RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426677.6

TOMM40-203, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-203ENST00000426677 DEPDC5O75140 1603 aa35.6■■■■□ 3.29
TOMM40-203ENST00000426677 KIF3BO15066 747 aa35.59■■■■□ 3.29
TOMM40-203ENST00000426677 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
TOMM40-203ENST00000426677 TRIM52Q96A61 297 aa35.53■■■■□ 3.28
TOMM40-203ENST00000426677 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.52■■■■□ 3.28
TOMM40-203ENST00000426677 AGLP35573 1532 aa35.51■■■■□ 3.27
TOMM40-203ENST00000426677 PZPP20742 1482 aa35.5■■■■□ 3.27
TOMM40-203ENST00000426677 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
TOMM40-203ENST00000426677 CEP152O94986 1710 aa35.48■■■■□ 3.27
TOMM40-203ENST00000426677 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.46■■■■□ 3.27
TOMM40-203ENST00000426677 NUP155O75694 1391 aa35.46■■■■□ 3.27
TOMM40-203ENST00000426677 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.46■■■■□ 3.27
TOMM40-203ENST00000426677 GGT6Q6P531 493 aa35.46■■■■□ 3.27
TOMM40-203ENST00000426677 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
TOMM40-203ENST00000426677 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.44■■■■□ 3.26
TOMM40-203ENST00000426677 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.43■■■■□ 3.26
TOMM40-203ENST00000426677 MLECQ14165 292 aa35.42■■■■□ 3.26
TOMM40-203ENST00000426677 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
TOMM40-203ENST00000426677 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.35■■■■□ 3.25
TOMM40-203ENST00000426677 FOXD1Q16676 465 aa35.35■■■■□ 3.25
TOMM40-203ENST00000426677 ABCC3O15438 1527 aa35.33■■■■□ 3.25
TOMM40-203ENST00000426677 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
TOMM40-203ENST00000426677 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
TOMM40-203ENST00000426677 E9PCH4 1651 aa35.3■■■■□ 3.24
TOMM40-203ENST00000426677 TET3O43151 1660 aa35.3■■■■□ 3.24
TOMM40-203ENST00000426677 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.28■■■■□ 3.24
TOMM40-203ENST00000426677 KANK1Q14678 1352 aa35.27■■■■□ 3.24
TOMM40-203ENST00000426677 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
TOMM40-203ENST00000426677 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
TOMM40-203ENST00000426677 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.24■■■■□ 3.23
TOMM40-203ENST00000426677 PKD2Q13563 968 aa35.24■■■■□ 3.23
TOMM40-203ENST00000426677 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.23■■■■□ 3.23
TOMM40-203ENST00000426677 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.23■■■■□ 3.23
TOMM40-203ENST00000426677 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.22■■■■□ 3.23
TOMM40-203ENST00000426677 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.19■■■■□ 3.22
TOMM40-203ENST00000426677 MADDQ8WXG6 1647 aa35.17■■■■□ 3.22
TOMM40-203ENST00000426677 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
TOMM40-203ENST00000426677 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.15■■■■□ 3.22
TOMM40-203ENST00000426677 NPATQ14207 1427 aa35.13■■■■□ 3.21
TOMM40-203ENST00000426677 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
TOMM40-203ENST00000426677 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.1■■■■□ 3.21
TOMM40-203ENST00000426677 PLA2R1Q13018 1463 aa35.1■■■■□ 3.21
TOMM40-203ENST00000426677 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.07■■■■□ 3.2
TOMM40-203ENST00000426677 MROH2AA6NES4 1674 aa35.06■■■■□ 3.2
TOMM40-203ENST00000426677 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.06■■■■□ 3.2
TOMM40-203ENST00000426677 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.06■■■■□ 3.2
TOMM40-203ENST00000426677 C3P01024 1663 aa35.05■■■■□ 3.2
TOMM40-203ENST00000426677 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.05■■■■□ 3.2
TOMM40-203ENST00000426677 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.02■■■■□ 3.2
TOMM40-203ENST00000426677 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.02■■■■□ 3.2
TOMM40-203ENST00000426677 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
TOMM40-203ENST00000426677 ZMYM3Q14202 1370 aa35.01■■■■□ 3.19
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TOMM40-203ENST00000426677 SYNMO15061 1565 aa35■■■■□ 3.19
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TOMM40-203ENST00000426677 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.96■■■■□ 3.19
TOMM40-203ENST00000426677 CLTCL1P53675 1640 aa34.96■■■■□ 3.19
TOMM40-203ENST00000426677 TRPM2O94759 1503 aa34.96■■■■□ 3.19
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TOMM40-203ENST00000426677 ERVK-7P63135 1459 aa34.94■■■■□ 3.18
TOMM40-203ENST00000426677 NOS1P29475 1434 aa34.93■■■■□ 3.18
TOMM40-203ENST00000426677 NEUROD1Q13562 356 aa34.92■■■■□ 3.18
TOMM40-203ENST00000426677 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.9■■■■□ 3.18
TOMM40-203ENST00000426677 PIK3C2BO00750 1634 aa34.86■■■■□ 3.17
TOMM40-203ENST00000426677 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.85■■■■□ 3.17
TOMM40-203ENST00000426677 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.83■■■■□ 3.17
TOMM40-203ENST00000426677 PTPRMP28827 1452 aa34.81■■■■□ 3.16
TOMM40-203ENST00000426677 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.8■■■■□ 3.16
TOMM40-203ENST00000426677 KIF1BO60333 1816 aa34.77■■■■□ 3.16
TOMM40-203ENST00000426677 TNRQ92752 1358 aa34.73■■■■□ 3.15
TOMM40-203ENST00000426677 IDI1Q13907 227 aa34.72■■■■□ 3.15
TOMM40-203ENST00000426677 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.69■■■■□ 3.14
TOMM40-203ENST00000426677 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.69■■■■□ 3.14
TOMM40-203ENST00000426677 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.67■■■■□ 3.14
TOMM40-203ENST00000426677 ADGRB3O60242 1522 aa34.67■■■■□ 3.14
TOMM40-203ENST00000426677 RGL3Q3MIN7 710 aa34.65■■■■□ 3.14
TOMM40-203ENST00000426677 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
TOMM40-203ENST00000426677 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.61■■■■□ 3.13
TOMM40-203ENST00000426677 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.61■■■■□ 3.13
TOMM40-203ENST00000426677 TONSLQ96HA7 1378 aa34.61■■■■□ 3.13
TOMM40-203ENST00000426677 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.61■■■■□ 3.13
TOMM40-203ENST00000426677 IFT172Q9UG01 1749 aa34.58■■■■□ 3.13
TOMM40-203ENST00000426677 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
TOMM40-203ENST00000426677 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.55■■■■□ 3.12
TOMM40-203ENST00000426677 NLRP1Q9C000 1473 aa34.55■■■■□ 3.12
TOMM40-203ENST00000426677 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.54■■■■□ 3.12
TOMM40-203ENST00000426677 PPLO60437 1756 aa34.53■■■■□ 3.12
TOMM40-203ENST00000426677 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
TOMM40-203ENST00000426677 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
TOMM40-203ENST00000426677 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
TOMM40-203ENST00000426677 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
TOMM40-203ENST00000426677 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa34.49■■■■□ 3.11
TOMM40-203ENST00000426677 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
TOMM40-203ENST00000426677 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.47■■■■□ 3.11
TOMM40-203ENST00000426677 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.47■■■■□ 3.11
TOMM40-203ENST00000426677 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
TOMM40-203ENST00000426677 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.47■■■■□ 3.11
TOMM40-203ENST00000426677 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.45■■■■□ 3.11
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