RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 PLIN1O60240 522 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 PLEKHG5O94827 1062 aa18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 RAPGEF3O95398 923 aa18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 CDCA7LQ96GN5 454 aa18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 OSCARQ8IYS5 282 aa18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18■□□□□ 0.47
RABGEF1-210ENST00000437078 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
RABGEF1-210ENST00000437078 PZPP20742 1482 aa18■□□□□ 0.47
RABGEF1-210ENST00000437078 KANK1Q14678 1352 aa18■□□□□ 0.47
RABGEF1-210ENST00000437078 NBR1Q14596 966 aa17.99■□□□□ 0.47
RABGEF1-210ENST00000437078 NUP160Q12769 1436 aa17.99■□□□□ 0.47
RABGEF1-210ENST00000437078 NUDCQ9Y266 331 aa17.97■□□□□ 0.47
RABGEF1-210ENST00000437078 ZBED9Q6R2W3 1325 aa17.97■□□□□ 0.47
RABGEF1-210ENST00000437078 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
RABGEF1-210ENST00000437078 NLRP13Q86W25 1043 aa17.96■□□□□ 0.47
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.96■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.95■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 RALBP1Q15311 655 aa17.94■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.93■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 EXOC6Q8TAG9 804 aa17.93■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 RCAN3Q9UKA8 241 aa17.93■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 SKAP1Q86WV1 359 aa17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 POGKQ9P215 609 aa17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 SOX12O15370 315 aa17.89■□□□□ 0.46
RABGEF1-210ENST00000437078 NUTM2FA1L443 756 aa17.89■□□□□ 0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAMTS8Q9UP79 889 aa17.89■□□□□ 0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 TEX14Q8IWB6 1497 aa17.88■□□□□ 0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 MORC1Q86VD1 984 aa17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 RGS3P49796 1198 aa17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 CDCA8Q53HL2 280 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 APAF1O14727 1248 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 PODXL2Q9NZ53 605 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-210ENST00000437078 BCL2L13Q9BXK5 485 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM69CQ0P6D2 419 aa17.82■□□□□ 0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 GCC2Q8IWJ2 1684 aa17.81■□□□□ 0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 CABP2Q9NPB3 220 aa17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.79■□□□□ 0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.79■□□□□ 0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.79■□□□□ 0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.441e-6■■■□□ 15.1
RABGEF1-210ENST00000437078 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 CLUAP1Q96AJ1 413 aa17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1-210ENST00000437078 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 CRBNQ96SW2 442 aa17.77■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP2R1AP30153 589 aa17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 RRP1P56182 461 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 MBD5Q9P267 1494 aa17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 ERBINQ96RT1 1412 aa17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCA8O94911 1581 aa17.74■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 TESK2Q96S53 571 aa17.74■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 FANCAO15360 1455 aa17.73■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 PLCH2O75038 1416 aa17.73■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 ADGRL1O94910 1474 aa17.73■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa17.73■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 GGNBP2Q9H3C7 697 aa17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 CHD1O14646 1710 aa17.72■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 ZBTB7CA1YPR0 619 aa17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 TTC37Q6PGP7 1564 aa17.71■□□□□ 0.43
RABGEF1-210ENST00000437078 GOLGA2Q08379 1002 aa17.71■□□□□ 0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.7■□□□□ 0.423e-6■■□□□ 14.4
RABGEF1-210ENST00000437078 C20orf194Q5TEA3 1177 aa17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 510.4 ms