RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.59■■□□□ 1.37
CNGA3-205ENST00000436404 RAPGEF3O95398 923 aa23.57■■□□□ 1.36
CNGA3-205ENST00000436404 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.57■■□□□ 1.36
CNGA3-205ENST00000436404 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.56■■□□□ 1.36
CNGA3-205ENST00000436404 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.56■■□□□ 1.36
CNGA3-205ENST00000436404 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.55■■□□□ 1.36
CNGA3-205ENST00000436404 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CNGA3-205ENST00000436404 ABCA6Q8N139 1617 aa23.51■■□□□ 1.35
CNGA3-205ENST00000436404 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.51■■□□□ 1.35
CNGA3-205ENST00000436404 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.5■■□□□ 1.35
CNGA3-205ENST00000436404 ERBINQ96RT1 1412 aa23.49■■□□□ 1.35
CNGA3-205ENST00000436404 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CNGA3-205ENST00000436404 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.46■■□□□ 1.35
CNGA3-205ENST00000436404 UNC13BO14795 1591 aa23.46■■□□□ 1.35
CNGA3-205ENST00000436404 PZPP20742 1482 aa23.44■■□□□ 1.34
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM52Q96A61 297 aa23.43■■□□□ 1.34
CNGA3-205ENST00000436404 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.43■■□□□ 1.34
CNGA3-205ENST00000436404 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.43■■□□□ 1.34
CNGA3-205ENST00000436404 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CNGA3-205ENST00000436404 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CNGA3-205ENST00000436404 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.41■■□□□ 1.34
CNGA3-205ENST00000436404 A2MP01023 1474 aa23.41■■□□□ 1.34
CNGA3-205ENST00000436404 DEPDC5O75140 1603 aa23.41■■□□□ 1.34
CNGA3-205ENST00000436404 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.38■■□□□ 1.33
CNGA3-205ENST00000436404 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.38■■□□□ 1.33
CNGA3-205ENST00000436404 CCER2I3L3R5 266 aa23.37■■□□□ 1.33
CNGA3-205ENST00000436404 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CNGA3-205ENST00000436404 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.36■■□□□ 1.33
CNGA3-205ENST00000436404 NUP155O75694 1391 aa23.36■■□□□ 1.33
CNGA3-205ENST00000436404 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.36■■□□□ 1.33
CNGA3-205ENST00000436404 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.34■■□□□ 1.33
CNGA3-205ENST00000436404 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CNGA3-205ENST00000436404 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.32■■□□□ 1.32
CNGA3-205ENST00000436404 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.32■■□□□ 1.32
CNGA3-205ENST00000436404 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CNGA3-205ENST00000436404 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CNGA3-205ENST00000436404 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CNGA3-205ENST00000436404 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.31■■□□□ 1.32
CNGA3-205ENST00000436404 REREQ9P2R6 1566 aa23.3■■□□□ 1.32
CNGA3-205ENST00000436404 ATP10AO60312 1499 aa23.3■■□□□ 1.32
CNGA3-205ENST00000436404 KIF3BO15066 747 aa23.29■■□□□ 1.32
CNGA3-205ENST00000436404 FOXD1Q16676 465 aa23.28■■□□□ 1.32
CNGA3-205ENST00000436404 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
CNGA3-205ENST00000436404 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.24■■□□□ 1.31
CNGA3-205ENST00000436404 PKD2Q13563 968 aa23.23■■□□□ 1.31
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.23■■□□□ 1.31
CNGA3-205ENST00000436404 ANP32CO43423 234 aa23.23■■□□□ 1.31
CNGA3-205ENST00000436404 CEP152O94986 1710 aa23.22■■□□□ 1.31
CNGA3-205ENST00000436404 AGLP35573 1532 aa23.22■■□□□ 1.31
CNGA3-205ENST00000436404 TET3O43151 1660 aa23.21■■□□□ 1.31
CNGA3-205ENST00000436404 E9PCH4 1651 aa23.2■■□□□ 1.31
CNGA3-205ENST00000436404 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.18■■□□□ 1.3
CNGA3-205ENST00000436404 KANK1Q14678 1352 aa23.16■■□□□ 1.3
CNGA3-205ENST00000436404 GGT6Q6P531 493 aa23.15■■□□□ 1.3
CNGA3-205ENST00000436404 ABCC3O15438 1527 aa23.15■■□□□ 1.3
CNGA3-205ENST00000436404 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.15■■□□□ 1.3
CNGA3-205ENST00000436404 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.14■■□□□ 1.29
CNGA3-205ENST00000436404 PLA2R1Q13018 1463 aa23.13■■□□□ 1.29
CNGA3-205ENST00000436404 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CNGA3-205ENST00000436404 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CNGA3-205ENST00000436404 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.11■■□□□ 1.29
CNGA3-205ENST00000436404 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CNGA3-205ENST00000436404 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.09■■□□□ 1.29
CNGA3-205ENST00000436404 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.09■■□□□ 1.29
CNGA3-205ENST00000436404 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.05■■□□□ 1.28
CNGA3-205ENST00000436404 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.05■■□□□ 1.28
CNGA3-205ENST00000436404 PTPRTO14522 1441 aa23.05■■□□□ 1.28
CNGA3-205ENST00000436404 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CNGA3-205ENST00000436404 NPATQ14207 1427 aa23.04■■□□□ 1.28
CNGA3-205ENST00000436404 TRPM2O94759 1503 aa23.03■■□□□ 1.28
CNGA3-205ENST00000436404 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CNGA3-205ENST00000436404 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CNGA3-205ENST00000436404 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23■■□□□ 1.27
CNGA3-205ENST00000436404 TONSLQ96HA7 1378 aa22.99■■□□□ 1.27
CNGA3-205ENST00000436404 CLTCL1P53675 1640 aa22.99■■□□□ 1.27
CNGA3-205ENST00000436404 MLECQ14165 292 aa22.99■■□□□ 1.27
CNGA3-205ENST00000436404 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.99■■□□□ 1.27
CNGA3-205ENST00000436404 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.98■■□□□ 1.27
CNGA3-205ENST00000436404 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CNGA3-205ENST00000436404 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CNGA3-205ENST00000436404 NBR1Q14596 966 aa22.96■■□□□ 1.27
CNGA3-205ENST00000436404 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.95■■□□□ 1.26
CNGA3-205ENST00000436404 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.94■■□□□ 1.26
CNGA3-205ENST00000436404 NOS1P29475 1434 aa22.93■■□□□ 1.26
CNGA3-205ENST00000436404 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.93■■□□□ 1.26
CNGA3-205ENST00000436404 SYNMO15061 1565 aa22.93■■□□□ 1.26
CNGA3-205ENST00000436404 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CNGA3-205ENST00000436404 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.9■■□□□ 1.26
CNGA3-205ENST00000436404 PIK3C2BO00750 1634 aa22.9■■□□□ 1.26
CNGA3-205ENST00000436404 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CNGA3-205ENST00000436404 MROH2AA6NES4 1674 aa22.89■■□□□ 1.25
CNGA3-205ENST00000436404 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.88■■□□□ 1.25
CNGA3-205ENST00000436404 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.88■■□□□ 1.25
CNGA3-205ENST00000436404 KIF1BO60333 1816 aa22.87■■□□□ 1.25
CNGA3-205ENST00000436404 ERVK-7P63135 1459 aa22.86■■□□□ 1.25
CNGA3-205ENST00000436404 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.85■■□□□ 1.25
CNGA3-205ENST00000436404 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms