 aa12.95□□□□□ -0.34
TTPAL-204ENST00000456317 LTKP29376 864 aa12.95□□□□□ -0.34
TTPAL-204ENST00000456317 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TTPAL-204ENST00000456317 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms