RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424529.6

VGLL4-208, Transcript of vestigial like family member 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene VGLL4, Length 1,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VGLL4-208	ENST00000424529	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.96	■■■□□ 2.87
VGLL4-208	ENST00000424529	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.96	■■■□□ 2.87
VGLL4-208	ENST00000424529	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.95	■■■□□ 2.87
VGLL4-208	ENST00000424529	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.95	■■■□□ 2.87
VGLL4-208	ENST00000424529	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
VGLL4-208	ENST00000424529	C3	P01024	1663 aa		32.94	■■■□□ 2.86
VGLL4-208	ENST00000424529	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.92	■■■□□ 2.86
VGLL4-208	ENST00000424529	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
VGLL4-208	ENST00000424529	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
VGLL4-208	ENST00000424529	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.87	■■■□□ 2.85
VGLL4-208	ENST00000424529	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.87	■■■□□ 2.85
VGLL4-208	ENST00000424529	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
VGLL4-208	ENST00000424529	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.84	■■■□□ 2.85
VGLL4-208	ENST00000424529	ABCC3	O15438	1527 aa		32.82	■■■□□ 2.84
VGLL4-208	ENST00000424529	ITGAE	P38570	1179 aa		32.81	■■■□□ 2.84
VGLL4-208	ENST00000424529	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.8	■■■□□ 2.84
VGLL4-208	ENST00000424529	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.8	■■■□□ 2.84
VGLL4-208	ENST00000424529	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.79	■■■□□ 2.84
VGLL4-208	ENST00000424529	NPAT	Q14207	1427 aa		32.79	■■■□□ 2.84
VGLL4-208	ENST00000424529	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.79	■■■□□ 2.84
VGLL4-208	ENST00000424529	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
VGLL4-208	ENST00000424529	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
VGLL4-208	ENST00000424529	PZP	P20742	1482 aa		32.74	■■■□□ 2.83
VGLL4-208	ENST00000424529	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.71	■■■□□ 2.83
VGLL4-208	ENST00000424529	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.71	■■■□□ 2.83
VGLL4-208	ENST00000424529	CEP152	O94986	1710 aa		32.69	■■■□□ 2.82
VGLL4-208	ENST00000424529	NAIP	Q13075	1403 aa		32.68	■■■□□ 2.82
VGLL4-208	ENST00000424529	UNC13B	O14795	1591 aa		32.67	■■■□□ 2.82
VGLL4-208	ENST00000424529	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.67	■■■□□ 2.82
VGLL4-208	ENST00000424529	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
VGLL4-208	ENST00000424529	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.66	■■■□□ 2.82
VGLL4-208	ENST00000424529	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.65	■■■□□ 2.82	5e-6	■□□□□ 11.2
VGLL4-208	ENST00000424529	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.63	■■■□□ 2.81
VGLL4-208	ENST00000424529	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.63	■■■□□ 2.81
VGLL4-208	ENST00000424529	KANK1	Q14678	1352 aa		32.62	■■■□□ 2.81
VGLL4-208	ENST00000424529	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.6	■■■□□ 2.81
VGLL4-208	ENST00000424529	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.6	■■■□□ 2.81
VGLL4-208	ENST00000424529	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.57	■■■□□ 2.8
VGLL4-208	ENST00000424529	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.56	■■■□□ 2.8
VGLL4-208	ENST00000424529	HSPA2	P54652	639 aa		32.56	■■■□□ 2.8
VGLL4-208	ENST00000424529	TNR	Q92752	1358 aa		32.56	■■■□□ 2.8
VGLL4-208	ENST00000424529	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.54	■■■□□ 2.8
VGLL4-208	ENST00000424529	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
VGLL4-208	ENST00000424529	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.52	■■■□□ 2.8
VGLL4-208	ENST00000424529	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
VGLL4-208	ENST00000424529	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
VGLL4-208	ENST00000424529	TET3	O43151	1660 aa		32.49	■■■□□ 2.79
VGLL4-208	ENST00000424529	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.48	■■■□□ 2.79
VGLL4-208	ENST00000424529	NUP155	O75694	1391 aa		32.46	■■■□□ 2.79
VGLL4-208	ENST00000424529	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
VGLL4-208	ENST00000424529	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.46	■■■□□ 2.79
VGLL4-208	ENST00000424529	NOS1	P29475	1434 aa		32.45	■■■□□ 2.79
VGLL4-208	ENST00000424529	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
VGLL4-208	ENST00000424529	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.4	■■■□□ 2.78
VGLL4-208	ENST00000424529		E9PCH4	1651 aa		32.39	■■■□□ 2.78
VGLL4-208	ENST00000424529	SYNM	O15061	1565 aa		32.38	■■■□□ 2.77
VGLL4-208	ENST00000424529	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.35	■■■□□ 2.77
VGLL4-208	ENST00000424529	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.32	■■■□□ 2.76
VGLL4-208	ENST00000424529	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.32	■■■□□ 2.76
VGLL4-208	ENST00000424529	IDI1	Q13907	227 aa		32.28	■■■□□ 2.76
VGLL4-208	ENST00000424529	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.27	■■■□□ 2.76
VGLL4-208	ENST00000424529	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.26	■■■□□ 2.75
VGLL4-208	ENST00000424529	PTPRT	O14522	1441 aa		32.26	■■■□□ 2.75
VGLL4-208	ENST00000424529	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
VGLL4-208	ENST00000424529	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.25	■■■□□ 2.75
VGLL4-208	ENST00000424529	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
VGLL4-208	ENST00000424529	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.22	■■■□□ 2.75
VGLL4-208	ENST00000424529	PKD2	Q13563	968 aa		32.21	■■■□□ 2.75
VGLL4-208	ENST00000424529	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.21	■■■□□ 2.75
VGLL4-208	ENST00000424529	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.2	■■■□□ 2.75
VGLL4-208	ENST00000424529	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.19	■■■□□ 2.74
VGLL4-208	ENST00000424529	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
VGLL4-208	ENST00000424529	SLIT1	O75093	1534 aa		32.18	■■■□□ 2.74
VGLL4-208	ENST00000424529	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.17	■■■□□ 2.74
VGLL4-208	ENST00000424529	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.16	■■■□□ 2.74
VGLL4-208	ENST00000424529	HRC	P23327	699 aa		32.16	■■■□□ 2.74
VGLL4-208	ENST00000424529	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.16	■■■□□ 2.74
VGLL4-208	ENST00000424529	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
VGLL4-208	ENST00000424529	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.14	■■■□□ 2.74
VGLL4-208	ENST00000424529	MED14	O60244	1454 aa		32.13	■■■□□ 2.73
VGLL4-208	ENST00000424529	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.11	■■■□□ 2.73
VGLL4-208	ENST00000424529	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.11	■■■□□ 2.73
VGLL4-208	ENST00000424529	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.11	■■■□□ 2.73
VGLL4-208	ENST00000424529	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.11	■■■□□ 2.73
VGLL4-208	ENST00000424529	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
VGLL4-208	ENST00000424529	TRPM2	O94759	1503 aa		32.1	■■■□□ 2.73
VGLL4-208	ENST00000424529	LTK	P29376	864 aa		32.07	■■■□□ 2.72
VGLL4-208	ENST00000424529	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
VGLL4-208	ENST00000424529	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.03	■■■□□ 2.72
VGLL4-208	ENST00000424529	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.02	■■■□□ 2.72
VGLL4-208	ENST00000424529	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.02	■■■□□ 2.72
VGLL4-208	ENST00000424529	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.02	■■■□□ 2.72
VGLL4-208	ENST00000424529	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
VGLL4-208	ENST00000424529	FOXD1	Q16676	465 aa		32.01	■■■□□ 2.71
VGLL4-208	ENST00000424529	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		31.99	■■■□□ 2.71
VGLL4-208	ENST00000424529	IQGAP1	P46940	1657 aa		31.95	■■■□□ 2.71
VGLL4-208	ENST00000424529	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.94	■■■□□ 2.7
VGLL4-208	ENST00000424529	EID1	Q9Y6B2	187 aa		31.93	■■■□□ 2.7
VGLL4-208	ENST00000424529	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		31.92	■■■□□ 2.7
VGLL4-208	ENST00000424529	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms